More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0270 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2782  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  82.65 
 
 
392 aa  679    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.133795  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0270  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
391 aa  804    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00178908  normal  0.140204 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2763  putative SCP-x_thiolase/acetyl- CoA acetyltransferase, PaaJ-like  36.87 
 
 
400 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.470356  normal  0.471158 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3981  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.74 
 
 
385 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.480226  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1484  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  37.19 
 
 
383 aa  186  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  35.81 
 
 
388 aa  184  3e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  33.16 
 
 
390 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.71 
 
 
387 aa  178  1e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0386  acetyl-CoA acetyltransferase  34.69 
 
 
387 aa  178  1e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2644  acetyl-CoA acetyltransferase  34.11 
 
 
391 aa  177  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000531608  normal  0.301355 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  32.64 
 
 
391 aa  177  2e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  33.7 
 
 
388 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  34.51 
 
 
387 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2841  acetyl-CoA acetyltransferase  33.85 
 
 
392 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  33.59 
 
 
387 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1437  acetyl-CoA acetyltransferase  33.51 
 
 
392 aa  173  5e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544817  normal  0.0152215 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2734  acetyl-CoA acetyltransferase  35.2 
 
 
388 aa  172  6.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2781  acetyl-CoA acetyltransferase  32.5 
 
 
381 aa  172  9e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0753576  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  32.61 
 
 
390 aa  170  4e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  34.07 
 
 
387 aa  167  2e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  33.42 
 
 
388 aa  168  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  33.33 
 
 
386 aa  168  2e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0675  Beta-ketoacyl synthase  32.87 
 
 
395 aa  166  9e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0396  acetyl-CoA acetyltransferase  33.52 
 
 
396 aa  164  2.0000000000000002e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3092  acetyl-CoA acetyltransferase  33.79 
 
 
393 aa  163  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1536  acetyl-CoA acetyltransferase  34.5 
 
 
398 aa  162  7e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3820  acetyl-CoA acetyltransferase  33.77 
 
 
391 aa  162  9e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5222  acetyl-CoA acetyltransferase  34.89 
 
 
391 aa  161  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.64162  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1277  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.98 
 
 
397 aa  160  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2242  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.62 
 
 
389 aa  159  7e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3319  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.72 
 
 
384 aa  158  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16037  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5018  acetyl-CoA acetyltransferase  34.81 
 
 
392 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4636  acetyl-CoA acetyltransferase  34.81 
 
 
392 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4724  acetyl-CoA acetyltransferase  34.81 
 
 
392 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3523  3-ketoacyl-CoA thiolase  31.96 
 
 
384 aa  157  4e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1711  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.35 
 
 
386 aa  155  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3786  acetyl-CoA acetyltransferase  30.61 
 
 
389 aa  153  5e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00704604  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2284  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.24 
 
 
383 aa  153  7e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0131646  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4153  thiolase family protein  32.32 
 
 
387 aa  151  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  31.71 
 
 
387 aa  152  1e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3966  propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.79 
 
 
392 aa  151  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.238561  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13556  acetyl-CoA acetyltransferase  33.52 
 
 
394 aa  150  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148092 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  31.77 
 
 
387 aa  150  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  31.61 
 
 
388 aa  150  6e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  30.73 
 
 
390 aa  149  7e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3070  acetyl-CoA acetyltransferase  31.97 
 
 
400 aa  149  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.430335 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0271  acetyl-CoA acetyltransferase  29.94 
 
 
372 aa  147  2.0000000000000003e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00147493  normal  0.0721656 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1290  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  28.98 
 
 
378 aa  147  3e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6295  thiolase  31.68 
 
 
392 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  29.17 
 
 
388 aa  145  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0021  acetyl-CoA acetyltransferase  31.09 
 
 
394 aa  144  2e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1460  acetyl-CoA acetyltransferase  30.81 
 
 
392 aa  143  5e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4151  thiolase  32.51 
 
 
386 aa  143  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0527  acetyl-CoA acetyltransferase  30.25 
 
 
392 aa  143  6e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.191077  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1551  acetyl-CoA acetyltransferase  31.76 
 
 
404 aa  142  7e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0378  acetyl-CoA acetyltransferase  30.25 
 
 
392 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.855021  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  31.66 
 
 
384 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0628  putative nonspecific lipid-transfer protein (sterol carrier protein)  31.23 
 
 
386 aa  139  7e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1631  propanoyl-CoA C-acyltransferase  28.17 
 
 
387 aa  139  7.999999999999999e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.92 
 
 
392 aa  139  8.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.92 
 
 
392 aa  138  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0941  lipid-transfer protein  31.5 
 
 
398 aa  138  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.303203  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  30.38 
 
 
394 aa  138  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2338  lipid-transfer protein  31.12 
 
 
396 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544781 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0558  thiolase  29.46 
 
 
407 aa  137  4e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.31 
 
 
392 aa  136  5e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3733  thiolase  29.8 
 
 
380 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.454317  normal  0.374229 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3660  thiolase  29.8 
 
 
380 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.277113  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0459  acetyl-CoA acetyltransferase  29.41 
 
 
392 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221902  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3673  thiolase  29.8 
 
 
380 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.217678  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2810  Thiolase  28.93 
 
 
388 aa  134  3e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0349733  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0597  Thiolase  29.79 
 
 
387 aa  133  5e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3907  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.12 
 
 
381 aa  133  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114937  normal  0.102476 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2160  acetyl-CoA acetyltransferase  29.73 
 
 
389 aa  132  7.999999999999999e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1472  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  27 
 
 
417 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12803  lipid-transfer protein  30.26 
 
 
401 aa  132  9e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00155026  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2477  3-ketoacyl-CoA thiolase  28.43 
 
 
388 aa  131  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5768  lipid-transfer protein  29.44 
 
 
397 aa  130  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  30.56 
 
 
383 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0841  propanoyl-CoA C-acyltransferase  27.09 
 
 
371 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000470716 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2025  lipid-transfer protein  29.07 
 
 
395 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.957629  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2056  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  28.96 
 
 
398 aa  129  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0124165  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2105  thiolase  29.89 
 
 
404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0715913  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2713  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  28.53 
 
 
394 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00447624  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3314  thiolase  30.25 
 
 
404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3567  putative thiolase  29.25 
 
 
378 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3781  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  26.51 
 
 
388 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000395838  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2721  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.61 
 
 
395 aa  126  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4354  thiolase  30.33 
 
 
387 aa  126  7e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0510  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  27.2 
 
 
376 aa  125  1e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4130  hypothetical protein  29.21 
 
 
384 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.468644 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6744  acetyl-CoA acetyltransferase  28.61 
 
 
388 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.207207  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3239  acetyl-CoA acetyltransferase  31.04 
 
 
398 aa  125  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.672752  normal  0.733298 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4195  Thiolase  34.63 
 
 
390 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0815171  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5103  lipid-transfer protein  29.29 
 
 
393 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2916  acetyl-CoA acetyltransferase  35.68 
 
 
400 aa  125  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.614429  normal  0.0144444 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4139  thiolase  27.76 
 
 
388 aa  124  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.948206  normal  0.281398 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4345  thiolase  30.23 
 
 
381 aa  123  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.46112  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1529  thiolase  27.37 
 
 
390 aa  123  6e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.380974 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0932  lipid-transfer protein  28.27 
 
 
393 aa  122  8e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>