More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3956 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2160  acetyl-CoA acetyltransferase  84.75 
 
 		 389 aa  693    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2101  acetyl-CoA acetyltransferase  96.4 
 
 		 389 aa  753    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0474037  hitchhiker  0.00217907 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3100  acetyl-CoA acetyltransferase  88.69 
 
 		 388 aa  689    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.514057  normal  0.0765503 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3318  acetyl-CoA acetyltransferase  95.89 
 
 		 389 aa  748    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2560  acetyl-CoA acetyltransferase  85.35 
 
 		 389 aa  701    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.800348  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3956  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 389 aa  798    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3558  acetyl-CoA acetyltransferase  88.43 
 
 		 389 aa  702    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6598  acetyl-CoA acetyltransferase  79.43 
 
 		 388 aa  640    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.611085  normal  0.124058 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6744  acetyl-CoA acetyltransferase  78.92 
 
 		 388 aa  639    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.207207  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1384  acetyl-CoA acetyltransferase  64.34 
 
 		 395 aa  505  9.999999999999999e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2397  acetyl-CoA acetyltransferase  63.64 
 
 		 389 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5670  acetyl-CoA acetyltransferase  61.5 
 
 		 389 aa  489  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3505  acetyl-CoA acetyltransferase  61.5 
 
 		 389 aa  483  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2370  acetyl-CoA acetyltransferase  60.26 
 
 		 392 aa  477  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0689  acetyl-CoA acetyltransferase  59.9 
 
 		 389 aa  476  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1439  acetyl-CoA acetyltransferase  63.82 
 
 		 389 aa  468  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.557152  decreased coverage  0.000000285125 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3077  acetyl-CoA acetyltransferase  58.91 
 
 		 389 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2462  acetyl-CoA acetyltransferase  58.87 
 
 		 388 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4922  acetyl-CoA acetyltransferase  58.85 
 
 		 386 aa  461  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6077  acetyl-CoA acetyltransferase  58.51 
 
 		 390 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3283  acetyl-CoA acetyltransferase  58.03 
 
 		 388 aa  449  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4819  acetyl-CoA acetyltransferase  57.92 
 
 		 389 aa  447  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.098551  normal  0.333333 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1335  acetyl-CoA acetyltransferase  56.22 
 
 		 460 aa  432  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0489  acetyl-CoA acetyltransferase  56.54 
 
 		 394 aa  422  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201568  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0646  acetyl-CoA acetyltransferase  55.32 
 
 		 397 aa  415  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18950  acetyl-CoA acetyltransferase  53.93 
 
 		 395 aa  414  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0500553  normal  0.490702 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2244  acetyl-CoA acetyltransferase  58.9 
 
 		 388 aa  404  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.106872  normal  0.0160959 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2502  acetyl-CoA acetyltransferase  58.9 
 
 		 394 aa  404  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.845953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22240  acetyl-CoA acetyltransferase  52.47 
 
 		 392 aa  397  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.392978  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3272  acetyl-CoA acetyltransferase  52.07 
 
 		 386 aa  380  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  37.67 
 
 		 387 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  35.75 
 
 		 388 aa  220  3.9999999999999997e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0675  Beta-ketoacyl synthase  37.53 
 
 		 395 aa  219  7e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  37.02 
 
 		 390 aa  216  8e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  35.23 
 
 		 386 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1437  acetyl-CoA acetyltransferase  38.57 
 
 		 392 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544817  normal  0.0152215 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  36.15 
 
 		 391 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  34.79 
 
 		 387 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  35.29 
 
 		 390 aa  212  1e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  34.72 
 
 		 388 aa  211  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4354  thiolase  36.41 
 
 		 387 aa  211  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  35.64 
 
 		 390 aa  209  9e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  36.29 
 
 		 387 aa  206  5e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  35.66 
 
 		 388 aa  204  2e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  35.19 
 
 		 394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0597  Thiolase  36.18 
 
 		 387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0396  acetyl-CoA acetyltransferase  35.2 
 
 		 396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.44 
 
 		 392 aa  200  3.9999999999999996e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1006  Thiolase  35.66 
 
 		 388 aa  197  3e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.63654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2713  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.46 
 
 		 394 aa  195  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00447624  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0896  Thiolase  34.55 
 
 		 388 aa  194  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3781  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.68 
 
 		 388 aa  191  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000395838  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2056  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.25 
 
 		 398 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0124165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.08 
 
 		 392 aa  189  8e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0459  acetyl-CoA acetyltransferase  35.03 
 
 		 392 aa  188  1e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0900  acetyl-CoA acetyltransferase  36.44 
 
 		 407 aa  186  8e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.56 
 
 		 392 aa  186  8e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2477  3-ketoacyl-CoA thiolase  34.29 
 
 		 388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1460  acetyl-CoA acetyltransferase  34.76 
 
 		 392 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0378  acetyl-CoA acetyltransferase  34.58 
 
 		 392 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.855021  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1631  propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.55 
 
 		 387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0527  acetyl-CoA acetyltransferase  34.87 
 
 		 392 aa  183  6e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.191077  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  35.88 
 
 		 383 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1290  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.68 
 
 		 378 aa  181  2e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1277  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.73 
 
 		 397 aa  179  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2810  Thiolase  33.5 
 
 		 388 aa  178  1e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0349733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5352  acetyl-CoA acetyltransferase  36.84 
 
 		 398 aa  178  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57271  normal  0.485306 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  35.62 
 
 		 387 aa  177  2e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2242  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.23 
 
 		 389 aa  177  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.83 
 
 		 387 aa  176  6e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1546  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.11 
 
 		 401 aa  176  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0114827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2284  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.71 
 
 		 383 aa  175  9.999999999999999e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0131646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  32.94 
 
 		 388 aa  173  5e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3070  acetyl-CoA acetyltransferase  33.42 
 
 		 400 aa  172  5.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.430335 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1551  acetyl-CoA acetyltransferase  31.75 
 
 		 404 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2721  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.57 
 
 		 395 aa  172  7.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12803  lipid-transfer protein  32.38 
 
 		 401 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00155026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  33.16 
 
 		 387 aa  172  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3319  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.47 
 
 		 384 aa  172  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16037  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4195  Thiolase  32.35 
 
 		 390 aa  171  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0815171  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1711  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.39 
 
 		 386 aa  170  4e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3523  3-ketoacyl-CoA thiolase  31.88 
 
 		 384 aa  168  2e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0510  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33 
 
 		 376 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1270  acetyl-CoA acetyltransferase  34.25 
 
 		 406 aa  167  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143492  hitchhiker  0.00783632 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1808  acetyl-CoA acetyltransferase  34.93 
 
 		 406 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.286028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4151  thiolase  32.41 
 
 		 386 aa  166  8e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4939  acetyl-CoA acetyltransferase  34.22 
 
 		 405 aa  166  8e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01223 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1838  thiolase  31.93 
 
 		 413 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0021  acetyl-CoA acetyltransferase  33.14 
 
 		 394 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3986  lipid-transfer protein  35.89 
 
 		 394 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3239  acetyl-CoA acetyltransferase  33.5 
 
 		 398 aa  163  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.672752  normal  0.733298 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4153  thiolase family protein  32.32 
 
 		 387 aa  162  9e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6295  thiolase  32.47 
 
 		 392 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5768  lipid-transfer protein  33.59 
 
 		 397 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10932  acetyl-CoA acetyltransferase  31 
 
 		 412 aa  159  6e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2025  lipid-transfer protein  31.59 
 
 		 395 aa  159  7e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.957629  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4757  lipid-transfer protein  35.44 
 
 		 395 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2916  acetyl-CoA acetyltransferase  34.91 
 
 		 400 aa  158  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.614429  normal  0.0144444 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4694  lipid-transfer protein  32.25 
 
 		 406 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1855  acetyl-CoA acetyltransferase  33.67 
 
 		 401 aa  156  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0446253  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>