More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3100 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2160  acetyl-CoA acetyltransferase  82.52 
 
 		 389 aa  684    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2101  acetyl-CoA acetyltransferase  87.4 
 
 		 389 aa  688    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0474037  hitchhiker  0.00217907 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3956  acetyl-CoA acetyltransferase  88.69 
 
 		 389 aa  719    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3100  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 388 aa  794    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.514057  normal  0.0765503 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3558  acetyl-CoA acetyltransferase  83.55 
 
 		 389 aa  674    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3318  acetyl-CoA acetyltransferase  88.17 
 
 		 389 aa  696    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2560  acetyl-CoA acetyltransferase  84.32 
 
 		 389 aa  690    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.800348  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6744  acetyl-CoA acetyltransferase  77.98 
 
 		 388 aa  629  1e-179  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.207207  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6598  acetyl-CoA acetyltransferase  77.98 
 
 		 388 aa  625  1e-178  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.611085  normal  0.124058 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1384  acetyl-CoA acetyltransferase  64.32 
 
 		 395 aa  504  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5670  acetyl-CoA acetyltransferase  63.57 
 
 		 389 aa  499  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2397  acetyl-CoA acetyltransferase  64.16 
 
 		 389 aa  497  1e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0689  acetyl-CoA acetyltransferase  61.24 
 
 		 389 aa  480  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2370  acetyl-CoA acetyltransferase  60.78 
 
 		 392 aa  478  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3505  acetyl-CoA acetyltransferase  60.21 
 
 		 389 aa  476  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3077  acetyl-CoA acetyltransferase  59.64 
 
 		 389 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4922  acetyl-CoA acetyltransferase  59.38 
 
 		 386 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2462  acetyl-CoA acetyltransferase  58.1 
 
 		 388 aa  457  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6077  acetyl-CoA acetyltransferase  58.7 
 
 		 390 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1439  acetyl-CoA acetyltransferase  61.72 
 
 		 389 aa  449  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.557152  decreased coverage  0.000000285125 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3283  acetyl-CoA acetyltransferase  56.99 
 
 		 388 aa  444  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4819  acetyl-CoA acetyltransferase  58.64 
 
 		 389 aa  443  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.098551  normal  0.333333 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1335  acetyl-CoA acetyltransferase  54.92 
 
 		 460 aa  423  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0489  acetyl-CoA acetyltransferase  56.02 
 
 		 394 aa  422  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201568  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0646  acetyl-CoA acetyltransferase  55.06 
 
 		 397 aa  416  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18950  acetyl-CoA acetyltransferase  52.36 
 
 		 395 aa  402  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0500553  normal  0.490702 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2244  acetyl-CoA acetyltransferase  56.36 
 
 		 388 aa  392  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.106872  normal  0.0160959 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2502  acetyl-CoA acetyltransferase  56.36 
 
 		 394 aa  392  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.845953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22240  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 		 392 aa  377  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.392978  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3272  acetyl-CoA acetyltransferase  52.07 
 
 		 386 aa  376  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  38.42 
 
 		 390 aa  224  3e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  38.73 
 
 		 387 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  37.31 
 
 		 388 aa  223  6e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  36.46 
 
 		 390 aa  219  7e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  36.53 
 
 		 386 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0675  Beta-ketoacyl synthase  36.8 
 
 		 395 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  35.82 
 
 		 387 aa  212  1e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  36.15 
 
 		 391 aa  211  2e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  35.49 
 
 		 388 aa  210  3e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1437  acetyl-CoA acetyltransferase  37.34 
 
 		 392 aa  210  4e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544817  normal  0.0152215 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4354  thiolase  37.18 
 
 		 387 aa  209  6e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  36.15 
 
 		 390 aa  207  2e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  35.31 
 
 		 388 aa  201  9.999999999999999e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  36.29 
 
 		 387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0396  acetyl-CoA acetyltransferase  35.35 
 
 		 396 aa  196  6e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0896  Thiolase  34.97 
 
 		 388 aa  194  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  34.34 
 
 		 394 aa  193  4e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.1 
 
 		 392 aa  193  4e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1006  Thiolase  35.57 
 
 		 388 aa  193  5e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.63654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0597  Thiolase  35.07 
 
 		 387 aa  193  5e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0459  acetyl-CoA acetyltransferase  36.36 
 
 		 392 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1460  acetyl-CoA acetyltransferase  36.63 
 
 		 392 aa  188  1e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2713  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.2 
 
 		 394 aa  189  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00447624  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2056  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.93 
 
 		 398 aa  185  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0124165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0378  acetyl-CoA acetyltransferase  35.66 
 
 		 392 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.855021  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1631  propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.77 
 
 		 387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2477  3-ketoacyl-CoA thiolase  34.55 
 
 		 388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3781  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.42 
 
 		 388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000395838  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0900  acetyl-CoA acetyltransferase  36.51 
 
 		 407 aa  181  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.18 
 
 		 392 aa  181  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.18 
 
 		 392 aa  181  2.9999999999999997e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0527  acetyl-CoA acetyltransferase  35.73 
 
 		 392 aa  180  4.999999999999999e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.191077  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1277  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.32 
 
 		 397 aa  179  8e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2242  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.82 
 
 		 389 aa  177  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  35.62 
 
 		 383 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3319  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.03 
 
 		 384 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16037  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1711  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.71 
 
 		 386 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3070  acetyl-CoA acetyltransferase  34.25 
 
 		 400 aa  170  5e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.430335 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  35.57 
 
 		 387 aa  169  1e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2810  Thiolase  33.76 
 
 		 388 aa  168  1e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0349733  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3523  3-ketoacyl-CoA thiolase  32.82 
 
 		 384 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2284  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.04 
 
 		 383 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0131646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5352  acetyl-CoA acetyltransferase  35.93 
 
 		 398 aa  167  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57271  normal  0.485306 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1551  acetyl-CoA acetyltransferase  31.58 
 
 		 404 aa  166  5e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4195  Thiolase  32.98 
 
 		 390 aa  166  5.9999999999999996e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0815171  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0021  acetyl-CoA acetyltransferase  34.77 
 
 		 394 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  34.01 
 
 		 387 aa  166  9e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1546  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.72 
 
 		 401 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0114827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  32.87 
 
 		 388 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1290  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.03 
 
 		 378 aa  163  4.0000000000000004e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4153  thiolase family protein  33.33 
 
 		 387 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2721  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.93 
 
 		 395 aa  162  6e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  28.94 
 
 		 387 aa  161  1e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4939  acetyl-CoA acetyltransferase  33.59 
 
 		 405 aa  159  7e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01223 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1838  thiolase  32.12 
 
 		 413 aa  159  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4151  thiolase  31.28 
 
 		 386 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10932  acetyl-CoA acetyltransferase  32.9 
 
 		 412 aa  158  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1808  acetyl-CoA acetyltransferase  33.59 
 
 		 406 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.286028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3986  lipid-transfer protein  33.96 
 
 		 394 aa  158  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12803  lipid-transfer protein  31.31 
 
 		 401 aa  157  4e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00155026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3239  acetyl-CoA acetyltransferase  32.51 
 
 		 398 aa  156  5.0000000000000005e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.672752  normal  0.733298 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6295  thiolase  31.77 
 
 		 392 aa  156  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2916  acetyl-CoA acetyltransferase  34.17 
 
 		 400 aa  155  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.614429  normal  0.0144444 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0510  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.22 
 
 		 376 aa  154  2e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1270  acetyl-CoA acetyltransferase  33.68 
 
 		 406 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143492  hitchhiker  0.00783632 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0932  lipid-transfer protein  32.82 
 
 		 393 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0558  thiolase  30.05 
 
 		 407 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5768  lipid-transfer protein  32.56 
 
 		 397 aa  152  8.999999999999999e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2025  lipid-transfer protein  31.73 
 
 		 395 aa  151  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.957629  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0628  putative nonspecific lipid-transfer protein (sterol carrier protein)  33.44 
 
 		 386 aa  150  4e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>