More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0113 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0113  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  100 
 
 
465 aa  955    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1472  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  45.12 
 
 
417 aa  386  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4205  thiolase  41.61 
 
 
413 aa  352  8.999999999999999e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6395  thiolase  42.86 
 
 
413 aa  350  2e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0582995  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5033  thiolase  41.99 
 
 
413 aa  345  8e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5827  thiolase  41.99 
 
 
413 aa  345  8e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4352  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  41.99 
 
 
413 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1838  thiolase  42.64 
 
 
413 aa  335  1e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2744  thiolase  40.91 
 
 
412 aa  333  5e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569153  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0558  thiolase  40.22 
 
 
407 aa  327  3e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0040  thiolase  41.28 
 
 
421 aa  323  5e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5101  Thiolase  42.21 
 
 
413 aa  320  3e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0790  thiolase  39.47 
 
 
414 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6295  thiolase  47.62 
 
 
392 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  42.97 
 
 
390 aa  192  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  43.83 
 
 
387 aa  192  1e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  42.97 
 
 
387 aa  192  1e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  43.82 
 
 
386 aa  190  4e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  40.96 
 
 
388 aa  189  7e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  41.79 
 
 
392 aa  187  3e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  39.76 
 
 
388 aa  186  5e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  41 
 
 
390 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2149  lipid-transfer protein  44.26 
 
 
397 aa  184  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  38.41 
 
 
394 aa  183  5.0000000000000004e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  41.04 
 
 
392 aa  182  1e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2025  lipid-transfer protein  40.16 
 
 
395 aa  181  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.957629  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2338  lipid-transfer protein  40.98 
 
 
396 aa  179  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544781 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3814  lipid-transfer protein  32.62 
 
 
394 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0363497  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2532  lipid-transfer protein  31.79 
 
 
395 aa  179  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.101901  normal  0.217151 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  38.58 
 
 
392 aa  177  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4078  lipid-transfer protein  31.19 
 
 
394 aa  177  4e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  39.34 
 
 
388 aa  176  9.999999999999999e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4396  lipid-transfer protein  38.93 
 
 
397 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46375  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4174  lipid-transfer protein  38.93 
 
 
397 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.942812  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  39.57 
 
 
388 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4240  lipid-transfer protein  38.93 
 
 
397 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.256435  normal  0.231931 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4694  lipid-transfer protein  39.34 
 
 
406 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  40.93 
 
 
387 aa  173  5e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2725  lipid-transfer protein  32.46 
 
 
394 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3986  lipid-transfer protein  32.2 
 
 
394 aa  173  7.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4309  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  41.22 
 
 
378 aa  171  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12803  lipid-transfer protein  38.52 
 
 
401 aa  170  5e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00155026  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3722  lipid-transfer protein  31.38 
 
 
394 aa  170  6e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1529  thiolase  38.93 
 
 
390 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.380974 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5103  lipid-transfer protein  38.11 
 
 
393 aa  166  8e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2740  lipid-transfer protein  39.15 
 
 
395 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.527886  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4757  lipid-transfer protein  40.95 
 
 
395 aa  164  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5540  putative acetyl-CoA C-acyltransferase  41.06 
 
 
364 aa  164  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0178  lipid-transfer protein  31.6 
 
 
395 aa  162  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.925449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  40.4 
 
 
383 aa  162  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0527  acetyl-CoA acetyltransferase  36.22 
 
 
392 aa  160  3e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.191077  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.12 
 
 
387 aa  160  5e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1631  propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.18 
 
 
387 aa  160  5e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  39.66 
 
 
387 aa  159  7e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5826  lipid-transfer protein  39.66 
 
 
394 aa  159  8e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5025  lipid-transfer protein  31.06 
 
 
395 aa  159  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000479532  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3119  lipid-transfer protein  41.67 
 
 
398 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1460  acetyl-CoA acetyltransferase  34.65 
 
 
392 aa  157  3e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  38.62 
 
 
387 aa  157  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2529  lipid-transfer protein  37.71 
 
 
397 aa  156  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.46014  normal  0.613077 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1277  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  42.17 
 
 
397 aa  156  8e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4195  Thiolase  37.35 
 
 
390 aa  156  8e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0815171  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2242  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  41.74 
 
 
389 aa  155  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1512  lipid-transfer protein  38.79 
 
 
409 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427208  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4151  thiolase  42.15 
 
 
386 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0378  acetyl-CoA acetyltransferase  34.25 
 
 
392 aa  155  2e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.855021  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0155  lipid-transfer protein  35.83 
 
 
395 aa  154  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  38.94 
 
 
383 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0669  lipid-transfer protein  34.92 
 
 
389 aa  154  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0628  putative nonspecific lipid-transfer protein (sterol carrier protein)  40.6 
 
 
386 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0459  acetyl-CoA acetyltransferase  33.86 
 
 
392 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221902  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1541  lipid-transfer protein  38.79 
 
 
395 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1564  lipid-transfer protein  38.79 
 
 
395 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3319  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  41.48 
 
 
384 aa  154  4e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16037  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3660  thiolase  37.75 
 
 
380 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.277113  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3733  thiolase  37.75 
 
 
380 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.454317  normal  0.374229 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1437  acetyl-CoA acetyltransferase  38.36 
 
 
392 aa  153  5e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544817  normal  0.0152215 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  38.36 
 
 
390 aa  154  5e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3673  thiolase  37.75 
 
 
380 aa  153  7e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.217678  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  37.5 
 
 
391 aa  153  8e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4119  lipid-transfer protein  38.2 
 
 
401 aa  151  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4071  lipid-transfer protein  39.66 
 
 
395 aa  151  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0510  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.45 
 
 
376 aa  151  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17880  acetyl-CoA acetyltransferase  37.39 
 
 
382 aa  151  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.241643  normal  0.751852 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5768  lipid-transfer protein  37.07 
 
 
397 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2519  thiolase  38.96 
 
 
384 aa  150  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.236528  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3907  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.18 
 
 
381 aa  151  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114937  normal  0.102476 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2602  thiolase  38.52 
 
 
382 aa  150  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4167  lipid-transfer protein  38.72 
 
 
396 aa  149  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0450  lipid-transfer protein  37.29 
 
 
396 aa  149  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.607099  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4139  thiolase  38.96 
 
 
388 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.948206  normal  0.281398 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3832  lipid-transfer protein  36.91 
 
 
394 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3601  hypothetical protein  40.47 
 
 
397 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0450403  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2284  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.02 
 
 
383 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0131646  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0743  lipid-transfer protein  36.09 
 
 
389 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1290  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  39.19 
 
 
378 aa  147  3e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4153  thiolase family protein  36.84 
 
 
387 aa  147  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0386  acetyl-CoA acetyltransferase  37.1 
 
 
387 aa  147  4.0000000000000006e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3870  thiolase  38.56 
 
 
384 aa  145  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.28834 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4354  thiolase  34.04 
 
 
387 aa  145  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>