117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1868 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1868  transport-associated  100 
 
 		 216 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.882392  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3859  transport-associated protein  84.26 
 
 		 216 aa  381  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.790334 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1491  transport-associated  81.94 
 
 		 216 aa  374  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3808  transport-associated  72.56 
 
 		 216 aa  330  7.000000000000001e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1909  transport-associated  62.5 
 
 		 215 aa  258  5.0000000000000005e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.966808  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2264  transport-associated  48.17 
 
 		 216 aa  205  4e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2622  transport-associated  46.3 
 
 		 215 aa  198  5e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3604  hypothetical protein  45.83 
 
 		 215 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.984998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0431  transport-associated  45.16 
 
 		 215 aa  185  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2881  transport-associated  47.44 
 
 		 216 aa  177  8e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4234  transport-associated  43.52 
 
 		 215 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.855371  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1664  hypothetical protein  43.38 
 
 		 215 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0800901  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0425  transport-associated  42.59 
 
 		 214 aa  169  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0417  transport-associated  48.37 
 
 		 216 aa  169  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.421605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2606  transport-associated  48.84 
 
 		 216 aa  169  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0213477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3886  transport-associated  43.52 
 
 		 214 aa  167  8e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.121  normal  0.085803 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2613  transport-associated  42.13 
 
 		 214 aa  166  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1220  transport-associated protein  44.81 
 
 		 214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1226  transport-associated protein  40.55 
 
 		 217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.528686  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2456  transport-associated  42.13 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262468  normal  0.570841 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7765  Smc22-1 ( osmotically inducible sensory protein)  40.55 
 
 		 217 aa  156  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.17558 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0189  hypothetical protein  41.12 
 
 		 215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.193269 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4562  transport-associated  42.06 
 
 		 215 aa  148  8e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.266043 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4429  transport-associated  42.06 
 
 		 215 aa  148  8e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2300  transport-associated  42.13 
 
 		 217 aa  147  9e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.53534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0390  transport-associated  39.07 
 
 		 217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0139  transport-associated protein  40.37 
 
 		 223 aa  142  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5578  transport-associated  40.64 
 
 		 217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00026661  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1870  periplasmic phospholipid binding protein  43.32 
 
 		 216 aa  138  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5932  transport-associated protein  41.4 
 
 		 216 aa  138  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1108  transport-associated  42.4 
 
 		 216 aa  138  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0204  hypothetical protein  36.41 
 
 		 219 aa  136  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3328  transport-associated  37.33 
 
 		 217 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.686073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6189  transport-associated  40.09 
 
 		 216 aa  135  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.551844  normal  0.435123 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5912  transport-associated protein  40.09 
 
 		 216 aa  134  9e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203256  normal  0.355197 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1111  transport-associated  41.67 
 
 		 226 aa  134  9e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7783  putative osmotically-inducible protein Y (precursor)  35.19 
 
 		 220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.379132  normal  0.155349 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0186  hypothetical protein  37.04 
 
 		 217 aa  129  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.117611 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4061  transport-associated  40.28 
 
 		 213 aa  128  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.221026  normal  0.208315 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4565  transport-associated  37.56 
 
 		 217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4432  transport-associated  37.56 
 
 		 217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3634  transport-associated  35.48 
 
 		 228 aa  120  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000681524 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6897  transport-associated  32.87 
 
 		 217 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0353  phospholipid binding protein  38.25 
 
 		 216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1200  transport-associated  37.04 
 
 		 217 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.649848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6133  transport-associated  37.66 
 
 		 178 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1101  transport-associated  37.79 
 
 		 216 aa  115  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1892  putative phophoslipid binding protein  37.96 
 
 		 216 aa  115  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5562  transport-associated  40.74 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221455  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0155  OsmY domain-containing protein  41.74 
 
 		 216 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1324  OsmY domain-containing protein  41.74 
 
 		 216 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2759  putative phospholipid-binding protein  41.74 
 
 		 216 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2616  putative phospholipid-binding protein  41.74 
 
 		 216 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0180  OsmY domain-containing protein  41.74 
 
 		 216 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5544  transport-associated  38.94 
 
 		 216 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.078197  normal  0.764141 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7784  putative osmotically inducible protein Y precursor  33.8 
 
 		 217 aa  105  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0602659  normal  0.220051 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0414  OsmY domain-containing protein  35.98 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1063  OsmY domain-containing protein  35.98 
 
 		 215 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2660  putative phospholipid-binding protein  36.74 
 
 		 237 aa  101  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0116  OsmY domain-containing protein  35.98 
 
 		 215 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.567152  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1280  OsmY domain-containing protein  35.98 
 
 		 215 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84893  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2802  putative phospholipid-binding protein  35.98 
 
 		 215 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0140  putative phospholipid-binding protein  35.98 
 
 		 237 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0453  OsmY domain-containing protein  43.59 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584382  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1025  OsmY domain-containing protein  43.59 
 
 		 197 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1151  transport-associated protein  42.14 
 
 		 141 aa  95.9  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6056  transport-associated  32.86 
 
 		 226 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.822447  hitchhiker  0.00012166 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6209  transport-associated  33.33 
 
 		 215 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.716513 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1899  periplasmic phospholipid binding protein  33.68 
 
 		 233 aa  86.7  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5879  transport-associated protein  32.41 
 
 		 215 aa  87.4  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6692  transport-associated  26.34 
 
 		 543 aa  68.9  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7774  hypothetical protein  27.41 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.194796  normal  0.37862 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5271  transport-associated  41.43 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.833634 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  29.05 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1784  transport-associated  24.49 
 
 		 275 aa  53.9  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010501  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  28.38 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0826  transport-associated  29.75 
 
 		 245 aa  52.8  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2966  periplasmic or secreted lipoprotein OsmY  26.87 
 
 		 219 aa  52  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000230813  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0421  transport-associated protein  26.32 
 
 		 241 aa  50.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  32.52 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  28.28 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  32.52 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0727  transport-associated protein  27.55 
 
 		 240 aa  50.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  29.55 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  32.52 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  32.52 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  32.52 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2956  transport-associated protein  25.85 
 
 		 295 aa  48.5  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1978  transport-associated protein  28.68 
 
 		 241 aa  48.5  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  31.75 
 
 		 201 aa  48.5  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2261  transport-associated  23.05 
 
 		 282 aa  48.5  0.00009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  33.61 
 
 		 201 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  32.23 
 
 		 201 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  32.23 
 
 		 201 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3809  transport-associated  35.21 
 
 		 108 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.810583  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  32.23 
 
 		 201 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  32.23 
 
 		 201 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  32.23 
 
 		 201 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3502  transport-associated  33.8 
 
 		 108 aa  47  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4973  periplasmic protein  31.4 
 
 		 201 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00297721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>