More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3419 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3419  hypothetical protein  100 
 
 		 821 aa  1628    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319511  normal  0.0789128 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1075  hypothetical protein  40.48 
 
 		 828 aa  542  1e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.278561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2537  hypothetical protein  41.33 
 
 		 793 aa  519  1e-146  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.22202  hitchhiker  0.0000000191831 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2729  protein of unknown function DUF214  35.83 
 
 		 796 aa  449  1e-125  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  23.36 
 
 		 848 aa  83.2  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  34 
 
 		 452 aa  80.9  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1613  protein of unknown function DUF214  24.54 
 
 		 779 aa  80.5  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.442641  normal  0.0478935 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  23.46 
 
 		 842 aa  80.9  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  30.49 
 
 		 443 aa  80.1  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  25.87 
 
 		 855 aa  78.2  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  23.28 
 
 		 843 aa  77.8  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2074  protein of unknown function DUF214  25.75 
 
 		 405 aa  75.5  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7809  protein of unknown function DUF214  25.31 
 
 		 775 aa  74.3  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3335  ABC transporter, permease protein  32.05 
 
 		 463 aa  72  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.887003  normal  0.0261397 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  27.21 
 
 		 413 aa  70.9  0.00000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  23 
 
 		 404 aa  68.6  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  23.55 
 
 		 415 aa  68.2  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6966  protein of unknown function DUF214  23.11 
 
 		 805 aa  67.4  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3213  protein of unknown function DUF214  26.39 
 
 		 411 aa  67.4  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.422328  normal  0.138688 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  24.75 
 
 		 371 aa  66.6  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0699  hypothetical protein  23.8 
 
 		 404 aa  66.6  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0151116  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  23.32 
 
 		 414 aa  66.6  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0680  protein of unknown function DUF214  24.32 
 
 		 809 aa  65.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  23.73 
 
 		 414 aa  65.9  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  30.05 
 
 		 853 aa  65.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 		 834 aa  65.9  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  26.77 
 
 		 861 aa  66.2  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6689  hypothetical protein  30.88 
 
 		 465 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874754  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  22.51 
 
 		 880 aa  65.1  0.000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  23.47 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  31.21 
 
 		 642 aa  64.3  0.000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0635  ABC transporter, inner membrane subunit  26.62 
 
 		 435 aa  63.9  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000706682  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1073  hypothetical protein  26.07 
 
 		 384 aa  62.8  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.418174 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2826  cell division protein FtsX  33.33 
 
 		 453 aa  62.8  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  36.36 
 
 		 845 aa  62.4  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0430  lipoprotein ABC transporter permease  22.06 
 
 		 430 aa  62  0.00000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0396093  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  24.22 
 
 		 852 aa  61.6  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  28.1 
 
 		 873 aa  61.6  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  27.54 
 
 		 640 aa  61.6  0.00000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  30.13 
 
 		 855 aa  61.2  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2079  hypothetical protein  23.19 
 
 		 896 aa  60.8  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0252842  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  25.12 
 
 		 696 aa  60.8  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2195  hypothetical protein  25 
 
 		 389 aa  60.5  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3228  permease, putative  21.8 
 
 		 794 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.701051  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1676  hypothetical protein  22.09 
 
 		 412 aa  60.1  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.503245  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7003  protein of unknown function DUF214  22.39 
 
 		 423 aa  59.7  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00437024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2606  hypothetical protein  30.32 
 
 		 420 aa  59.7  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000189226  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  19.91 
 
 		 397 aa  59.7  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3218  permease, putative  21.8 
 
 		 850 aa  59.3  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.479064  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2239  protein of unknown function DUF214  20.25 
 
 		 774 aa  59.3  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4848  hypothetical protein  31.15 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0956312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  20.53 
 
 		 393 aa  59.3  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  29.75 
 
 		 857 aa  58.9  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2927  protein of unknown function DUF214  28.28 
 
 		 409 aa  58.9  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.58384  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5303  protein of unknown function DUF214  24.76 
 
 		 830 aa  58.5  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1784  hypothetical protein  25.21 
 
 		 397 aa  58.5  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.288295  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  35.07 
 
 		 648 aa  58.5  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  33.78 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2359  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.17 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0519  hypothetical protein  28.91 
 
 		 367 aa  58.2  0.0000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00443458  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  29.94 
 
 		 854 aa  58.2  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  29.78 
 
 		 656 aa  58.2  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.5 
 
 		 420 aa  58.2  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  25.24 
 
 		 642 aa  57.8  0.0000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1372  protein of unknown function DUF214  26.77 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.669142  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2385  protein of unknown function DUF214  25.22 
 
 		 466 aa  58.2  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  33.08 
 
 		 649 aa  57.8  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3015  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  29.41 
 
 		 420 aa  57.8  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0037  export ABC transporter permease protein  29.73 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1059  hypothetical protein  26.17 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0540  hypothetical protein  20.07 
 
 		 868 aa  57.8  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.34537  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  28.89 
 
 		 414 aa  57.4  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  24.76 
 
 		 821 aa  57  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  27.78 
 
 		 851 aa  57.4  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0679  hypothetical protein  22.51 
 
 		 397 aa  57.4  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  27.24 
 
 		 402 aa  57  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  34.07 
 
 		 658 aa  57  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  32.33 
 
 		 649 aa  56.6  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  27.23 
 
 		 648 aa  57  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2348  protein of unknown function DUF214  26.6 
 
 		 384 aa  56.6  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.555804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  26.85 
 
 		 400 aa  56.6  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0918  hypothetical protein  28.57 
 
 		 389 aa  56.2  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2542  hypothetical protein  27.27 
 
 		 441 aa  56.6  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.429279  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  27.23 
 
 		 648 aa  57  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  27.61 
 
 		 412 aa  56.6  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0926  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  31.34 
 
 		 653 aa  56.2  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0835  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  31.34 
 
 		 653 aa  56.2  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.077145  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0266  hypothetical protein  32.84 
 
 		 414 aa  55.8  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17241  normal  0.0445989 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2787  putative ABC transport system permease protein  25.15 
 
 		 394 aa  55.8  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000544033  hitchhiker  0.000418311 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2185  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  31.34 
 
 		 653 aa  56.2  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2215  hypothetical protein  31.5 
 
 		 651 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0119  hypothetical protein  22.65 
 
 		 397 aa  55.8  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.395515 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2618  ABC transporter  29.92 
 
 		 653 aa  55.8  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.094569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5172  hypothetical protein  21.36 
 
 		 788 aa  55.5  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841676  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  20.53 
 
 		 387 aa  55.5  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  33.59 
 
 		 421 aa  55.5  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3413  hypothetical protein  30.14 
 
 		 373 aa  55.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.779659  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3423  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  26.21 
 
 		 416 aa  55.5  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02570  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  29.61 
 
 		 417 aa  55.5  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000358315  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  31.3 
 
 		 421 aa  55.8  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>