70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0796 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0796  Acetyl xylan esterase  100 
 
 
324 aa  667    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.513241  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1231  Acetyl xylan esterase  90.37 
 
 
324 aa  590  1e-168  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.302621  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0201  Acetyl xylan esterase  72.05 
 
 
324 aa  497  1e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0886  Acetyl xylan esterase  65.62 
 
 
328 aa  459  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.204765  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0870  Acetyl xylan esterase  62.42 
 
 
325 aa  431  1e-120  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0847  Acetyl xylan esterase  62.11 
 
 
325 aa  429  1e-119  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0504  Acetyl xylan esterase  63.69 
 
 
329 aa  428  1e-119  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4684  Acetyl xylan esterase  63.47 
 
 
321 aa  410  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115957  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0265  Acetyl xylan esterase  63.41 
 
 
328 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1965  acetyl xylan esterase  60.12 
 
 
321 aa  402  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.141167  normal  0.18273 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1058  Acetyl xylan esterase  61.66 
 
 
323 aa  381  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.638201 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0926  Acetyl xylan esterase  58.73 
 
 
333 aa  380  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.642395 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2045  Acetyl xylan esterase  58.33 
 
 
322 aa  370  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3816  Acetyl xylan esterase  57.54 
 
 
365 aa  351  7e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05560  acetyl esterase (deacetylase)  56.63 
 
 
330 aa  351  1e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.590468 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2720  acetyl xylan esterase  53.73 
 
 
332 aa  343  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0579954  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3303  Acetyl xylan esterase  51.02 
 
 
343 aa  339  4e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3004  Acetyl xylan esterase  52.16 
 
 
325 aa  336  2.9999999999999997e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000183119 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1761  Acetyl xylan esterase  54.77 
 
 
324 aa  331  1e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0160667 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3101  Acetyl xylan esterase  50.44 
 
 
339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1237  Acetyl xylan esterase  49.7 
 
 
326 aa  318  7e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.808596  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4187  Acetyl xylan esterase  53.42 
 
 
328 aa  318  7e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33120  acetyl esterase (deacetylase)  50.58 
 
 
350 aa  316  3e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.594264 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1462  acetyl esterase  56.04 
 
 
419 aa  315  9e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.735696  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3115  Acetyl xylan esterase  49.69 
 
 
325 aa  295  8e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0185974  normal  0.0232886 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3413  Acetyl xylan esterase  49.55 
 
 
332 aa  293  3e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0804666  normal  0.178239 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01660  acetyl esterase (deacetylase)  51.67 
 
 
329 aa  289  5.0000000000000004e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2723  Acetyl xylan esterase  48.59 
 
 
352 aa  276  3e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1984  Acetyl xylan esterase  50 
 
 
327 aa  264  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.387898  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2403  Acetyl xylan esterase  43.33 
 
 
309 aa  226  5.0000000000000005e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00763458  normal  0.564898 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1828  Acetyl xylan esterase  45.37 
 
 
320 aa  224  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3063  Acetyl xylan esterase  40.66 
 
 
320 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0284  Acetyl xylan esterase  34.76 
 
 
333 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000137645  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0210  Acetyl xylan esterase  32.3 
 
 
319 aa  162  8.000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.453082  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0152  Acetyl xylan esterase  32.9 
 
 
321 aa  144  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1848  acetylxylan esterase  31.39 
 
 
319 aa  138  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000371827  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0041  acetyl xylan esterase, putative  29.9 
 
 
325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0931  Acetyl xylan esterase  32.12 
 
 
346 aa  120  1.9999999999999998e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.542507 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1236  Acetyl xylan esterase  27.3 
 
 
432 aa  97.1  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299345  normal  0.0188849 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2229  Acetyl xylan esterase  26.55 
 
 
441 aa  90.9  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0209734  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2302  Acetyl xylan esterase  29.3 
 
 
454 aa  88.2  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.000531088  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0486  Acetyl xylan esterase  27.76 
 
 
430 aa  87  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.144902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5838  Acetyl xylan esterase  28.57 
 
 
330 aa  65.9  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.145692  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01220  acetyl esterase (deacetylase)  31.31 
 
 
340 aa  63.9  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2440  Acetyl xylan esterase  24.29 
 
 
319 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133761  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0930  Acetyl xylan esterase  24.02 
 
 
313 aa  51.2  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.554171 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2888  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.87 
 
 
678 aa  49.3  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0760896  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2169  Acetyl xylan esterase  24.52 
 
 
319 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154701  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6210  Acetyl xylan esterase  24.1 
 
 
402 aa  47  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2627  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.88 
 
 
668 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2440  peptidase S15  26.88 
 
 
298 aa  45.4  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6776  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.53 
 
 
661 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2518  Acetyl xylan esterase  25.09 
 
 
317 aa  45.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.391442  normal  0.579948 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0211  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.21 
 
 
673 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.692132 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4128  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.21 
 
 
673 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.658271  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6451  peptidase S15  30.82 
 
 
295 aa  43.9  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0515284  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3567  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.86 
 
 
695 aa  43.9  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304997  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6038  hypothetical protein  25.61 
 
 
298 aa  43.9  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491675  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4254  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.21 
 
 
698 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0432871 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  22.99 
 
 
494 aa  43.9  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3841  hypothetical protein  27.54 
 
 
298 aa  43.5  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5282  hypothetical protein  32.12 
 
 
334 aa  43.5  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0395  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  22.41 
 
 
617 aa  43.1  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0594  dienelactone hydrolase  28.48 
 
 
305 aa  42.7  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2886  hypothetical protein  25.71 
 
 
301 aa  42.7  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1525  dienelactone hydrolase  28.38 
 
 
241 aa  42.7  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0209  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.79 
 
 
698 aa  42.7  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0582441  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0864  hydrolase  26.8 
 
 
314 aa  42.7  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.020243  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3938  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.58 
 
 
681 aa  42.4  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3565  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.25 
 
 
666 aa  42.4  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.533433  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>