256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5305 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A0550  di-haem cytochrome c peroxidase  77.13 
 
 		 456 aa  644    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.77127  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1948  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  77.13 
 
 		 474 aa  645    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0165417  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3364  di-haem cytochrome c peroxidase  77.43 
 
 		 436 aa  661    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.330232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1878  di-haem cytochrome c peroxidase  78.91 
 
 		 465 aa  651    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4041  di-haem cytochrome c peroxidase  77.42 
 
 		 448 aa  641    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.352643 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5305  Di-heme cytochrome c peroxidase  100 
 
 		 433 aa  873    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16606  normal  0.073414 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4434  di-haem cytochrome c peroxidase  78.05 
 
 		 458 aa  640    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4214  di-haem cytochrome c peroxidase  77.67 
 
 		 461 aa  661    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3560  di-haem cytochrome c peroxidase  77.67 
 
 		 448 aa  640    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4152  di-haem cytochrome c peroxidase  77.67 
 
 		 461 aa  661    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333964  normal  0.0566116 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1092  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  74.88 
 
 		 543 aa  633  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.684942  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1890  di-haem cytochrome c peroxidase  75.43 
 
 		 540 aa  627  1e-179  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1805  di-haem cytochrome c peroxidase  75.68 
 
 		 540 aa  628  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231553  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0945  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  75.19 
 
 		 540 aa  625  1e-178  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0353  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  75.43 
 
 		 540 aa  627  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1394  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  75.19 
 
 		 540 aa  625  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.136997  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0435  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  75.19 
 
 		 540 aa  625  1e-178  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0210  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  75.19 
 
 		 540 aa  625  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2493  signal peptide protein  65.16 
 
 		 449 aa  542  1e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2756  putative signal peptide protein  68.25 
 
 		 446 aa  535  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.852122  normal  0.27386 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2353  Di-heme cytochrome c peroxidase  67.99 
 
 		 446 aa  533  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.332837  normal  0.267676 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0920  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  81.77 
 
 		 196 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0921  putative methylamine utilization protein  73.66 
 
 		 220 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5888  Di-haem cytochrome c peroxidase  44.89 
 
 		 429 aa  276  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05063  lipoprotein transmembrane  43.58 
 
 		 441 aa  271  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  0.0603302 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4316  Di-heme cytochrome c peroxidase  42.32 
 
 		 463 aa  266  5.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.65624 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4206  Di-haem cytochrome c peroxidase  42.32 
 
 		 463 aa  266  5.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4808  putative di-heme cytochrome c peroxidase  41.97 
 
 		 455 aa  262  6.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4546  di-haem cytochrome c peroxidase  43.21 
 
 		 461 aa  259  7e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1279  di-haem cytochrome c peroxidase  43.03 
 
 		 469 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1913  di-haem cytochrome c peroxidase  45.41 
 
 		 461 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.452525 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1637  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  40.6 
 
 		 525 aa  251  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.249586  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4228  di-haem cytochrome c peroxidase  37.09 
 
 		 449 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3754  di-haem cytochrome c peroxidase  37.53 
 
 		 472 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1613  di-haem cytochrome c peroxidase  40.89 
 
 		 424 aa  246  6e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4273  di-haem cytochrome c peroxidase  39.1 
 
 		 472 aa  246  8e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1042  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  37.64 
 
 		 536 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.023459  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1628  di-haem cytochrome c peroxidase  40.98 
 
 		 468 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.171293  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0610  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  39.6 
 
 		 536 aa  244  3e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.673254  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6009  di-haem cytochrome c peroxidase  37.11 
 
 		 473 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1823  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  39.6 
 
 		 536 aa  244  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0857  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  39.6 
 
 		 536 aa  244  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1696  Di-heme cytochrome c peroxidase  39.63 
 
 		 433 aa  243  5e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4022  di-haem cytochrome c peroxidase  37.47 
 
 		 473 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4344  di-haem cytochrome c peroxidase  37.47 
 
 		 473 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2342  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  39.21 
 
 		 540 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.349952  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1649  di-haem cytochrome c peroxidase  40.72 
 
 		 471 aa  242  9e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353955  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1805  di-haem cytochrome c peroxidase  40.46 
 
 		 467 aa  242  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1380  di-haem cytochrome c peroxidase  42.59 
 
 		 449 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.925096  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0694  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  40.46 
 
 		 471 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1412  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  40.46 
 
 		 471 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.779688  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0465  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  40.46 
 
 		 471 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00419693  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0887  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  41.21 
 
 		 374 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1302  putative di-haem cytochrome c peroxidase  41.42 
 
 		 461 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2833  Di-haem cytochrome c peroxidase  40.48 
 
 		 460 aa  240  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85653  decreased coverage  0.00293873 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0920  di-haem cytochrome c peroxidase  42.59 
 
 		 449 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1402  di-haem cytochrome c peroxidase  42.59 
 
 		 449 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1313  di-haem cytochrome c peroxidase  42.08 
 
 		 435 aa  239  9e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0706759 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3756  di-haem cytochrome c peroxidase  36.12 
 
 		 480 aa  236  7e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.016238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1675  di-haem cytochrome c peroxidase  35.63 
 
 		 473 aa  236  8e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.998532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3802  hypothetical protein  38.18 
 
 		 454 aa  233  7.000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01731  lipoprotein  39.16 
 
 		 454 aa  231  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1560  Di-heme cytochrome c peroxidase  38.28 
 
 		 413 aa  229  6e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal  0.27225 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1889  Di-haem cytochrome c peroxidase  37.35 
 
 		 468 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0196458  normal  0.598305 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3582  Di-heme cytochrome c peroxidase  39.15 
 
 		 476 aa  225  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0770126  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5017  Di-haem cytochrome c peroxidase  34.88 
 
 		 480 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.130881  normal  0.0650022 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2670  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  40.21 
 
 		 462 aa  223  4e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0723  Di-heme cytochrome c peroxidase  41.22 
 
 		 451 aa  219  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0259217  normal  0.788287 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4631  di-haem cytochrome c peroxidase  35.31 
 
 		 428 aa  210  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0346  putative cytochrome c peroxidase  34.26 
 
 		 491 aa  205  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1906  cytochrome c peroxidase family protein  37.77 
 
 		 390 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3302  di-haem cytochrome c peroxidase  34.7 
 
 		 353 aa  179  7e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2302  Cytochrome-c peroxidase  34.16 
 
 		 361 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1769  cytochrome c peroxidase family protein  34.69 
 
 		 422 aa  169  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.391273  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1422  di-haem cytochrome c peroxidase  33.6 
 
 		 378 aa  156  7e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0511364  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4736  di-haem cytochrome c peroxidase  36.49 
 
 		 387 aa  148  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0936086  normal  0.189061 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2351  di-haem cytochrome c peroxidase  33.24 
 
 		 393 aa  147  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118544  normal  0.0769716 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1210  methylamine utilization protein MauG, putative  30.61 
 
 		 453 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000191755  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1538  methylamine utilization protein MauG, putative  30.85 
 
 		 419 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.258234  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2760  cytochrome c peroxidase family protein  31.49 
 
 		 451 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  32.15 
 
 		 357 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  29.89 
 
 		 417 aa  114  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  29.78 
 
 		 311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  30.33 
 
 		 431 aa  110  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  30.03 
 
 		 626 aa  107  4e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  26.58 
 
 		 613 aa  104  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0994  Cytochrome-c peroxidase  29.22 
 
 		 626 aa  100  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184035  normal  0.251241 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4161  Cytochrome-c peroxidase  28.8 
 
 		 598 aa  99  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171649  normal  0.0843454 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2680  Cytochrome-c peroxidase  29.38 
 
 		 594 aa  97.8  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0101  Cytochrome-c peroxidase  26.85 
 
 		 348 aa  97.1  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1291  Di-heme cytochrome c peroxidase  30.36 
 
 		 487 aa  96.3  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5340600000000002e-32 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  27.89 
 
 		 594 aa  95.1  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2892  cytochrome-c peroxidase  27.88 
 
 		 399 aa  94.4  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411121 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  26.4 
 
 		 358 aa  94  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2381  Cytochrome-c peroxidase  29.12 
 
 		 616 aa  93.2  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.298438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  28.12 
 
 		 768 aa  92.4  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  29.09 
 
 		 346 aa  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  26.58 
 
 		 369 aa  90.1  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  25.27 
 
 		 379 aa  87.8  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  25.81 
 
 		 343 aa  87.8  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>