More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4931 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4931  extra-cytoplasmic solute receptor  100 
 
 		 330 aa  660    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5277  hypothetical protein  84.11 
 
 		 327 aa  547  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3597  hypothetical protein  73.5 
 
 		 323 aa  465  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0688  hypothetical protein  73.36 
 
 		 326 aa  460  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.502545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1021  hypothetical protein  49.84 
 
 		 323 aa  323  4e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.345353  normal  0.559311 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3347  hypothetical protein  48.93 
 
 		 330 aa  319  3.9999999999999996e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  47.99 
 
 		 338 aa  300  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  46.71 
 
 		 324 aa  296  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  46.86 
 
 		 325 aa  296  2e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5108  hypothetical protein  45.1 
 
 		 324 aa  295  6e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031393  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  46.2 
 
 		 324 aa  295  8e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4537  hypothetical protein  46.42 
 
 		 319 aa  294  1e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000308592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  46.05 
 
 		 325 aa  290  3e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2999  hypothetical protein  46 
 
 		 324 aa  289  4e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.272534 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0441  hypothetical protein  47.32 
 
 		 322 aa  276  5e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0368157  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0450  hypothetical protein  46.98 
 
 		 322 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.697568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1547  hypothetical protein  45.76 
 
 		 324 aa  251  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0062  hypothetical protein  45.05 
 
 		 341 aa  251  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  44.15 
 
 		 328 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  43.38 
 
 		 328 aa  249  6e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2127  hypothetical protein  42.86 
 
 		 332 aa  248  8e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00713348 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0983  hypothetical protein  41.67 
 
 		 339 aa  248  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  44.41 
 
 		 344 aa  246  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  45.18 
 
 		 325 aa  245  9e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  41.86 
 
 		 322 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  42.66 
 
 		 325 aa  243  5e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  37.89 
 
 		 332 aa  242  6e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  39.03 
 
 		 330 aa  242  6e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  41.75 
 
 		 325 aa  242  6e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  41.85 
 
 		 332 aa  241  7.999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  43.14 
 
 		 331 aa  241  9e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  42.95 
 
 		 326 aa  241  9e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1312  hypothetical protein  42.28 
 
 		 320 aa  241  9e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5118  hypothetical protein  41.04 
 
 		 320 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534032 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  42.19 
 
 		 339 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  40.2 
 
 		 330 aa  241  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  41.45 
 
 		 330 aa  240  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0578  hypothetical protein  41.55 
 
 		 327 aa  241  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  40 
 
 		 330 aa  239  4e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2205  hypothetical protein  40.97 
 
 		 324 aa  239  5e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0725118 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  41.05 
 
 		 324 aa  239  5.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  42.26 
 
 		 329 aa  238  8e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  39.93 
 
 		 339 aa  238  9e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  39.93 
 
 		 337 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  38.18 
 
 		 322 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3331  hypothetical protein  42.16 
 
 		 336 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  39.55 
 
 		 339 aa  238  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  41.47 
 
 		 326 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  39.52 
 
 		 323 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  41.64 
 
 		 339 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2413  hypothetical protein  39.38 
 
 		 325 aa  237  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  39.94 
 
 		 351 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  42.28 
 
 		 356 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000425301  normal  0.947085 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  38.91 
 
 		 332 aa  236  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  39.14 
 
 		 332 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  37.81 
 
 		 325 aa  237  3e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  39.2 
 
 		 326 aa  236  3e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  41.28 
 
 		 327 aa  236  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6021  hypothetical protein  40.79 
 
 		 338 aa  236  4e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  40.85 
 
 		 339 aa  236  5.0000000000000005e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  39.93 
 
 		 325 aa  235  7e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  37.62 
 
 		 325 aa  235  8e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6257  hypothetical protein  41.47 
 
 		 330 aa  235  8e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6068  hypothetical protein  39.88 
 
 		 324 aa  235  8e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  41.47 
 
 		 333 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  39.8 
 
 		 334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1918  hypothetical protein  39.25 
 
 		 333 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549926  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  37.92 
 
 		 326 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0576  hypothetical protein  39.05 
 
 		 333 aa  233  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  40.13 
 
 		 321 aa  233  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6186  hypothetical protein  39.39 
 
 		 327 aa  233  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4203  extra-cytoplasmic solute receptor  42.52 
 
 		 335 aa  233  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.712641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0790  hypothetical protein  42.62 
 
 		 328 aa  232  6e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1070  hypothetical protein  40.58 
 
 		 332 aa  232  6e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.530289  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  40.86 
 
 		 326 aa  232  7.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  39.59 
 
 		 328 aa  231  9e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  41.61 
 
 		 322 aa  231  9e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2981  hypothetical protein  41.58 
 
 		 322 aa  231  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  38.21 
 
 		 322 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3271  hypothetical protein  41.45 
 
 		 338 aa  231  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448127 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  38.46 
 
 		 335 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2409  hypothetical protein  41.58 
 
 		 322 aa  231  1e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.417331  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  40.8 
 
 		 327 aa  230  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  38.48 
 
 		 327 aa  230  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  40 
 
 		 325 aa  230  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  40 
 
 		 327 aa  230  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0102  hypothetical protein  40.98 
 
 		 328 aa  230  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.337169 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  40 
 
 		 349 aa  230  3e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4520  hypothetical protein  41.72 
 
 		 326 aa  229  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  39.25 
 
 		 328 aa  229  3e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  37.29 
 
 		 332 aa  230  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  40.4 
 
 		 346 aa  229  3e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  40.06 
 
 		 333 aa  230  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0119  hypothetical protein  40.98 
 
 		 328 aa  229  4e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  41 
 
 		 322 aa  229  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  39.52 
 
 		 331 aa  229  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  36.93 
 
 		 318 aa  229  5e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0350  hypothetical protein  37.87 
 
 		 336 aa  229  5e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  39.51 
 
 		 320 aa  229  6e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1270  hypothetical protein  41.03 
 
 		 323 aa  228  7e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>