More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1056 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1056  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  100 
 
 		 584 aa  1155    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0137  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.43 
 
 		 631 aa  400  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.837204  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1262  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.26 
 
 		 634 aa  394  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3780  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.79 
 
 		 642 aa  385  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2232  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.74 
 
 		 634 aa  377  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.319875  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1902  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.26 
 
 		 630 aa  376  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5465  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.28 
 
 		 637 aa  375  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1309  hypothetical protein  34.43 
 
 		 637 aa  363  7.0000000000000005e-99  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1831  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.81 
 
 		 655 aa  329  1.0000000000000001e-88  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1261  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.99 
 
 		 707 aa  326  8.000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09613  ATP-dependent DNA helicase recQ  31.37 
 
 		 632 aa  319  9e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4797  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.37 
 
 		 590 aa  319  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06400  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.74 
 
 		 626 aa  318  2e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1413  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.01 
 
 		 594 aa  317  4e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1710  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  43.72 
 
 		 716 aa  317  5e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000163586  unclonable  9.26658e-25 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1895  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  32.75 
 
 		 633 aa  316  9e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2466  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.94 
 
 		 705 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.425923  normal  0.631246 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2842  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.94 
 
 		 705 aa  312  1e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0115008  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2618  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.94 
 
 		 705 aa  311  1e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00666767  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2826  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.94 
 
 		 705 aa  312  1e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2865  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.94 
 
 		 705 aa  312  1e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000591362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2825  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.94 
 
 		 705 aa  311  2e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139283 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2025  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.62 
 
 		 659 aa  311  2e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.256994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2576  ATP-dependent DNA helicase (RecQ)  42.94 
 
 		 705 aa  311  2.9999999999999997e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238404  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2543  ATP-dependent DNA helicase Q  42.94 
 
 		 705 aa  311  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2627  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.65 
 
 		 705 aa  310  5e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2818  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.65 
 
 		 705 aa  310  5e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.01256  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0252  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.9 
 
 		 602 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1919  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.36 
 
 		 706 aa  307  3e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77164  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2928  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.16 
 
 		 728 aa  307  4.0000000000000004e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000212564  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0744  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.9 
 
 		 593 aa  305  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0761  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.9 
 
 		 593 aa  305  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.089844  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0911  superfamily II DNA helicase  50.77 
 
 		 621 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0328  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.88 
 
 		 721 aa  303  6.000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1036  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.22 
 
 		 709 aa  303  6.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0327  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.88 
 
 		 724 aa  303  7.000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.946569  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2318  23S rRNA (Gm2251)-methyltransferase  32.4 
 
 		 648 aa  303  7.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0019664  hitchhiker  0.00147511 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002717  aTP-dependent DNA helicase RecQ family  32.63 
 
 		 641 aa  302  1e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0020  hypothetical protein  45.02 
 
 		 493 aa  301  2e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6833  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  44.97 
 
 		 708 aa  301  2e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2380  RecQ domain-containing protein  34.15 
 
 		 654 aa  301  3e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1065  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.94 
 
 		 709 aa  301  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0011  putative ATP-dependent DNA helicase  31.99 
 
 		 639 aa  300  4e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0060  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.71 
 
 		 617 aa  300  5e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0015  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.31 
 
 		 656 aa  300  5e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2377  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.22 
 
 		 662 aa  300  5e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0320482  normal  0.0846524 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2030  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.22 
 
 		 665 aa  300  6e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.371966 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1003  superfamily II DNA helicase  43.86 
 
 		 597 aa  299  7e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000133719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.3 
 
 		 617 aa  298  1e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1946  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.51 
 
 		 658 aa  299  1e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.937169  normal  0.260337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1999  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.16 
 
 		 658 aa  299  1e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.171649 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0409  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.44 
 
 		 607 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000268253 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.44 
 
 		 607 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0395  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.44 
 
 		 607 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0383  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.35 
 
 		 607 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3830  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.58 
 
 		 607 aa  298  2e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.912589  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2085  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  33.04 
 
 		 662 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0787976  hitchhiker  0.00232303 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0011  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  43.06 
 
 		 793 aa  298  3e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00580778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03262  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.23 
 
 		 641 aa  297  3e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2260  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.04 
 
 		 662 aa  297  4e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0596276  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3822  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.1 
 
 		 615 aa  297  4e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0469  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.74 
 
 		 607 aa  296  5e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4236  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  50.75 
 
 		 535 aa  296  6e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1545  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.89 
 
 		 592 aa  296  6e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1711  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.86 
 
 		 624 aa  296  7e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3491  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.26 
 
 		 635 aa  296  9e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.394167  normal  0.250752 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2097  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.87 
 
 		 662 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1318  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.93 
 
 		 419 aa  295  1e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.227704  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3149  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  44.29 
 
 		 1376 aa  295  2e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.212538 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3264  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.11 
 
 		 731 aa  294  2e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0899  hypothetical protein  43.84 
 
 		 608 aa  294  3e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1229  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.16 
 
 		 779 aa  294  4e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4237  RecQ domain-containing protein  32.1 
 
 		 690 aa  294  4e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3474  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.67 
 
 		 610 aa  293  4e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0617  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.61 
 
 		 681 aa  294  4e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0224  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.47 
 
 		 611 aa  293  5e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3602  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.39 
 
 		 737 aa  293  5e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.436547 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0930  hypothetical protein  43.84 
 
 		 608 aa  293  6e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0035  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.69 
 
 		 707 aa  293  7e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142382  normal  0.0608085 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0760  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.54 
 
 		 479 aa  293  8e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462487  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0326  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.24 
 
 		 626 aa  292  1e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.149933  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1782  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.12 
 
 		 646 aa  292  1e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4948  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.08 
 
 		 649 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2696  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.22 
 
 		 718 aa  291  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.820222 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2543  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.89 
 
 		 543 aa  291  3e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0369  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.96 
 
 		 642 aa  290  3e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1976  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.98 
 
 		 602 aa  290  3e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0332  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.6 
 
 		 613 aa  290  4e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1066  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.23 
 
 		 681 aa  290  4e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.859317  hitchhiker  0.0000965484 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1667  ATP-requiring DNA helicase RecQ  44.74 
 
 		 615 aa  290  6e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0514  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.68 
 
 		 599 aa  289  1e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.11 
 
 		 592 aa  289  1e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0275  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.13 
 
 		 642 aa  289  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0919838 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2808  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.23 
 
 		 705 aa  289  1e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2304  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.64 
 
 		 602 aa  288  1e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2551  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.35 
 
 		 543 aa  289  1e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.525573  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2506  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.35 
 
 		 543 aa  289  1e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.452  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2398  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.33 
 
 		 606 aa  288  2e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0443  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.11 
 
 		 685 aa  288  2e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0333  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.35 
 
 		 607 aa  288  2e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>