More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6234 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012852  Rleg_6234  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 366 aa  745    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130468  normal  0.465121 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6430  glycosyl transferase group 1  84.15 
 
 		 366 aa  637    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.706841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3694  glycosyl transferase, group 1  59.44 
 
 		 401 aa  432  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.414804 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  30.25 
 
 		 374 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0676  glycosyl transferase, group 1  34.2 
 
 		 396 aa  176  7e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.063849  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1996  glycosyl transferase group 1  31.45 
 
 		 364 aa  153  5e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0250  glycosyl transferase, group 1  30.32 
 
 		 374 aa  134  3e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.430935  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0241  lipopolysaccharide transferase family protein  29.96 
 
 		 384 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1753  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 		 359 aa  105  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.908553  decreased coverage  0.00756127 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  31.53 
 
 		 375 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2856  glycosyl transferase, group 1  31.53 
 
 		 388 aa  100  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0582  glycosyl transferase group 1  28.45 
 
 		 374 aa  100  5e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.838889  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1547  glycosyl transferase, group 1  30.82 
 
 		 397 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.104847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1080  glycosyl transferase group 1  30.86 
 
 		 394 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.184829  normal  0.928063 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3942  glycosyl transferase group 1  31.16 
 
 		 395 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.520896 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1104  glycosyl transferase, group 1  29.27 
 
 		 396 aa  93.6  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0552505  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0095  glycosyl transferase group 1  30.57 
 
 		 378 aa  91.3  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 		 382 aa  89.7  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0731  glycosyl transferase, group 1  42.48 
 
 		 397 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.238036 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  23.12 
 
 		 388 aa  88.6  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2571  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 		 386 aa  87.8  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0395  glycosyl transferase group 1  35.37 
 
 		 378 aa  87.4  4e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.988234  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3353  glycosyl transferase group 1  29.72 
 
 		 381 aa  84.3  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.207762  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2306  glycosyl transferase group 1  31.65 
 
 		 379 aa  83.6  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.455622  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5248  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 393 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663702 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2909  glycosyl transferase, group 1  34.08 
 
 		 362 aa  80.9  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0955  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 		 364 aa  80.9  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  0.284207 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1498  glycosyl transferase, group 1  28.3 
 
 		 392 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0255  glycosyl transferase group 1  38.97 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2577  glycosyl transferase, group 1  27.4 
 
 		 767 aa  76.6  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161849  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  34.62 
 
 		 385 aa  75.9  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2343  glycosyl transferase group 1  29.29 
 
 		 350 aa  74.7  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4092  glycosyl transferase group 1  35.33 
 
 		 359 aa  73.9  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2282  glycosyl transferase group 1  29.11 
 
 		 381 aa  73.2  0.000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.823032  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2442  glycosyl transferase, group 1  34.42 
 
 		 382 aa  72.8  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  23.61 
 
 		 377 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0740  glycosyl transferase, group 1  27.41 
 
 		 823 aa  72  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  23.53 
 
 		 395 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 		 358 aa  70.9  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3116  glycosyl transferase group 1  34.72 
 
 		 377 aa  71.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.304233 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  36.17 
 
 		 367 aa  70.9  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0821  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.534399  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1236  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 		 765 aa  70.5  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  27.89 
 
 		 373 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  25.61 
 
 		 422 aa  68.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4609  glycosyl transferase, group 1  30.17 
 
 		 416 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.955462  normal  0.431404 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2506  glycosyl transferase group 1  28.79 
 
 		 774 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1450  glycosyl transferase group 1  26.34 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.925912  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.75 
 
 		 382 aa  67  0.0000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 		 392 aa  67  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4416  glycosyl transferase group 1  27.69 
 
 		 398 aa  66.2  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8172  glycosyl transferase group 1  35.37 
 
 		 356 aa  66.2  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0723  glycosyltransferase-like protein  30.4 
 
 		 396 aa  65.9  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 		 385 aa  65.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2522  glycosyl transferase  36.5 
 
 		 364 aa  65.5  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.810552  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2891  glycosyl transferase group 1  29.87 
 
 		 378 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1868  glycosyl transferase  36.52 
 
 		 375 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 361 aa  65.1  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  26.7 
 
 		 348 aa  65.1  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  31.96 
 
 		 422 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  29.21 
 
 		 810 aa  64.3  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0869  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  23.78 
 
 		 382 aa  64.7  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000612209  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3376  glycosyl transferase group 1  31.96 
 
 		 399 aa  64.3  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000624508  hitchhiker  0.000924483 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_851  glycosyltransferase  27.5 
 
 		 382 aa  63.9  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209144  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5224  glycosyl transferase, group 1  27.7 
 
 		 393 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2638  glycosyl transferase group 1  31.11 
 
 		 367 aa  63.2  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0400002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  36.02 
 
 		 362 aa  62.8  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1066  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 		 385 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.552097 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  26.16 
 
 		 403 aa  62.8  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 		 396 aa  62.8  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  26.16 
 
 		 403 aa  62.8  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0053  glycosyl transferase group 1  20.53 
 
 		 368 aa  62.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933113  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1369  Glycosyltransferase-like protein  32.17 
 
 		 357 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.473124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0168  glycosyl transferase  27.91 
 
 		 374 aa  62  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.627515 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  28.77 
 
 		 433 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  29.45 
 
 		 819 aa  62  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2494  glycosyl transferase group 1  23.71 
 
 		 452 aa  62  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.044708  normal  0.0808495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5160  glycosyl transferase group 1  31.54 
 
 		 800 aa  61.6  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170469  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  27.44 
 
 		 361 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  34.71 
 
 		 423 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4124  glycosyl transferase, group 1  24.56 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  26.71 
 
 		 401 aa  62  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3774  glycosyl transferase group 1  36.81 
 
 		 372 aa  62  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.904998 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3174  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.41 
 
 		 377 aa  61.2  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3658  glycosyl transferase, group 1  35.23 
 
 		 386 aa  60.8  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151561  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  29.94 
 
 		 353 aa  61.2  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  24.14 
 
 		 386 aa  60.8  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1722  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 		 394 aa  60.8  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.664722  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 		 371 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  26.1 
 
 		 411 aa  60.8  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  25.17 
 
 		 382 aa  60.1  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1198  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 388 aa  60.1  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 		 374 aa  60.5  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2250  putative glycosyltransferase  31.55 
 
 		 384 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  27.73 
 
 		 405 aa  60.1  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1623  glycosyl transferase group 1  24.43 
 
 		 386 aa  60.1  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0932889  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0865  glycosyl transferase, group 1  26 
 
 		 763 aa  60.5  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.926448  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0925  glycosyl transferase, group 1  25.1 
 
 		 761 aa  60.1  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.259199  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1613  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 		 409 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659761  hitchhiker  0.00171863 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>