More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5479 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012853  Rleg_5479  plasmid partitioning protein RepB  100 
 
 		 342 aa  687    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8200  replication protein B  50.59 
 
 		 345 aa  328  9e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3735  plasmid partitioning protein RepB  42.72 
 
 		 336 aa  206  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5872  plasmid partitioning protein RepB  41.88 
 
 		 351 aa  204  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136486  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5376  plasmid partitioning protein RepB  42.19 
 
 		 349 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224219  normal  0.37065 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6491  parB-like partition protein  41.1 
 
 		 340 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.880766 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5556  plasmid partitioning protein RepB  38.79 
 
 		 329 aa  199  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  0.913858 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4190  parB-like partition protein  46.61 
 
 		 358 aa  196  5.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.33147 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7001  replication protein B  39.66 
 
 		 337 aa  194  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7788  plasmid partitioning protein RepB  39.1 
 
 		 347 aa  193  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256779  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4544  parB-like partition proteins  35.74 
 
 		 336 aa  192  5e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000207738  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6016  plasmid partitioning protein RepB  38.37 
 
 		 331 aa  192  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0995392  normal  0.26849 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6316  plasmid partitioning protein RepB  38.82 
 
 		 329 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.758859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4280  RepB plasmid partition  37.7 
 
 		 333 aa  191  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7171  plasmid partitioning protein RepB  37.79 
 
 		 331 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29862 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4823  parB-like partition protein  40.07 
 
 		 325 aa  186  4e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000278259  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4790  parB-like partition protein  41.63 
 
 		 335 aa  186  5e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.636081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9502  replication protein B  36.93 
 
 		 332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627889  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3275  parB-like partition protein  44.58 
 
 		 322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5616  plasmid partitioning protein RepB  41.18 
 
 		 334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.389719  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3562  plasmid partitioning protein RepB  41.45 
 
 		 353 aa  181  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0002  ParB family protein  36.98 
 
 		 315 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.295488 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4355  ParB family protein  36.56 
 
 		 348 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4090  parB-like partition protein  37.14 
 
 		 333 aa  179  7e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5194  plasmid partitioning protein RepB  40.41 
 
 		 333 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223628  normal  0.149754 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4584  parB-like partition proteins  37.18 
 
 		 335 aa  176  4e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5913  plasmid partitioning protein RepB  37.82 
 
 		 336 aa  176  4e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.339623  normal  0.0259303 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5464  plasmid partitioning protein RepB  40.75 
 
 		 333 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6500  plasmid partitioning protein RepB  36.27 
 
 		 350 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4191  parB-like partition proteins  36.36 
 
 		 347 aa  170  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4518  parB-like partition proteins  38.97 
 
 		 339 aa  166  4e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5001  replication protein B  42.4 
 
 		 360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.868981  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9002  replication protein B  37.63 
 
 		 325 aa  160  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1105  replication protein RepB  37.38 
 
 		 328 aa  157  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000199163  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4572  parB-like partition proteins  35.81 
 
 		 343 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4688  plasmid partitioning protein RepB  41.74 
 
 		 322 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1203  replication protein RepB  37.05 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00462835  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6163  plasmid partitioning protein RepB  36.14 
 
 		 332 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.331476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4672  parB-like partition protein  34.24 
 
 		 347 aa  150  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4455  parB-like partition protein  34.46 
 
 		 328 aa  149  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00154333  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8001  replication protein B  32.33 
 
 		 331 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4022  ParB-like partition protein  34.63 
 
 		 316 aa  143  5e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574096  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5174  parB-like partition protein  33.73 
 
 		 334 aa  142  6e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.690841 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9801  replication protein B  40.09 
 
 		 345 aa  138  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8704  plasmid partitioning protein RepB  34 
 
 		 312 aa  135  9e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4533  parB-like partition protein  29.13 
 
 		 326 aa  133  6e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6053  plasmid partitioning protein RepB  32.89 
 
 		 326 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4710  parB-like partition protein  31.63 
 
 		 335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.946547  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4022  parB-like partition protein  36.63 
 
 		 338 aa  97.4  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4103  parB-like partition protein  31.67 
 
 		 274 aa  97.4  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4185  Rep B partitioning protein/ParB-like protein  35.59 
 
 		 328 aa  93.2  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324966  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  35.25 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  34.92 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  33.33 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  32.06 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3097  ParB family protein  32.07 
 
 		 668 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0650807  decreased coverage  0.0000165149 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0006  ParB family chromosome partioning protein  35.71 
 
 		 279 aa  67  0.0000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.269835  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  34.96 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3888  parB-like partition protein  38.05 
 
 		 369 aa  66.2  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7203  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561228 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6109  parB-like partition protein  36.24 
 
 		 359 aa  63.2  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  33.57 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2275  parB-like partition proteins  35.24 
 
 		 605 aa  62.8  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.174874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0039  parB-like partition protein  29.34 
 
 		 344 aa  62  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.103386  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  34.13 
 
 		 301 aa  62.4  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2927  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 297 aa  62.4  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0047  transcriptional repressor  29.34 
 
 		 359 aa  61.6  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  34.4 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  32.87 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2788  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2731  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4361  parB-like partition protein  25.44 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  33.06 
 
 		 326 aa  59.3  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 297 aa  58.9  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  32.62 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  29.6 
 
 		 299 aa  57  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  31.67 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2333  parB-like protein partition proteins  34.21 
 
 		 281 aa  55.5  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.99663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0037  transcription repressor protein KorB  35.71 
 
 		 350 aa  55.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.871786  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  34.48 
 
 		 329 aa  55.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
NC_008532  STER_2003  ParB-like nuclease domain-containing protein  31.82 
 
 		 255 aa  55.8  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0929  chromosome segregation DNA-binding protein  29.09 
 
 		 283 aa  55.1  0.000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4176  parB-like partition protein  27.9 
 
 		 360 aa  55.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2880  parB-like partition protein  41.41 
 
 		 368 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0081  chromosome segregation DNA-binding protein  27.81 
 
 		 261 aa  55.1  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  29.32 
 
 		 293 aa  54.3  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  28.18 
 
 		 281 aa  54.3  0.000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3116  parB-like partition protein  26.22 
 
 		 282 aa  53.9  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.0000000669867 
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  28.23 
 
 		 293 aa  53.5  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  28.23 
 
 		 293 aa  53.5  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4236  parB-like partition protein  35.34 
 
 		 341 aa  53.5  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2567  transcriptional regulator  27.56 
 
 		 280 aa  53.5  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.183752  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  34.29 
 
 		 295 aa  53.1  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0562  parB-like partition protein  30.08 
 
 		 312 aa  53.1  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000115281  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4540  chromosome segregation DNA-binding protein  32.76 
 
 		 333 aa  53.1  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5104  parB-like partition protein  34.58 
 
 		 335 aa  53.1  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000234759 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4692  parB-like partition proteins  38.46 
 
 		 337 aa  52.8  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0209451  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  33.33 
 
 		 305 aa  52.8  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1123  parB-like partition protein  29.22 
 
 		 572 aa  52.8  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9049  parB-like partition protein  30.08 
 
 		 398 aa  52.8  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.740864  normal  0.284166 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>