More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1641 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1641  GntR-like  100 
 
 		 256 aa  521  1e-147  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.655901  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26860  GntR family regulatory protein  47.41 
 
 		 241 aa  201  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5742  GntR domain protein  48.09 
 
 		 233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.343946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1141  GntR family transcriptional regulator  51.5 
 
 		 233 aa  191  7e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.536549  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0035  GntR family transcriptional regulator  45.02 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.840145  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1596  GntR domain-containing protein  48.07 
 
 		 236 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387143  hitchhiker  0.00000232868 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1260  GntR family transcriptional regulator  49.58 
 
 		 235 aa  179  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  41.18 
 
 		 238 aa  149  5e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 245 aa  135  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 247 aa  132  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1636  GntR domain-containing protein  36.73 
 
 		 266 aa  124  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195276  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5113  GntR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 274 aa  124  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5903  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 		 288 aa  122  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210517  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3731  GntR domain protein  36.91 
 
 		 238 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3757  GntR domain-containing protein  35.42 
 
 		 235 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560097  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3408  GntR domain protein  36.91 
 
 		 253 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2484  GntR domain-containing protein  37.18 
 
 		 238 aa  119  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.120596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5664  GntR domain protein  33.33 
 
 		 248 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0098751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5932  GntR domain protein  36.89 
 
 		 234 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4274  GntR domain protein  33.04 
 
 		 229 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2173  GntR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.727858  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4447  GntR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.614266  normal  0.249195 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4745  GntR domain-containing protein  34.6 
 
 		 249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100625 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6605  GntR domain protein  32.91 
 
 		 246 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449422 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4422  GntR domain-containing protein  36.61 
 
 		 234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99346  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  36.09 
 
 		 273 aa  113  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000957079  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3501  GntR domain-containing protein  35.56 
 
 		 234 aa  113  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.378835 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  35.96 
 
 		 249 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  35.96 
 
 		 249 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0023  GntR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0020  GntR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1308  GntR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4435  GntR domain-containing protein  32.6 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8124  GntR domain protein  34.47 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 251 aa  110  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1469  GntR domain protein  34.33 
 
 		 250 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934444  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4031  GntR domain-containing protein  35.9 
 
 		 243 aa  109  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  37.28 
 
 		 255 aa  108  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  36.44 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5148  GntR domain protein  38.74 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.178203  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2818  GntR domain-containing protein  34.63 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2589  GntR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000313005  normal  0.0123827 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3305  GntR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 251 aa  106  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0978  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 		 234 aa  106  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1948  GntR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 255 aa  107  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0263216  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0823  GntR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  36.02 
 
 		 237 aa  105  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0479  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 		 234 aa  105  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0253  GntR domain-containing protein  35.32 
 
 		 262 aa  104  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  33.48 
 
 		 264 aa  104  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5125  GntR domain-containing protein  35.56 
 
 		 234 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 268 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6745  GntR domain-containing protein  36.13 
 
 		 243 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1995  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 268 aa  104  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00626171  normal  0.663234 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5082  GntR domain-containing protein  31.78 
 
 		 250 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4549  GntR domain-containing protein  36.89 
 
 		 234 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.858524 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2313  GntR domain-containing protein  34.63 
 
 		 249 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146544  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3603  GntR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 254 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3102  GntR domain-containing protein  34.63 
 
 		 249 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2012  GntR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 234 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.888081  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1919  GntR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 234 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0578  GntR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 234 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0889  GntR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 234 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0437  GntR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 234 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1856  GntR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 234 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1795  GntR domain protein  33.48 
 
 		 272 aa  102  6e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.02855  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5072  GntR domain-containing protein  36.44 
 
 		 234 aa  102  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  33.05 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  0.000000169252 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1804  GntR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 247 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00283289  hitchhiker  0.0098314 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3372  GntR domain-containing protein  34.05 
 
 		 299 aa  99.8  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5344  GntR domain protein  34.98 
 
 		 242 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5064  regulatory protein GntR HTH  34.17 
 
 		 242 aa  99  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0833  GntR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 272 aa  99  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0464324 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1886  GntR domain-containing protein  36.24 
 
 		 242 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4862  GntR domain protein  35.93 
 
 		 247 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  34.05 
 
 		 253 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1789  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 232 aa  98.2  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.612124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3213  GntR-like  35.56 
 
 		 234 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6767  GntR domain protein  35.16 
 
 		 240 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5154  GntR domain-containing protein  35.56 
 
 		 234 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  32.19 
 
 		 251 aa  97.1  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05190  Transcriptional regulatory protein, GntR family  34.75 
 
 		 252 aa  97.1  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0661  GntR domain-containing protein  36.61 
 
 		 232 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2652  normal  0.118681 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6265  GntR domain protein  32.62 
 
 		 254 aa  96.3  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.610791 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5703  transcriptional regulator GntR family  32.3 
 
 		 246 aa  95.9  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3007  GntR domain-containing protein  32.74 
 
 		 270 aa  95.9  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.012307  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3584  GntR-like  34.04 
 
 		 275 aa  95.9  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.532256  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  32.29 
 
 		 238 aa  95.5  7e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6442  GntR domain protein  32.19 
 
 		 254 aa  93.2  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143546 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0177  GntR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 270 aa  93.6  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5177  regulatory protein GntR HTH  33.04 
 
 		 238 aa  93.2  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.835231  normal  0.258028 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0971  GntR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 248 aa  93.2  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3405  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 239 aa  93.2  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3050  GntR domain-containing protein  33.04 
 
 		 239 aa  93.2  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0593714 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3676  GntR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 250 aa  92.8  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0156  GntR family regulatory protein  31.9 
 
 		 270 aa  92.4  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000005482  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4518  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 234 aa  92.8  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  33.04 
 
 		 241 aa  92.8  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>