170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0927 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1221  N-acyl-D-amino-acid deacylase  68.17 
 
 		 490 aa  664    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0927  N-acyl-D-amino-acid deacylase  100 
 
 		 499 aa  1020    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0663  dihydroorotase  86.68 
 
 		 493 aa  878    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3331  N-acyl-D-amino-acid deacylase  68.31 
 
 		 493 aa  677    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0837  D-aminoacylase  51.61 
 
 		 493 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0658  N-acyl-D-aspartate deacylase  51.61 
 
 		 493 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.227387  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0674  N-acyl-D-aspartate deacylase  51.61 
 
 		 493 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0546  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  51.23 
 
 		 493 aa  472  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0641  N-acyl-D-amino-acid deacylase  50.2 
 
 		 493 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.388826 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0366  N-acyl-D-amino-acid deacylase  51.64 
 
 		 495 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0178  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  50.71 
 
 		 475 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2770  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  50.71 
 
 		 475 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2309  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  50.71 
 
 		 475 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2389  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  50.71 
 
 		 475 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06353  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  48.83 
 
 		 481 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4896  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  49.49 
 
 		 480 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.591808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0559  N-acyl-D-amino-acid deacylase  49.79 
 
 		 493 aa  456  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4058  N-acyl-D-amino-acid deacylase  50 
 
 		 493 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2657  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.77 
 
 		 493 aa  451  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2790  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.77 
 
 		 493 aa  451  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5117  N-acyl-D-amino acid deacylase family protein  48.87 
 
 		 504 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0723  amidohydrolase  48.28 
 
 		 485 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0415  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.25 
 
 		 491 aa  443  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2128  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.15 
 
 		 493 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2740  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.15 
 
 		 493 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2766  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.15 
 
 		 493 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6068  N-acyl-D-amino-acid deacylase  47.94 
 
 		 493 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0978  N-acyl-D-amino-acid deacylase  47.75 
 
 		 488 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0091  N-acyl-D-amino-acid deacylase  47.64 
 
 		 499 aa  439  9.999999999999999e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.64957  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1187  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  49.59 
 
 		 494 aa  432  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.826213  normal  0.915695 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4020  N-acyl-D-amino-acid deacylase  47.74 
 
 		 487 aa  431  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4772  D-aminoacylase  48.25 
 
 		 487 aa  430  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911342  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  46.73 
 
 		 479 aa  429  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4816  N-acyl-D-amino-acid deacylase  47.13 
 
 		 484 aa  422  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4195  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.26 
 
 		 494 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4305  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.26 
 
 		 494 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  45.79 
 
 		 486 aa  406  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  46.6 
 
 		 477 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0310888  normal  0.304031 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.58 
 
 		 478 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.602072  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6029  N-acyl-D-amino-acid deacylase  46.42 
 
 		 491 aa  403  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4959  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.58 
 
 		 478 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.555934 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5254  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.58 
 
 		 478 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5093  N-acyl-D-amino-acid deacylase  44.76 
 
 		 494 aa  399  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00480971  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5030  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.58 
 
 		 478 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  normal  0.647601 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1862  D-aminoacylase domain-containing protein  45.88 
 
 		 493 aa  401  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.555174  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0926  D-aminoacylase  46.2 
 
 		 490 aa  401  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.888276  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3337  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.37 
 
 		 478 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.198805  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3714  D-aminoacylase domain protein  45.71 
 
 		 486 aa  388  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0656167 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1302  dihydroorotase  34.98 
 
 		 533 aa  278  2e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0050942  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0263  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.1 
 
 		 533 aa  278  2e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1358  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.61 
 
 		 534 aa  268  2e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2753  Amidohydrolase 3  33.07 
 
 		 530 aa  266  7e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3660  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.06 
 
 		 532 aa  253  8.000000000000001e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0822791  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3978  N-acyl-D-glutamate deacylase  33.33 
 
 		 534 aa  244  1.9999999999999999e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6759  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.75 
 
 		 516 aa  243  5e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0363476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6046  D-aminoacylase domain protein  33.46 
 
 		 530 aa  243  7e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2958  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.5 
 
 		 528 aa  242  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5575  N-acyl-D-amino-acid deacylase  39.07 
 
 		 534 aa  239  6.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3836  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase/D-alanyl-D-alanine-endopeptidase  33.33 
 
 		 1076 aa  238  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5481  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.95 
 
 		 529 aa  235  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3031  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.48 
 
 		 525 aa  229  6e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1417  dihydroorotase  32.1 
 
 		 558 aa  228  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1501  N-acyl-D-glutamate deacylase  30.92 
 
 		 487 aa  228  3e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1032  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.04 
 
 		 545 aa  224  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.396344 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2530  N-acyl-D-aspartate deacylase  32.65 
 
 		 522 aa  221  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.296499 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0720  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.2 
 
 		 547 aa  219  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.066305 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2609  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.89 
 
 		 651 aa  217  2.9999999999999998e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.83 
 
 		 529 aa  216  9e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1467  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.95 
 
 		 565 aa  211  3e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  32.76 
 
 		 848 aa  209  6e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5490  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.63 
 
 		 532 aa  210  6e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.65 
 
 		 511 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0222852  normal  0.0756976 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3006  Amidohydrolase 3  32.78 
 
 		 533 aa  207  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00370  D-aminoacylase, putative  30.3 
 
 		 557 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1552  N-acyl-D-glutamate deacylase  31.58 
 
 		 507 aa  194  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1130  N-acyl-D-glutamate deacylase  30.77 
 
 		 499 aa  192  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000145932 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4361  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.05 
 
 		 531 aa  186  8e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500767  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0069  Amidohydrolase 3  31.34 
 
 		 539 aa  184  4.0000000000000006e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3947  N-acyl-D-glutamate deacylase  28.49 
 
 		 546 aa  179  8e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.291331  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2980  D-aminoacylase domain protein  31.29 
 
 		 528 aa  179  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.572399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3245  dihydroorotase  27.88 
 
 		 534 aa  176  8e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  normal  0.0340031 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1852  D-aminoacylase domain protein  30.27 
 
 		 456 aa  172  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000129758  normal  0.0198034 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2691  amidohydrolase family protein  28.01 
 
 		 523 aa  166  8e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303331  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3252  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.39 
 
 		 527 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.516885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04600  N-acyl-D-aspartate/D-glutamate deacylase  29.39 
 
 		 620 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08310  N-acyl-D-aspartate/D-glutamate deacylase  30.4 
 
 		 558 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.575602  normal  0.0585768 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3345  amidohydrolase 3  29.4 
 
 		 588 aa  150  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.783036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3298  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.23 
 
 		 548 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3040  D-glutamate deacylase  29.07 
 
 		 481 aa  133  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.236527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1900  D-aminoacylase domain-containing protein  32.71 
 
 		 589 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0350811  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2091  amidohydrolase 3  25.76 
 
 		 560 aa  110  9.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6837  amidohydrolase 3  31.9 
 
 		 556 aa  104  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0874953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3646  amidohydrolase 3  29.79 
 
 		 589 aa  103  6e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.668872  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3369  amidohydrolase 3  35.27 
 
 		 582 aa  103  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559487  normal  0.377193 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1796  D-aminoacylase domain-containing protein  29.81 
 
 		 560 aa  94  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897442 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09918  D-glutamate deacylase  23.02 
 
 		 493 aa  94  6e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2023  amidohydrolase 3  32.5 
 
 		 579 aa  92.8  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.730117 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1735  amidohydrolase 3  28.57 
 
 		 587 aa  92.4  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6853  amidohydrolase 3  30.5 
 
 		 567 aa  91.7  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2152  amidohydrolase 3  29.5 
 
 		 581 aa  91.3  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.288153  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>