More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6440 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6440  general substrate transporter  100 
 
 		 376 aa  730    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0400024  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6667  major facilitator transporter  69.37 
 
 		 462 aa  455  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2078  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  69.11 
 
 		 458 aa  422  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0454367  normal  0.84629 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2179  major facilitator superfamily MFS_1  69.11 
 
 		 458 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3301  major facilitator superfamily MFS_1  56.68 
 
 		 449 aa  387  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.859152  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1306  major facilitator transporter  56.68 
 
 		 449 aa  378  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.099547  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4728  major facilitator transporter  55.05 
 
 		 449 aa  373  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0849  major facilitator transporter  35.88 
 
 		 464 aa  149  8e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0462  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 452 aa  139  7e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.042885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5364  major facilitator transporter  36.17 
 
 		 460 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0351  General substrate transporter  32.55 
 
 		 433 aa  138  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0092051  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2371  major facilitator transporter  30.69 
 
 		 406 aa  138  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.363547  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2237  general substrate transporter  32.46 
 
 		 444 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3534  major facilitator transporter  35.37 
 
 		 460 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554978  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  32.36 
 
 		 461 aa  137  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0015  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 		 456 aa  136  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170297  normal  0.0989418 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0658  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 447 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.848878  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3666  major facilitator transporter  32.46 
 
 		 444 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.262449 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5782  major facilitator superfamily MFS_1  30.19 
 
 		 454 aa  135  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2063  major facilitator transporter  32.16 
 
 		 444 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2233  general substrate transporter  32.46 
 
 		 444 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527639 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2487  major facilitator transporter  35.03 
 
 		 445 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0407  major facilitator superfamily MFS_1  30.88 
 
 		 435 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.051048  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  32.19 
 
 		 443 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3892  major facilitator transporter  34.22 
 
 		 445 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50239  normal  0.071614 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4735  major facilitator transporter  34.22 
 
 		 445 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3628  major facilitator transporter  34.22 
 
 		 445 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.804515 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1251  major facilitator transporter  30.7 
 
 		 422 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0968424  normal  0.933487 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1721  general substrate transporter  30.99 
 
 		 432 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.675628 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3319  major facilitator superfamily MFS_1  30.68 
 
 		 469 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0121  major facilitator superfamily MFS_1  31.18 
 
 		 468 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0299314  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2568  general substrate transporter  29.95 
 
 		 444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1328  putative permease  29.63 
 
 		 436 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4754  major facilitator transporter  30.87 
 
 		 467 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0835  major facilitator superfamily MFS_1  32.04 
 
 		 439 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.554079  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2224  major facilitator transporter  29.79 
 
 		 457 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0671964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0265  general substrate transporter  31.78 
 
 		 421 aa  130  3e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.931457 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3363  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 457 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.124155  normal  0.451531 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0146  General substrate transporter  31.66 
 
 		 431 aa  130  5.0000000000000004e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2177  major facilitator transporter  33.94 
 
 		 441 aa  129  6e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0897  major facilitator transporter  30.29 
 
 		 432 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.924021  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5065  major facilitator transporter  34.22 
 
 		 445 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0348973  normal  0.262199 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18260  arabinose efflux permease family protein  30.91 
 
 		 438 aa  129  9.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.897354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0131  general substrate transporter  28.65 
 
 		 446 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000482205  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0977  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  31.2 
 
 		 449 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.698376 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3920  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  32.83 
 
 		 440 aa  129  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.210524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11224  integral membrane transport protein  30.1 
 
 		 425 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000679327  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2553  major facilitator family transporter  29.79 
 
 		 457 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0427116  decreased coverage  0.00798136 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2302  General substrate transporter  28.57 
 
 		 444 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000263865 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0983  General substrate transporter  30.03 
 
 		 481 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359093  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  32.04 
 
 		 432 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  28.69 
 
 		 461 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5468  major facilitator transporter  28.45 
 
 		 437 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350259  normal  0.0257067 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  28.69 
 
 		 461 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0457  major facilitator transporter  30.7 
 
 		 394 aa  127  3e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  28.69 
 
 		 461 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0906  major facilitator superfamily MFS_1  30.47 
 
 		 439 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1160  major facilitator transporter  29.54 
 
 		 440 aa  127  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  31.69 
 
 		 443 aa  126  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6354  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 442 aa  126  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20210  arabinose efflux permease family protein  29.53 
 
 		 452 aa  126  7e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4657  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 		 440 aa  125  8.000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.511231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3162  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 457 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.688084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3365  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.81 
 
 		 433 aa  125  9e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00021546  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0644  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  31.29 
 
 		 442 aa  125  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3518  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 447 aa  125  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1420  proline/glycine betaine transporter  26.1 
 
 		 500 aa  125  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00160587  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1084  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 478 aa  125  2e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0860  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  30.98 
 
 		 441 aa  124  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4351  proline/glycine betaine transporter  27.18 
 
 		 500 aa  125  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2487  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 420 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4665  proline/glycine betaine transporter  27.18 
 
 		 500 aa  125  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03982  proline/glycine betaine transporter  28.04 
 
 		 500 aa  124  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3881  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  28.04 
 
 		 500 aa  124  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5798  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 449 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172816  normal  0.0754795 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03943  hypothetical protein  28.04 
 
 		 500 aa  124  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01920  arabinose efflux permease family protein  28.74 
 
 		 449 aa  124  3e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.535895 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3916  proline/glycine betaine transporter  28.04 
 
 		 500 aa  124  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.382911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  27.32 
 
 		 459 aa  124  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5624  proline/glycine betaine transporter  28.04 
 
 		 500 aa  124  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5790  major facilitator superfamily MFS_1  29.03 
 
 		 477 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.339463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1520  General substrate transporter  32.33 
 
 		 453 aa  124  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1913  General substrate transporter  30.79 
 
 		 463 aa  123  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.168957  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3414  major facilitator superfamily MFS_1  27.69 
 
 		 438 aa  123  5e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 458 aa  123  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2499  major facilitator superfamily MFS_1  32 
 
 		 454 aa  123  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30660  sugar phosphate permease  28.42 
 
 		 466 aa  123  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.488584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4576  proline/glycine betaine transporter  27.59 
 
 		 500 aa  123  5e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1863  major facilitator transporter  30 
 
 		 455 aa  122  7e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.565866  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0292  hypothetical protein  28.61 
 
 		 431 aa  122  8e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1744  major facilitator superfamily MFS_1  31.33 
 
 		 433 aa  122  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4552  proline/glycine betaine transporter  27.32 
 
 		 500 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4636  proline/glycine betaine transporter  27.32 
 
 		 500 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4636  proline/glycine betaine transporter  27.32 
 
 		 500 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2550  major facilitator transporter  29.29 
 
 		 436 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4745  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.98 
 
 		 440 aa  122  8e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8642  major facilitator superfamily MFS_1  29.33 
 
 		 453 aa  122  9e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2710  major facilitator superfamily MFS_1  33.68 
 
 		 420 aa  122  9e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.703478 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5330  major facilitator family transporter  29.04 
 
 		 429 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0357971  hitchhiker  0.00453891 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  30.27 
 
 		 430 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>