More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5026 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5026  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  100 
 
 		 325 aa  649    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.572063  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4012  putative LysR family transcriptional regulator  69.64 
 
 		 317 aa  424  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1381  transcriptional regulator, LysR family  44.74 
 
 		 314 aa  240  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.31695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1317  transcriptional regulator, LysR family  44.93 
 
 		 314 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.339821 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4463  transcriptional regulator, LysR family  48.21 
 
 		 317 aa  238  9e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.599678  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1964  LysR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1803  LysR substrate binding domain-containing protein  41.67 
 
 		 307 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1739  LysR substrate binding domain protein  41.67 
 
 		 307 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1743  LysR substrate binding domain protein  41.67 
 
 		 307 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.574272 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1717  LysR substrate binding domain-containing protein  41.67 
 
 		 307 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0492643 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1532  LysR substrate binding domain protein  41.67 
 
 		 307 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1440  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  43.63 
 
 		 319 aa  228  9e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1647  transcriptional regulator, LysR family  39.74 
 
 		 307 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.997012  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2027  transcriptional regulator, LysR family  39.74 
 
 		 307 aa  222  6e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.294769  hitchhiker  0.0000000175537 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2237  LysR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 339 aa  222  7e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.956085 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1601  LysR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 307 aa  222  7e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1504  LysR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 307 aa  222  7e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1752  LysR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 307 aa  222  8e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.53029e-17 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01379  predicted DNA-binding transcriptional regulator  39.74 
 
 		 307 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2224  transcriptional regulator, LysR family  39.74 
 
 		 307 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.1844  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01391  hypothetical protein  39.74 
 
 		 307 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2503  LysR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 328 aa  221  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3572  transcriptional regulator, LysR family  39.46 
 
 		 322 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6759  transcriptional regulator, LysR family  34.78 
 
 		 327 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2774  LysR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 337 aa  176  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0066556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3888  LysR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 369 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3489  LysR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 330 aa  172  5.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3914  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 321 aa  170  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.21984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1856  LysR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 328 aa  168  9e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397268  normal  0.189017 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0562  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 312 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.260746  normal  0.122148 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0626  LysR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 325 aa  165  9e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.284859  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0642  transcriptional regulator PcaQ  37.33 
 
 		 302 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0604  pca operon transcription factor PcaQ  37.33 
 
 		 302 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1262  LysR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0948373  normal  0.0721838 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4418  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 325 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.43525  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38270  pca operon transcription factor PcaQ  34.67 
 
 		 310 aa  162  7e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4006  LysR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 310 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00309329  normal  0.374097 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4175  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 328 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387899  normal  0.0617168 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4192  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 328 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774005  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3342  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 328 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.893011  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1713  LysR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0202364 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1305  LysR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000111615  normal  0.494502 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3724  LysR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 304 aa  160  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1350  Pca operon transcriptional activator PcaQ  36.54 
 
 		 334 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0139604  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0982  LysR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 334 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0983507  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0246  Pca operon transcriptional activator PcaQ  36.54 
 
 		 334 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.010271  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4062  LysR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 328 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3582  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 328 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.591894 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0230  transcriptional regulator PcaQ  36.86 
 
 		 305 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0317  pca operon transcription factor PcaQ  36.21 
 
 		 334 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1844  pca operon transcription factor PcaQ  36.21 
 
 		 334 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.282267  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1759  Pca operon transcriptional activator PcaQ  36.21 
 
 		 334 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0219488  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1120  LysR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 333 aa  155  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00232816  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4205  LysR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 316 aa  154  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2686  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 303 aa  150  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.247375 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2121  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.77 
 
 		 306 aa  149  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.547513  normal  0.230532 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2337  pca operon transcriptional activator PcaQ  34.5 
 
 		 309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.269299  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0393  Pca operon transcriptional activator PcaQ  35.93 
 
 		 454 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.439238  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4160  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.181035 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2084  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 308 aa  142  5e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0859391  normal  0.308177 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7076  transcriptional regulator, LysR family  32.78 
 
 		 305 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3574  LysR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 356 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.108458 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5938  transcriptional regulator, LysR family  32.44 
 
 		 305 aa  139  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.254792 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6124  pca operon transcription factor PcaQ  34.89 
 
 		 284 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0261121  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01890  transcriptional regulator PcaQ  36.29 
 
 		 275 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.536002  normal  0.885717 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0310  LysR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 310 aa  135  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.179801  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4280  LysR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1954  transcriptional regulator, LysR family  31.13 
 
 		 313 aa  130  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176573  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1018  LysR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 317 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.379655  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09120  Transcriptional regulator, LysR family  27.39 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2349  LysR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 323 aa  123  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0494  LysR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 312 aa  122  7e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.574474 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3514  LysR family transcriptional regulator  28 
 
 		 321 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.17891  normal  0.0678834 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0863  LysR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 322 aa  116  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.267188 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1032  LysR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 333 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277484 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1209  LysR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 314 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3466  LysR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 321 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935879  normal  0.213991 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4926  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 316 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0040  LysR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 316 aa  112  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1633  LysR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 331 aa  112  9e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.749714  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3958  transcriptional regulator, LysR family  25.99 
 
 		 325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00354063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6715  LysR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 316 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5645  LysR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 316 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0239097  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5687  transcriptional regulator, LysR family  28.47 
 
 		 335 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5214  LysR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 316 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1107  transcriptional regulator, LysR family  28.42 
 
 		 299 aa  110  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5481  LysR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046066 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4584  LysR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 316 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974851 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1489  LysR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 332 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442641  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0289  LysR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 339 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1620  LysR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 312 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3439  LysR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 311 aa  105  7e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.444229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3201  LysR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 316 aa  105  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0942378 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4394  LysR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 306 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1466  LysR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2833  LysR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 339 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.823205  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3176  transcriptional regulator, LysR family  25.58 
 
 		 334 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3272  transcriptional regulator, LysR family  26.04 
 
 		 302 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1042  transcriptional regulator, LysR family  27.24 
 
 		 319 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429419  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4144  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 314 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11543  normal  0.0506604 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>