More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1191 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1191  hypothetical protein  100 
 
 
335 aa  683    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0120541  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5161  extra-cytoplasmic solute receptor  56.15 
 
 
341 aa  366  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0547548 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5492  hypothetical protein  51.32 
 
 
329 aa  308  9e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1598  hypothetical protein  44.41 
 
 
330 aa  301  8.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.667416  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5287  extra-cytoplasmic solute receptor  45.33 
 
 
330 aa  297  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.126425 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1372  hypothetical protein  47.51 
 
 
329 aa  292  6e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3711  hypothetical protein  42.47 
 
 
331 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150567  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  40.33 
 
 
337 aa  230  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3917  extra-cytoplasmic solute receptor  38.22 
 
 
328 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3703  hypothetical protein  37.83 
 
 
333 aa  226  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  38.39 
 
 
328 aa  225  8e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  37.04 
 
 
327 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  39.13 
 
 
356 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  39.33 
 
 
327 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  36.57 
 
 
327 aa  222  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  41.47 
 
 
356 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  36.01 
 
 
328 aa  219  5e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0102  hypothetical protein  35.78 
 
 
328 aa  219  7.999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.337169 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  36.36 
 
 
318 aa  218  7.999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  37.69 
 
 
325 aa  218  8.999999999999998e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5302  hypothetical protein  39.46 
 
 
326 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0119  hypothetical protein  35.78 
 
 
328 aa  218  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  35.64 
 
 
325 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  37.71 
 
 
324 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  37.67 
 
 
322 aa  217  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  35.6 
 
 
326 aa  216  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  36.42 
 
 
325 aa  215  7e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3897  hypothetical protein  39.07 
 
 
332 aa  215  8e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0101322  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  33.65 
 
 
325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  37.3 
 
 
321 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  39.46 
 
 
323 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  34.74 
 
 
332 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  39.13 
 
 
330 aa  213  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  35.28 
 
 
331 aa  212  7e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1326  hypothetical protein  37.29 
 
 
312 aa  212  7.999999999999999e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.12583  hitchhiker  7.14872e-17 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  37 
 
 
334 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  38.41 
 
 
324 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1918  hypothetical protein  35.9 
 
 
333 aa  210  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549926  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  34.67 
 
 
325 aa  211  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1347  hypothetical protein  36.73 
 
 
327 aa  210  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.44147  normal  0.036943 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0242  hypothetical protein  37.63 
 
 
325 aa  210  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2783  hypothetical protein  37.75 
 
 
324 aa  210  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  35 
 
 
335 aa  210  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4169  hypothetical protein  36.22 
 
 
319 aa  210  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.719911  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  34.45 
 
 
334 aa  210  3e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1722  hypothetical protein  38.2 
 
 
338 aa  209  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.322135 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  37.5 
 
 
326 aa  209  4e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  37.94 
 
 
333 aa  208  8e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5824  extra-cytoplasmic solute receptor  38.33 
 
 
330 aa  208  9e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  36.75 
 
 
337 aa  208  9e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2429  hypothetical protein  34.82 
 
 
326 aa  208  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  36.2 
 
 
336 aa  208  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3049  hypothetical protein  37.25 
 
 
330 aa  208  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.131227 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  33.75 
 
 
324 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  36.68 
 
 
336 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  34.48 
 
 
328 aa  207  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  37.21 
 
 
341 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  35.22 
 
 
328 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  37.79 
 
 
325 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  36.42 
 
 
353 aa  207  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  35.26 
 
 
358 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  34.71 
 
 
329 aa  206  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4309  hypothetical protein  37.74 
 
 
336 aa  206  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.28876 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4520  hypothetical protein  37.79 
 
 
326 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  35.76 
 
 
328 aa  206  4e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  36.98 
 
 
341 aa  206  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  35.76 
 
 
328 aa  206  4e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5108  hypothetical protein  36.67 
 
 
324 aa  206  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031393  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1399  hypothetical protein  35.43 
 
 
339 aa  206  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  36.86 
 
 
314 aa  206  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2025  hypothetical protein  36.04 
 
 
324 aa  206  6e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  37.95 
 
 
353 aa  205  7e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  34.55 
 
 
324 aa  205  7e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1818  hypothetical protein  36.54 
 
 
326 aa  205  8e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00429449 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  35.91 
 
 
323 aa  205  9e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  35.45 
 
 
338 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  35.67 
 
 
334 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  34.69 
 
 
326 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1198  hypothetical protein  37.22 
 
 
322 aa  204  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.667586  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  36.42 
 
 
325 aa  205  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  37.09 
 
 
328 aa  204  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6179  hypothetical protein  38.21 
 
 
323 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  35.76 
 
 
332 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  35.25 
 
 
331 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  36.09 
 
 
328 aa  204  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  34.8 
 
 
328 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  35.67 
 
 
327 aa  204  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  37.12 
 
 
325 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  35.67 
 
 
325 aa  204  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  33.23 
 
 
333 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  37.76 
 
 
304 aa  204  3e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3512  hypothetical protein  36.75 
 
 
334 aa  203  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543672  normal  0.304228 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6257  hypothetical protein  36.45 
 
 
330 aa  203  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  35.48 
 
 
325 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4980  hypothetical protein  38.13 
 
 
321 aa  203  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.790818  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5655  hypothetical protein  35.55 
 
 
328 aa  203  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.315231  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  34.88 
 
 
332 aa  203  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3854  hypothetical protein  35.51 
 
 
328 aa  203  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  32.61 
 
 
322 aa  202  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6131  hypothetical protein  37.5 
 
 
314 aa  202  8e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.554613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>