146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0832 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0832  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 207 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4569  DSBA oxidoreductase  89.81 
 
 		 207 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0916  DSBA oxidoreductase  86.83 
 
 		 207 aa  360  9e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.745875  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4818  DSBA oxidoreductase  72.55 
 
 		 208 aa  307  8e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.228616  normal  0.843256 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0848  hypothetical protein  69.46 
 
 		 207 aa  294  6e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.537333  normal  0.685229 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1456  DSBA oxidoreductase  55.17 
 
 		 214 aa  222  3e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2763  DSBA oxidoreductase  51.72 
 
 		 204 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0019  DSBA oxidoreductase  46.31 
 
 		 209 aa  186  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2829  DSBA oxidoreductase  45.27 
 
 		 201 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.497522  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3344  DSBA oxidoreductase  43.78 
 
 		 218 aa  162  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3621  DSBA oxidoreductase  41.84 
 
 		 198 aa  161  6e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06936  conserved hypothetical protein  42.03 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3669  DSBA oxidoreductase  43.28 
 
 		 218 aa  158  6e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.294685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2968  DSBA oxidoreductase  39.8 
 
 		 201 aa  151  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0240  DSBA oxidoreductase  41.55 
 
 		 201 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4931  DSBA oxidoreductase  40.7 
 
 		 199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2615  DSBA oxidoreductase  37.24 
 
 		 204 aa  140  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.146689 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2074  DSBA oxidoreductase  40.59 
 
 		 204 aa  138  4.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.688012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0100  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  40.59 
 
 		 201 aa  132  5e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.243641 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0187  DSBA oxidoreductase  38 
 
 		 201 aa  129  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.115932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0898  DSBA oxidoreductase  35.47 
 
 		 219 aa  125  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1054  DSBA oxidoreductase  39.09 
 
 		 199 aa  119  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2930  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  37.7 
 
 		 199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.697373  normal  0.0268517 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0273  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  33.66 
 
 		 201 aa  109  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2624  DSBA oxidoreductase  31.5 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.730832 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3822  DSBA oxidoreductase  36.36 
 
 		 199 aa  105  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0131  DSBA oxidoreductase  30.69 
 
 		 201 aa  102  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0123  DSBA oxidoreductase  31.19 
 
 		 201 aa  102  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01440  hypothetical protein  28.43 
 
 		 195 aa  101  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5568  DSBA oxidoreductase  33.17 
 
 		 198 aa  101  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.433092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4348  DSBA oxidoreductase  34 
 
 		 198 aa  98.6  7e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113847  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3650  DSBA oxidoreductase  26.87 
 
 		 200 aa  98.2  8e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111173  hitchhiker  0.000000000000173834 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0141  DSBA oxidoreductase  31.68 
 
 		 219 aa  97.4  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0819  DSBA oxidoreductase  28.92 
 
 		 197 aa  96.3  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6061  DSBA oxidoreductase  28.64 
 
 		 207 aa  92.8  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2882  DSBA oxidoreductase  29.15 
 
 		 204 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47421  normal  0.700762 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2386  DSBA oxidoreductase  28.28 
 
 		 197 aa  92  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.99345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0109  DSBA oxidoreductase  31.68 
 
 		 219 aa  91.7  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4196  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 197 aa  91.3  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0193  hypothetical protein  26.4 
 
 		 195 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3908  DSBA oxidoreductase  26.26 
 
 		 196 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2808  DSBA oxidoreductase  28.64 
 
 		 204 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2561  DSBA oxidoreductase  28.42 
 
 		 200 aa  89.4  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2632  DSBA oxidoreductase  28.71 
 
 		 203 aa  89  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0465832  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5356  DSBA oxidoreductase  29.74 
 
 		 201 aa  88.2  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.615074  normal  0.90574 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2900  DSBA oxidoreductase  27.45 
 
 		 204 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0567  DSBA oxidoreductase  29.08 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5257  DSBA oxidoreductase  27.09 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023333 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0500  DSBA oxidoreductase  29.35 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3869  DSBA oxidoreductase  27.59 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2247  DSBA oxidoreductase  25.25 
 
 		 210 aa  81.3  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.281612  normal  0.141895 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0315  hypothetical protein  27.69 
 
 		 201 aa  80.9  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126619  normal  0.599326 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0094  DSBA oxidoreductase  27.72 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2588  DSBA oxidoreductase  24.75 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1916  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  28.57 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0187  DSBA oxidoreductase  29.35 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0579  DSBA oxidoreductase  29.38 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5151  hypothetical protein  25.87 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758473 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5353  DSBA oxidoreductase  27.45 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39652  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1446  DSBA oxidoreductase  29.1 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2477  DSBA oxidoreductase  24.75 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.494112  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3711  DSBA oxidoreductase  25.76 
 
 		 195 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0949861 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4223  DSBA oxidoreductase  29.15 
 
 		 201 aa  78.2  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.285896 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0020  DSBA oxidoreductase  27.13 
 
 		 200 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.901494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3816  DSBA oxidoreductase  29.29 
 
 		 210 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5264  hypothetical protein  24 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193912  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0018  DSBA oxidoreductase  27.13 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0023  DSBA oxidoreductase  26.06 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3362  putative 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase protein  29.29 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5394  DSBA oxidoreductase  28.86 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458374  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5467  DSBA oxidoreductase  28.86 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0340236  normal  0.10941 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3208  DSBA oxidoreductase  24.75 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3649  DSBA oxidoreductase  23.88 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149995  hitchhiker  0.000000000000176719 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4723  DSBA oxidoreductase  27 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.396107  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5350  DSBA oxidoreductase  28.86 
 
 		 212 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.527741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6054  DSBA oxidoreductase  24.88 
 
 		 200 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3151  DSBA oxidoreductase  25.51 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4809  DSBA oxidoreductase  28.36 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1459  DSBA oxidoreductase  28.27 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3319  DSBA oxidoreductase  28.78 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4802  DSBA oxidoreductase  28 
 
 		 212 aa  72  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0727  DSBA oxidoreductase  27.51 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.422782  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0479  DSBA oxidoreductase  29 
 
 		 229 aa  71.2  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2187  DSBA oxidoreductase  23.23 
 
 		 201 aa  71.2  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2652  DSBA oxidoreductase  24.38 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.34917  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4139  DSBA oxidoreductase  25.25 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4027  DSBA oxidoreductase  25.25 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2249  DSBA oxidoreductase  25.79 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.386975  normal  0.508108 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1944  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0797  DSBA oxidoreductase  27.18 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.320942 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5282  DSBA oxidoreductase  27.46 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2347  DSBA oxidoreductase  26.73 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000115912  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2567  DSBA oxidoreductase  25.26 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2292  DSBA oxidoreductase  25.26 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0852078 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4346  DSBA oxidoreductase  30.05 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2015  DSBA oxidoreductase  27.4 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6640  DSBA oxidoreductase  26.26 
 
 		 208 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7385  DSBA oxidoreductase  25.53 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1378  DSBA oxidoreductase  27.23 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6005  DSBA oxidoreductase  25.25 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.440782 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>