More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4175 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4175  ABC transporter related  100 
 
 		 276 aa  563  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1561  ABC transporter related  90.22 
 
 		 282 aa  507  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4571  ABC transporter related  88.41 
 
 		 296 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5714  putative high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  87.68 
 
 		 273 aa  493  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  0.906173 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1570  ABC transporter related  92.31 
 
 		 275 aa  487  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.269529 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0296  ABC transporter related  85.6 
 
 		 269 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0141833  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2309  ABC transporter related  83.66 
 
 		 269 aa  442  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0078002 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1860  ABC transporter related  80.16 
 
 		 280 aa  434  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.400828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3510  ABC transporter component  75.1 
 
 		 274 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.850532  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1831  ABC transporter related  73.91 
 
 		 269 aa  402  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2611  ABC transporter-related protein  73.83 
 
 		 265 aa  394  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3417  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  73.52 
 
 		 269 aa  393  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.65888  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3137  ABC transporter-related protein  74.22 
 
 		 265 aa  393  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.489025 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000404  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  71.71 
 
 		 266 aa  389  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.428911  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0622  ABC transporter related  61.02 
 
 		 269 aa  325  5e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.105631  normal  0.0623344 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2423  ABC transporter related  57.87 
 
 		 269 aa  311  5.999999999999999e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0546  ABC transporter related  59.06 
 
 		 270 aa  311  9e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1598  ABC transporter related protein  62.11 
 
 		 260 aa  310  2e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0250  ABC transporter related  58.33 
 
 		 260 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.830264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0261  ABC transporter related  57.43 
 
 		 306 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2218  ABC transporter related  58.23 
 
 		 274 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5038  ABC transporter related  60.24 
 
 		 286 aa  306  2.0000000000000002e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0953  ABC transporter related  57.43 
 
 		 274 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.513158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2724  ABC transporter related  56.18 
 
 		 277 aa  303  2.0000000000000002e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.407856 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2278  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  57.43 
 
 		 279 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0215  ABC transporter-related protein  56.75 
 
 		 313 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0049  ABC transporter related  56.75 
 
 		 269 aa  301  5.000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0375  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein livG  57.43 
 
 		 273 aa  300  2e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0786  ABC transporter-related protein  57.94 
 
 		 263 aa  300  2e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.545872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0469  ABC transporter related  57.14 
 
 		 261 aa  298  8e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.331272  normal  0.304191 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3608  ABC transporter related  56.35 
 
 		 261 aa  296  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3435  ABC transporter-related protein  56.75 
 
 		 264 aa  296  3e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000808082 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3364  ABC transporter related  55.82 
 
 		 274 aa  296  3e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0460  ABC transporter related  56.75 
 
 		 261 aa  296  4e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.530493  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0603  ABC transporter related  55.51 
 
 		 260 aa  295  7e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.15363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1158  ABC transporter related  55.56 
 
 		 261 aa  294  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5007  ABC transporter related  55.91 
 
 		 261 aa  293  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4010  ABC transporter related  55.82 
 
 		 272 aa  293  3e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3541  ABC transporter related  55.56 
 
 		 260 aa  290  1e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_809  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  51.49 
 
 		 276 aa  291  1e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4062  ABC transporter related  55.34 
 
 		 289 aa  288  7e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0032  ABC transporter related  57.31 
 
 		 294 aa  288  9e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0822  ABC transporter related  50.57 
 
 		 276 aa  285  5.999999999999999e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0401  ABC transporter related  55.2 
 
 		 277 aa  285  8e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0938  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.19 
 
 		 270 aa  281  7.000000000000001e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0956002  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5286  ABC transporter related  53.97 
 
 		 283 aa  276  4e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2281  ABC transporter related  57.14 
 
 		 264 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0114  ABC transporter related  55.42 
 
 		 272 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.95101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2360  ABC transporter related  54.37 
 
 		 278 aa  273  3e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.547386 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43540  ABC transporter, ATP binding component  55.42 
 
 		 260 aa  272  4.0000000000000004e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0288454  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0549  ABC transporter related  53.41 
 
 		 265 aa  270  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.505535  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2767  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  52.61 
 
 		 277 aa  267  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0300535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2987  ABC transporter related  53.01 
 
 		 277 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.657234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3842  ABC transporter related  53.2 
 
 		 289 aa  267  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000140209  normal  0.918006 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0569  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  55.22 
 
 		 255 aa  266  2e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.383942  normal  0.0445823 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3008  ABC transporter-related protein  51.95 
 
 		 275 aa  265  8.999999999999999e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00336682  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0135  ABC transporter-like protein  55.42 
 
 		 255 aa  261  1e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1542  ABC transporter related protein  52.19 
 
 		 255 aa  254  1.0000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000371483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4097  ABC transporter related  49.81 
 
 		 292 aa  249  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.362688  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2990  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.81 
 
 		 264 aa  247  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00578117  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3005  ABC transporter related  51.38 
 
 		 256 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3163  ABC transporter related protein  48.61 
 
 		 292 aa  247  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0375758  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3501  ABC transporter related  49.61 
 
 		 282 aa  247  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.111605  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2748  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  51.38 
 
 		 266 aa  245  6e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.916728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3030  ABC transporter related protein  48.62 
 
 		 274 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0759  ABC transporter related protein  49.4 
 
 		 268 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5146  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  51 
 
 		 296 aa  244  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156661  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  49.41 
 
 		 273 aa  243  3e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2376  ABC transporter-like protein  47.39 
 
 		 251 aa  243  3e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1465  ABC transporter-like protein  49.4 
 
 		 291 aa  243  3e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4938  ABC transporter related  47.15 
 
 		 275 aa  242  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.584937  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2442  ABC transporter related protein  46.25 
 
 		 250 aa  242  5e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3832  ABC transporter related protein  47.04 
 
 		 285 aa  241  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2544  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.4 
 
 		 256 aa  240  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661138  normal  0.234113 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2499  ABC transporter related  45.38 
 
 		 262 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.241387  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7076  high-affinity branched-chain amino acid transport protein  47.66 
 
 		 265 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6107  ABC transporter related  45.74 
 
 		 261 aa  237  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.319085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43780  ABC transporter, LivG family  50.6 
 
 		 262 aa  237  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.430374  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4240  ABC transporter related  46.27 
 
 		 266 aa  235  6e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  46.8 
 
 		 264 aa  233  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  46.4 
 
 		 265 aa  232  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  43.98 
 
 		 284 aa  232  6e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0609  ATPase  44.36 
 
 		 261 aa  232  6e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1744  ABC transporter related  45.1 
 
 		 265 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0853683 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1425  ABC transporter related  45.67 
 
 		 253 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.715565  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  46.06 
 
 		 271 aa  230  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  45.02 
 
 		 259 aa  229  3e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  49.4 
 
 		 261 aa  229  3e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  48.21 
 
 		 271 aa  229  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  49 
 
 		 276 aa  229  5e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1481  ABC transporter related  42.15 
 
 		 261 aa  228  6e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7156  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  45.24 
 
 		 264 aa  228  7e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3799  ABC transporter related  46.64 
 
 		 256 aa  228  7e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.718599 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  46.99 
 
 		 258 aa  228  7e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  46.59 
 
 		 255 aa  228  9e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  43.23 
 
 		 284 aa  228  1e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4818  ABC transporter related  45.21 
 
 		 274 aa  227  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.177699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3491  ABC transporter related  45.85 
 
 		 256 aa  226  3e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.411905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  41.73 
 
 		 263 aa  226  3e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2610  ABC transporter related  45.38 
 
 		 270 aa  226  4e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>