More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4601 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4601  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  100 
 
 		 213 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3743  1-Cys peroxiredoxin  73.36 
 
 		 214 aa  323  1e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1982  peroxidase  71.83 
 
 		 213 aa  322  2e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2522  putative peroxiredoxin  73.17 
 
 		 230 aa  312  2.9999999999999996e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0155428 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00098  alkyl hydroperoxide reductase  70.73 
 
 		 216 aa  306  1.0000000000000001e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35496  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0829  1-Cys peroxiredoxin  68.29 
 
 		 220 aa  304  5.0000000000000004e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.456456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1920  peroxidase  69.76 
 
 		 241 aa  297  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1056  Peroxiredoxin  67.29 
 
 		 214 aa  295  2e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000027249  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1581  anti-oxidant AhpCTSA family protein  54.93 
 
 		 213 aa  263  1e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000757986  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2734  peroxidase  58.54 
 
 		 219 aa  252  2.0000000000000002e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1330  3-Cys thioredoxin peroxidase  53.52 
 
 		 213 aa  251  6e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00995589  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1460  peroxiredoxin-like protein  54.46 
 
 		 213 aa  251  7e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0873499  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0162  peroxidase  56.1 
 
 		 214 aa  239  2e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0307  Peroxiredoxin  55.12 
 
 		 223 aa  238  5e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.804859 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1420  peroxiredoxin  53.95 
 
 		 240 aa  236  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.984101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2242  Peroxiredoxin  52.88 
 
 		 217 aa  234  9e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0959  peroxiredoxin  50.7 
 
 		 228 aa  230  1e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.12414  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3838  peroxiredoxin  54.15 
 
 		 221 aa  229  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.790791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4147  Peroxiredoxin  54.15 
 
 		 221 aa  228  4e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1940  peroxiredoxin  53.59 
 
 		 232 aa  227  1e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0479  peroxiredoxin  52.15 
 
 		 229 aa  222  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.640513 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0355  peroxiredoxin  49.3 
 
 		 226 aa  221  8e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1445  peroxiredoxin  51.9 
 
 		 212 aa  219  1.9999999999999999e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2814  1-Cys peroxiredoxin  51.71 
 
 		 234 aa  218  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1570  peroxidase  49.07 
 
 		 221 aa  209  3e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0271609  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0891  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  53.01 
 
 		 212 aa  207  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0945  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  53.3 
 
 		 210 aa  207  1e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1049  Peroxiredoxin  46.88 
 
 		 225 aa  206  3e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1416  peroxidase  48.61 
 
 		 220 aa  206  3e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0184  3-Cys thioredoxin peroxidase  52.04 
 
 		 217 aa  205  4e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3741  1-Cys peroxiredoxin  47.52 
 
 		 221 aa  205  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0121  peroxiredoxin  47.39 
 
 		 215 aa  204  5e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0119  peroxiredoxin  47.39 
 
 		 215 aa  205  5e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0463  peroxiredoxin  47.78 
 
 		 215 aa  204  8e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0023  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  49.53 
 
 		 220 aa  204  8e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00120067  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2560  3-Cys thioredoxin peroxidase / 1-Cys peroxiredoxin  49.26 
 
 		 215 aa  202  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0396  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  48.1 
 
 		 216 aa  202  3e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.647366  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1196  peroxiredoxin  49.05 
 
 		 212 aa  202  4e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.136829  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1809  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  47 
 
 		 224 aa  200  9.999999999999999e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.420051  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0572  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  48.84 
 
 		 225 aa  200  9.999999999999999e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2700  Peroxiredoxin  52.49 
 
 		 208 aa  199  3e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.936444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2393  Peroxiredoxin  47.14 
 
 		 213 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.843671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1379  Peroxiredoxin  49.52 
 
 		 213 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.043311  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12960  Alkyl hydroperoxide reductase  46.67 
 
 		 216 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000248971  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2133  1-Cys peroxiredoxin, 3-Cys thioredoxin peroxidase  46.05 
 
 		 223 aa  194  7e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000419293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1262  peroxiredoxin  48.83 
 
 		 212 aa  193  1e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.475702  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0011  peroxiredoxin  46.33 
 
 		 215 aa  192  3e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1860  peroxidase  47.89 
 
 		 212 aa  191  8e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2195  peroxiredoxin  45.58 
 
 		 224 aa  190  2e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0474553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0207  putative peroxiredoxin  46.23 
 
 		 215 aa  186  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0166  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  46.45 
 
 		 217 aa  185  4e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0349  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  46.92 
 
 		 217 aa  184  8e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0457086 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0381  peroxidase  45.41 
 
 		 208 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.5059  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0581  peroxiredoxin  43.81 
 
 		 224 aa  182  3e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00103295  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0479  peroxiredoxin  44.29 
 
 		 223 aa  180  2e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0883  Peroxiredoxin  46.15 
 
 		 213 aa  179  2.9999999999999997e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000013318  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2847  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.29 
 
 		 215 aa  179  4e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0326  peroxiredoxin  42.79 
 
 		 226 aa  179  4e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.420993  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1142  peroxiredoxin  41.59 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2437  peroxidase  46.56 
 
 		 209 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.41124 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0413  peroxiredoxin  46.86 
 
 		 217 aa  176  3e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.695857  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1965  peroxiredoxin  42.38 
 
 		 225 aa  174  7e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3015  peroxidase  44.44 
 
 		 209 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183076  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2721  Peroxidase  44.97 
 
 		 209 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1980  peroxiredoxin  42.38 
 
 		 221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1496  peroxiredoxin  46.38 
 
 		 217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.583253  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1079  putative peroxiredoxin  40.95 
 
 		 230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0481  peroxidase  50.79 
 
 		 217 aa  171  5.999999999999999e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.892211 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0421  peroxiredoxin  45.89 
 
 		 217 aa  171  7.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0972949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1762  peroxiredoxin  45.89 
 
 		 217 aa  171  7.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.336606  normal  0.0393088 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1410  peroxidase  43.3 
 
 		 212 aa  170  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0492  peroxiredoxin  45.45 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.081917  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3339  peroxidase  45.41 
 
 		 213 aa  168  5e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0177487 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0780  putative peroxiredoxin  41.43 
 
 		 232 aa  165  5.9999999999999996e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.467481  normal  0.867368 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1436  peroxidase  46.63 
 
 		 213 aa  164  8e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00490504  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10223  putative 1-Cys peroxiredoxin (Eurofung)  42.5 
 
 		 213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0264885  normal  0.0244812 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1677  putative antioxidant protein  41.5 
 
 		 212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0938194  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4131  1-cysteine peroxiredoxin  41.31 
 
 		 217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0498  1-Cys peroxiredoxin  43.81 
 
 		 217 aa  162  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.294681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19490  putative antioxidant protein  41.5 
 
 		 212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1525  putative peroxiredoxin  45.4 
 
 		 215 aa  162  4.0000000000000004e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.22907 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0181  peroxidase  42.23 
 
 		 217 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0667  peroxidase  41.58 
 
 		 212 aa  162  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0456031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0696  1-Cys peroxiredoxin  41.58 
 
 		 212 aa  161  6e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.835421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4192  Peroxidase  41.55 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0504041 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2363  peroxidase  41.71 
 
 		 212 aa  159  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.41044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0179  1-Cys peroxiredoxin  42.35 
 
 		 210 aa  159  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03973  mitochondrial peroxiredoxin (Eurofung)  43.78 
 
 		 261 aa  158  6e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.24863  normal  0.436872 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0235  peroxidase  41.5 
 
 		 212 aa  158  6e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000145183 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0250  peroxidase  41.5 
 
 		 212 aa  158  6e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.024588  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0254  peroxidase  41 
 
 		 217 aa  158  6e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6623  peroxidase  40.67 
 
 		 218 aa  158  7e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2449  1-Cys peroxiredoxin  40.2 
 
 		 211 aa  157  8e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.642142  hitchhiker  0.00248484 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3666  peroxidase  46.59 
 
 		 208 aa  157  8e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.771523 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0864  Peroxidase  44.39 
 
 		 210 aa  157  9e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.130383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0259  peroxidase  41.5 
 
 		 212 aa  157  9e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4257  Peroxidase  39.69 
 
 		 211 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111731 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2963  Peroxidase  41.5 
 
 		 213 aa  157  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4218  Peroxidase  39.69 
 
 		 211 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4977  peroxidase  41.5 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000215393  normal  0.0527952 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>