More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1240 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1240  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 282 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4005  enoyl-CoA hydratase  93.97 
 
 		 282 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0939626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1431  enoyl-CoA hydratase  93.26 
 
 		 282 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1612  enoyl-CoA hydratase  55.51 
 
 		 298 aa  290  1e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2616  enoyl-CoA hydratase  56.32 
 
 		 281 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.807591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2815  enoyl-CoA hydratase  53.26 
 
 		 281 aa  268  8e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.574844  hitchhiker  0.00311628 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2349  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.44 
 
 		 285 aa  266  4e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0950973  normal  0.0317155 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3837  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.87 
 
 		 300 aa  265  5.999999999999999e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4614  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.23 
 
 		 283 aa  260  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2156  enoyl-CoA hydratase  50.61 
 
 		 318 aa  255  7e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1560  enoyl-CoA hydratase  53.06 
 
 		 295 aa  254  9e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1434  enoyl-CoA hydratase  53.06 
 
 		 308 aa  248  7e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.193072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1018  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.09 
 
 		 297 aa  243  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0929  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.67 
 
 		 312 aa  241  1e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11964  enoyl-CoA hydratase  48.46 
 
 		 318 aa  229  4e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0111135  normal  0.793618 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4219  enoyl-CoA hydratase  48.59 
 
 		 260 aa  228  6e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851396 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2433  enoyl-CoA hydratase  49 
 
 		 260 aa  228  8e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.707416  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1621  enoyl-CoA hydratase  49.41 
 
 		 302 aa  224  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3765  enoyl-CoA hydratase  46.97 
 
 		 260 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3753  enoyl-CoA hydratase  48.78 
 
 		 260 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.252883  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4005  enoyl-CoA hydratase  48.58 
 
 		 302 aa  223  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3753  enoyl-CoA hydratase  49.01 
 
 		 299 aa  224  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3826  enoyl-CoA hydratase  48.78 
 
 		 260 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.969771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2067  enoyl-CoA hydratase  50.19 
 
 		 278 aa  223  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2709  enoyl-CoA hydratase  46.07 
 
 		 264 aa  222  7e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4297  enoyl-CoA hydratase  44.94 
 
 		 263 aa  219  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5190  enoyl-CoA hydratase  46.4 
 
 		 301 aa  218  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543929  normal  0.0605962 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4607  enoyl-CoA hydratase  47.91 
 
 		 298 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.995784  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4695  enoyl-CoA hydratase  47.91 
 
 		 298 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.325872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4990  enoyl-CoA hydratase  47.53 
 
 		 298 aa  212  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.493737 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1568  enoyl-CoA hydratase  46.04 
 
 		 301 aa  212  5.999999999999999e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.562799  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2924  enoyl-CoA hydratase  48.15 
 
 		 269 aa  211  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0841  enoyl-CoA hydratase  41.07 
 
 		 272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0920701 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1977  enoyl-CoA hydratase  42.8 
 
 		 267 aa  196  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.793656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0700  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.11 
 
 		 290 aa  142  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0515033  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0806  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.63 
 
 		 273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0669988  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4601  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.89 
 
 		 256 aa  139  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1028  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.21 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  34.24 
 
 		 264 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.69 
 
 		 260 aa  135  9e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.83 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2111  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.32 
 
 		 265 aa  127  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0534343 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6879  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 		 297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1016  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.62 
 
 		 255 aa  126  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4085  enoyl-CoA hydratase  36.64 
 
 		 276 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.285482  normal  0.481509 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.95 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0810  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.8 
 
 		 269 aa  124  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748292  normal  0.305394 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.08 
 
 		 260 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4992  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.43 
 
 		 272 aa  123  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  33.08 
 
 		 261 aa  122  8e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.55 
 
 		 260 aa  122  8e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.82 
 
 		 253 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.2 
 
 		 275 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342669  normal  0.157988 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3350  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.97 
 
 		 273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.219345 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  33.75 
 
 		 662 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.94 
 
 		 260 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  32.72 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3104  enoyl-CoA hydratase  32.05 
 
 		 275 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19279  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  34.11 
 
 		 659 aa  119  6e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  32.08 
 
 		 662 aa  119  7e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.84 
 
 		 260 aa  117  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2694  enoyl-CoA hydratase  31.76 
 
 		 275 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2705  enoyl-CoA hydratase  33.76 
 
 		 275 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.492104  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  32.77 
 
 		 259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  32.37 
 
 		 251 aa  116  5e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33170  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  34.82 
 
 		 251 aa  116  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.119109  normal  0.701419 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  32.57 
 
 		 259 aa  116  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0730  enoyl-CoA hydratase  35.09 
 
 		 270 aa  115  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.365771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1484  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.14 
 
 		 260 aa  115  7.999999999999999e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1713  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.67 
 
 		 252 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.47 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1171  enoyl-CoA hydratase  33.63 
 
 		 266 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277406  normal  0.140029 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  33.21 
 
 		 661 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1938  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.95 
 
 		 271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.76 
 
 		 258 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  33.33 
 
 		 662 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5872  enoyl-CoA hydratase  34.58 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4553  enoyl-CoA hydratase  35.61 
 
 		 261 aa  113  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0511055  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2180  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.29 
 
 		 264 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.06 
 
 		 259 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.47 
 
 		 257 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  27.72 
 
 		 262 aa  113  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2037  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.62 
 
 		 264 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4005  enoyl-CoA hydratase  36.02 
 
 		 300 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.248977  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3358  methylglutaconyl-CoA hydratase  33.2 
 
 		 263 aa  112  6e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4110  short chain enoyl-CoA hydratase  30.65 
 
 		 265 aa  112  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.741375  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2669  enoyl-CoA hydratase  34.62 
 
 		 275 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.68 
 
 		 263 aa  112  8.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.35 
 
 		 266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3726  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.5 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.297829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2014  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.23 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162316  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.85 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  34.43 
 
 		 260 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.29 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3179  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.29 
 
 		 275 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608848  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.64 
 
 		 257 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3644  enoyl-CoA hydratase  33.95 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.19 
 
 		 264 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.64 
 
 		 257 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4044  enoyl-CoA hydratase  32.3 
 
 		 267 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.987493  normal  0.461417 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>