More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0832 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0832  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 125 aa  241  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155773  normal  0.875827 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0941  response regulator receiver  91.06 
 
 		 125 aa  220  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5220  response regulator receiver protein  87.2 
 
 		 126 aa  216  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0665  response regulator receiver domain-containing protein  81.3 
 
 		 127 aa  195  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.709306  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1174  putative two-component response regulator  80.33 
 
 		 126 aa  193  8.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289144  normal  0.876478 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0574  response regulator receiver  79.2 
 
 		 130 aa  191  3e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.4385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4869  response regulator receiver domain-containing protein  78.57 
 
 		 123 aa  175  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.337506  normal  0.697748 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3997  response regulator receiver protein  68.6 
 
 		 121 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0883649 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3086  response regulator receiver protein  66.12 
 
 		 121 aa  163  8e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.342425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2860  response regulator receiver  66.12 
 
 		 121 aa  163  8e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.388237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2980  response regulator receiver protein  65.29 
 
 		 121 aa  161  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2198  response regulator receiver protein  65.57 
 
 		 127 aa  159  9e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.16592  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1157  response regulator receiver protein  65.57 
 
 		 127 aa  159  9e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116971  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4023  two component response regulator  60.33 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3569  response regulator receiver protein  60.33 
 
 		 119 aa  133  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3862  response regulator receiver protein  59.5 
 
 		 119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.762525  normal  0.105944 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1598  response regulator receiver protein  55.2 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2540  response regulator receiver protein  61.16 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.676292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3094  response regulator receiver protein  52.07 
 
 		 121 aa  124  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2507  response regulator receiver protein  42.15 
 
 		 121 aa  86.3  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0513  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.17 
 
 		 803 aa  80.9  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.883754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3138  two component transcriptional regulator  38.4 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1777  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 465 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1446  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.02 
 
 		 811 aa  77.8  0.00000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2109  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.7 
 
 		 515 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1998  response regulator receiver protein  45.16 
 
 		 120 aa  77.4  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000230643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2786  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.19 
 
 		 480 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.543097  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0831  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.81 
 
 		 957 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0142  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.6 
 
 		 221 aa  75.1  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0504  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 443 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0612  response regulator  38.84 
 
 		 120 aa  75.1  0.0000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.124392  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3739  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.66 
 
 		 379 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3108  response regulator receiver domain-containing protein  41.28 
 
 		 120 aa  74.3  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2379  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 446 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.373235  normal  0.0399931 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  40.91 
 
 		 619 aa  73.9  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3634  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.66 
 
 		 379 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0261897  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0852  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 		 1055 aa  73.9  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0537  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.61 
 
 		 446 aa  73.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0533  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.61 
 
 		 443 aa  73.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.141325  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0302  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.8 
 
 		 221 aa  73.9  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 556 aa  73.9  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.936608  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0135  response regulator receiver protein  43.36 
 
 		 124 aa  73.6  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 556 aa  73.6  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.12815  normal  0.758765 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.44 
 
 		 237 aa  73.6  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1278  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 452 aa  73.2  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.902353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2816  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101903  normal  0.104606 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0797  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.33 
 
 		 472 aa  72.8  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1405  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.96 
 
 		 478 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000117702 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2666  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.89 
 
 		 459 aa  72.8  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1655  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 462 aa  72.8  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000025661  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2805  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.96 
 
 		 478 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.228775  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.83 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000555295  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2837  response regulator receiver protein  35.25 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000598352 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2719  response regulator receiver protein  39.02 
 
 		 120 aa  72.8  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0959171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1971  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.9 
 
 		 473 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0887215  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2145  two component signal transduction response regulator  35.04 
 
 		 492 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4372  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.61 
 
 		 641 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.755089  normal  0.0153537 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0863  response regulator receiver protein  43.44 
 
 		 118 aa  72.8  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.385882 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2056  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.9 
 
 		 473 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.732718  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0224  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.82 
 
 		 379 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1397  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35 
 
 		 458 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1908  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 473 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1727  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.89 
 
 		 793 aa  72  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4284  response regulator receiver protein  39.52 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0043  response regulator  39.52 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.868286  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1088  two component transcriptional regulator  37.82 
 
 		 264 aa  71.2  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237646 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0040  response regulator  39.52 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3603  response regulator receiver protein  28.93 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.656399  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0436  response regulator receiver protein  32.31 
 
 		 370 aa  71.2  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2629  two component signal transduction response regulator  37.29 
 
 		 238 aa  70.5  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2576  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 		 840 aa  70.5  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0149194 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0313  response regulator receiver protein  34.68 
 
 		 203 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1287  response regulator receiver domain-containing protein  39.64 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.442215  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2750  response regulator receiver protein  38.84 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000684047  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3738  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.53 
 
 		 384 aa  70.5  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1924  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.96 
 
 		 225 aa  70.5  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3461  histidine kinase  42.62 
 
 		 533 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3139  histidine kinase  42.62 
 
 		 533 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468681  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4629  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.17 
 
 		 841 aa  70.5  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5491  cell cycle control histidine kinase CckA  32.77 
 
 		 892 aa  70.5  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0853  sensor histidine kinase/reponse regulator  29.66 
 
 		 845 aa  70.5  0.000000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00134282  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2316  response regulator receiver protein  36.04 
 
 		 226 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000147543  hitchhiker  0.000888492 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0043  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 118 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0842812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0010  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 		 508 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0502065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0202  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 		 374 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101669 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3600  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 118 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.11211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3474  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 118 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.790484 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1260  response regulator receiver protein  36.51 
 
 		 331 aa  70.1  0.000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.208704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3276  response regulator receiver  38.52 
 
 		 118 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1170  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.82 
 
 		 220 aa  70.1  0.000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.454571 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4779  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.4 
 
 		 494 aa  69.7  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0323  response regulator receiver protein  37.96 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.47332  normal  0.784994 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2795  two component transcriptional regulator  35.83 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0114  Signal transduction histidine kinase  40.18 
 
 		 939 aa  69.3  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.153209 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2802  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.05 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.204502 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5387  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.23 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2976  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.19 
 
 		 889 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.29382  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2575  sensor histidine kinase/response regulator  35.48 
 
 		 850 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3334  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2310  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.89 
 
 		 469 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.294968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>