More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1088 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1088  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 264 aa  532  1e-150  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237646 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2795  two component transcriptional regulator  95.45 
 
 		 266 aa  516  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2217  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.12 
 
 		 276 aa  333  2e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00294817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0818  two component transcriptional regulator  53.44 
 
 		 267 aa  278  6e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000529672  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0593  two component transcriptional regulator  37.88 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.501754 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3160  two component transcriptional regulator  35.77 
 
 		 295 aa  142  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.272458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2305  two component transcriptional regulator  34.87 
 
 		 263 aa  140  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.58 
 
 		 239 aa  140  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0260801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4161  two component transcriptional regulator  36.68 
 
 		 271 aa  139  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3703  two component transcriptional regulator  35.57 
 
 		 232 aa  138  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.0884672 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.33 
 
 		 235 aa  136  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  32.42 
 
 		 239 aa  135  9e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  32.42 
 
 		 239 aa  135  9e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.11 
 
 		 243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1367  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.52 
 
 		 230 aa  133  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000177207  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3637  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.43 
 
 		 246 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4049  two component transcriptional regulator  34.75 
 
 		 229 aa  132  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  34.77 
 
 		 240 aa  132  7.999999999999999e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0095  two component transcriptional regulator  34.87 
 
 		 249 aa  131  9e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03947  osmolarity response regulator  33.84 
 
 		 240 aa  131  9e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0461  two component transcriptional regulator  32.94 
 
 		 248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.735267  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4687  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.59 
 
 		 230 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000280381  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.95 
 
 		 247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  32.95 
 
 		 242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1963  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.05 
 
 		 246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.470012 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1936  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.05 
 
 		 246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  32.94 
 
 		 227 aa  130  3e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  32.94 
 
 		 226 aa  130  3e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4937  two component transcriptional regulator  35.07 
 
 		 257 aa  130  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  34.5 
 
 		 242 aa  130  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0155  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0636837 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6757  two component transcriptional regulator  35.38 
 
 		 239 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.250889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1561  two component transcriptional regulator  35.38 
 
 		 239 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0165  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 243 aa  129  6e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6268  two component transcriptional regulator  35.38 
 
 		 239 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.350192  normal  0.482642 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0174  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 243 aa  129  6e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0191  two component transcriptional regulator  32.55 
 
 		 244 aa  129  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1498  two component transcriptional regulator  35.27 
 
 		 247 aa  129  7.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6809  two component transcriptional regulator  35 
 
 		 277 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.867301 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4619  two component transcriptional regulator  32.57 
 
 		 245 aa  128  9.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  33.98 
 
 		 236 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5207  winged helix family two component transcriptional regulator  34.88 
 
 		 247 aa  128  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_926  two-component system, OmpR family, response regulator  32.16 
 
 		 227 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00200634  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2302  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.95 
 
 		 243 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0815  two component transcriptional regulator  33.71 
 
 		 248 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.348891 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2353  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.95 
 
 		 243 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4496  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3871  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.86 
 
 		 227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000473157  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  31.62 
 
 		 239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0421  two component transcriptional regulator  33.07 
 
 		 245 aa  126  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0518956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 237 aa  126  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5358  two component transcriptional regulator  34.23 
 
 		 272 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  30.31 
 
 		 239 aa  125  5e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0258  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.98 
 
 		 236 aa  125  6e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.606292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4206  osmolarity response regulator  32.17 
 
 		 241 aa  125  7e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4338  osmolarity response regulator  32.17 
 
 		 241 aa  125  7e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4134  osmolarity response regulator  32.17 
 
 		 241 aa  125  7e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3846  osmolarity response regulator  32.56 
 
 		 241 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3538  osmolarity response regulator  31.18 
 
 		 240 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000279148  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2067  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.44 
 
 		 233 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000016314  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5550  two component transcriptional regulator  34.23 
 
 		 239 aa  125  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001870  two-component system response regulator OmpR  31.42 
 
 		 239 aa  125  9e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.360284  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5785  two component transcriptional regulator  34.23 
 
 		 239 aa  125  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.281368 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2121  osmolarity response regulator  31.06 
 
 		 248 aa  125  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.201602  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2193  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.73 
 
 		 237 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0620475  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.11 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1173  two component transcriptional regulator  33.46 
 
 		 266 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.761417  normal  0.802826 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  32.68 
 
 		 243 aa  124  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0817018 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  31.08 
 
 		 234 aa  125  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01511  two-component response regulator  32.03 
 
 		 248 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.08 
 
 		 237 aa  124  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4483  two component transcriptional regulator  35.18 
 
 		 226 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.759432  decreased coverage  0.000734691 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00621  osmolarity response regulator  31.54 
 
 		 239 aa  123  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.65 
 
 		 233 aa  123  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0225  osmolarity response regulator  31.78 
 
 		 240 aa  124  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2286  osmolarity response regulator  31.15 
 
 		 240 aa  124  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  33.33 
 
 		 239 aa  123  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  33.33 
 
 		 239 aa  123  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0937  two component transcriptional regulator  33.46 
 
 		 227 aa  123  3e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.834094  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0136  two component transcriptional regulator  31.64 
 
 		 248 aa  123  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0543  two component transcriptional regulator  33.97 
 
 		 241 aa  123  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  32.83 
 
 		 234 aa  123  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01531  two-component response regulator  31.64 
 
 		 248 aa  123  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  32.95 
 
 		 239 aa  123  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  33.72 
 
 		 229 aa  122  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4633  osmolarity response regulator  31.4 
 
 		 241 aa  122  5e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1453  two component transcriptional regulator  32.56 
 
 		 244 aa  122  5e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.952418  normal  0.0249242 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2416  two component transcriptional regulator  32.81 
 
 		 255 aa  122  5e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0279623 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4017  osmolarity response regulator  32.17 
 
 		 241 aa  122  5e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1009  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.73 
 
 		 235 aa  122  5e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0833578 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01621  two-component response regulator  31.64 
 
 		 248 aa  122  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.367767  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3742  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.11 
 
 		 263 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.27 
 
 		 247 aa  122  6e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.520505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0834  two component transcriptional regulator  33.73 
 
 		 226 aa  122  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.6033  unclonable  0.00000000040546 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  34.11 
 
 		 239 aa  122  7e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  34.11 
 
 		 239 aa  122  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3661  two component transcriptional regulator  34.39 
 
 		 226 aa  122  7e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.394742  normal  0.594777 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  34.11 
 
 		 239 aa  122  7e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2384  two component transcriptional regulator  33.2 
 
 		 259 aa  122  7e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>