More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2917 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2917  non-specific protein-tyrosine kinase  100 
 
 		 268 aa  547  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.513725 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2727  non-specific protein-tyrosine kinase  80.3 
 
 		 268 aa  441  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0484786  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3128  protein-tyrosine kinase  79.93 
 
 		 268 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2587  non-specific protein-tyrosine kinase  79.93 
 
 		 268 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1016  hypothetical protein  39.32 
 
 		 259 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.959397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4787  chromosome partitioning ATPase  32.14 
 
 		 255 aa  143  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2583  tyrosine-protein kinase  35.45 
 
 		 295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1447  chromosome partitioning ATPase  34.09 
 
 		 392 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2579  non-specific protein-tyrosine kinase  32.03 
 
 		 330 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2406  chromosome partitioning ATPase  33.81 
 
 		 261 aa  128  8.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4240  chromosome partitioning ATPase protein-like  29.55 
 
 		 285 aa  125  8.000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.335949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3389  chromosome partitioning ATPase  31.1 
 
 		 276 aa  122  6e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2410  exopolysaccharide biosynthesis domain-containing protein  34.62 
 
 		 333 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.475738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2028  polysaccharide biosynthesis protein, putative  33.33 
 
 		 283 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.150521 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0283  protein-tyrosine kinase  32.95 
 
 		 306 aa  107  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0146  hypothetical protein  29.13 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1983  polysaccharide biosynthesis protein, putative  32.45 
 
 		 281 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2220  capsular exopolysaccharide family  37.43 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105344  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2390  Non-specific protein-tyrosine kinase  31.2 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  33.16 
 
 		 739 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2507  hypothetical protein  30.47 
 
 		 297 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.744329 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  33.16 
 
 		 739 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  33.16 
 
 		 739 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  33.16 
 
 		 739 aa  102  7e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2476  capsular exopolysaccharide family  35.09 
 
 		 294 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1771  exopolysaccharide/PEPCTERM locus tyrosine autokinase  34.5 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1168  protein-tyrosine kinase  37.08 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1520  hypothetical protein  34.48 
 
 		 332 aa  99.8  5e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00579805  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  34.67 
 
 		 464 aa  99  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2363  non-specific protein-tyrosine kinase  33.9 
 
 		 275 aa  98.6  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  33.33 
 
 		 741 aa  98.2  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  33.33 
 
 		 741 aa  96.3  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  33.33 
 
 		 741 aa  96.3  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  33.33 
 
 		 741 aa  96.3  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  33.33 
 
 		 741 aa  95.5  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1597  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  30.63 
 
 		 739 aa  95.5  8e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  33.33 
 
 		 741 aa  95.5  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4095  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.38 
 
 		 730 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.136228 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22230  Non-specific protein-tyrosine kinase  35.62 
 
 		 217 aa  93.6  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  32.83 
 
 		 741 aa  93.6  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1122  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32.98 
 
 		 780 aa  93.2  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0660  protein-tyrosine kinase  30.71 
 
 		 323 aa  93.2  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.475432  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02601  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  34.1 
 
 		 299 aa  91.7  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.067455  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.16 
 
 		 730 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6487  hypothetical protein  32.46 
 
 		 781 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.907329 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0586  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  31.89 
 
 		 288 aa  90.9  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898797 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  31.47 
 
 		 217 aa  90.9  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2473  polysaccharide biosynthesis protein, putative  30.77 
 
 		 282 aa  90.5  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  31.47 
 
 		 217 aa  90.1  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4084  acetyltransferase  32.32 
 
 		 733 aa  89.7  5e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.182153  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2533  protein-tyrosine kinase  34.1 
 
 		 802 aa  89.7  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.152743 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2653  hypothetical protein  28.57 
 
 		 249 aa  89.7  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5027  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  31.58 
 
 		 257 aa  89  8e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  31.66 
 
 		 740 aa  88.2  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3280  protein-tyrosine kinase  33.51 
 
 		 314 aa  86.7  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0946  protein-tyrosine kinase  30.37 
 
 		 443 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.484543  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0964  lipopolysaccharide biosynthesis  30.37 
 
 		 497 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  35 
 
 		 720 aa  86.7  4e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3874  capsular exopolysaccharide family  31.5 
 
 		 778 aa  86.3  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0660  exopolysaccharide transport protein family  32.43 
 
 		 776 aa  86.3  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491274  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  31.46 
 
 		 454 aa  86.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1434  tyrosine-protein kinase  30.46 
 
 		 252 aa  85.9  6e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  30.65 
 
 		 732 aa  85.5  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2399  exopolysaccharide biosynthesis protein  25.94 
 
 		 323 aa  85.5  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.169574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4355  capsular exopolysaccharide family  30 
 
 		 767 aa  85.5  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.672208  normal  0.663682 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  30.23 
 
 		 508 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1116  lipopolysaccharide biosynthesis  33.52 
 
 		 741 aa  84.7  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0704492 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1251  non-specific protein-tyrosine kinase  33.51 
 
 		 754 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1943  protein-tyrosine kinase  33.17 
 
 		 239 aa  85.1  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.641105  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3507  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  32.16 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000503243 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3119  chromosome partitioning ATPase protein-like  27.36 
 
 		 335 aa  84  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  30.24 
 
 		 496 aa  84.3  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3056  protein-tyrosine kinase  32.97 
 
 		 772 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29900  Protein-tyrosine kinase wzz family protein  31.67 
 
 		 734 aa  84.3  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.131777  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  32.8 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  32.39 
 
 		 490 aa  83.6  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  32.28 
 
 		 474 aa  84  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  33.68 
 
 		 524 aa  83.2  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3694  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.99 
 
 		 726 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5844  protein-tyrosine kinase  32.34 
 
 		 780 aa  83.2  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1126  capsular exopolysaccharide family  32.66 
 
 		 790 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0796389  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  32.42 
 
 		 782 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2662  capsular exopolysaccharide family  32.46 
 
 		 726 aa  82  0.000000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.149577  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2334  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  32.46 
 
 		 726 aa  82  0.000000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1097  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  32.46 
 
 		 726 aa  82  0.000000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653674  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00984  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  32.46 
 
 		 726 aa  82  0.000000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616626  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  30.53 
 
 		 466 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2615  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  32.46 
 
 		 726 aa  82  0.000000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662631  normal  0.0600868 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00991  hypothetical protein  32.46 
 
 		 726 aa  82  0.000000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.486912  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  30.37 
 
 		 726 aa  82  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1217  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  32.46 
 
 		 726 aa  82  0.000000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1090  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  32.46 
 
 		 726 aa  82  0.000000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6733  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32.37 
 
 		 800 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  33.33 
 
 		 615 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1420  capsular exopolysaccharide family  32.07 
 
 		 229 aa  81.6  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0943338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2527  capsular polysaccharide biosynthesis-like protein  30.51 
 
 		 265 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.408161  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  32.26 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  30.89 
 
 		 492 aa  80.5  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  30.17 
 
 		 721 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  32.85 
 
 		 463 aa  80.5  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>