More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3256 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  100 
 
 		 228 aa  457  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  70.04 
 
 		 231 aa  326  1.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  68.42 
 
 		 230 aa  322  3e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  67.84 
 
 		 230 aa  315  5e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  67.84 
 
 		 237 aa  310  1e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  68.42 
 
 		 228 aa  301  7.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  67.84 
 
 		 231 aa  295  5e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  58.15 
 
 		 228 aa  260  1e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  50.22 
 
 		 227 aa  224  1e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  50.22 
 
 		 229 aa  214  9e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  46.75 
 
 		 235 aa  212  2.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  49.12 
 
 		 226 aa  212  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2739  alanine racemase domain protein  51.33 
 
 		 231 aa  210  1e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0478  hypothetical protein  50.44 
 
 		 229 aa  210  2e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  51.1 
 
 		 234 aa  208  7e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  49.78 
 
 		 231 aa  205  4e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  50.22 
 
 		 229 aa  203  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  46.02 
 
 		 234 aa  202  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  44.93 
 
 		 224 aa  202  3e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  47.6 
 
 		 229 aa  201  7e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  44.1 
 
 		 235 aa  200  9.999999999999999e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  50.44 
 
 		 232 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2910  alanine racemase domain-containing protein  49.78 
 
 		 242 aa  197  9e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000373899  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3884  hypothetical protein  50.22 
 
 		 229 aa  195  4.0000000000000005e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.508799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1802  alanine racemase domain protein  49.34 
 
 		 229 aa  195  4.0000000000000005e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1350  hypothetical protein  48.91 
 
 		 229 aa  195  5.000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  48.03 
 
 		 237 aa  195  6e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  47.58 
 
 		 228 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1784  alanine racemase domain-containing protein  50.64 
 
 		 241 aa  193  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  44.89 
 
 		 225 aa  192  4e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  46.93 
 
 		 234 aa  192  4e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  49.35 
 
 		 237 aa  191  8e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2011  alanine racemase domain protein  45.18 
 
 		 220 aa  190  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  44.1 
 
 		 230 aa  188  5e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  42.92 
 
 		 235 aa  188  5e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  43.36 
 
 		 235 aa  187  8e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4047  alanine racemase domain protein  44.05 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0138922  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  45.95 
 
 		 275 aa  187  1e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2919  alanine racemase domain protein  48.25 
 
 		 236 aa  187  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489919  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  47.58 
 
 		 236 aa  186  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2208  alanine racemase domain protein  45.24 
 
 		 272 aa  186  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.834769 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1414  alanine racemase domain-containing protein  49.34 
 
 		 234 aa  186  3e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000108104  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1789  alanine racemase domain protein  47.14 
 
 		 246 aa  185  4e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  46.72 
 
 		 235 aa  186  4e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  44.98 
 
 		 227 aa  185  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  46.22 
 
 		 235 aa  185  6e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  44.54 
 
 		 223 aa  184  8e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  46.05 
 
 		 229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  47.16 
 
 		 241 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  45.81 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  47.83 
 
 		 231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  48.02 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5046  hypothetical protein  46.7 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166269  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  46.32 
 
 		 244 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  47.35 
 
 		 232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  40.96 
 
 		 253 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3003  hypothetical protein  47.79 
 
 		 231 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  46.49 
 
 		 229 aa  181  7e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  46.93 
 
 		 229 aa  180  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2687  alanine racemase domain-containing protein  43.48 
 
 		 232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.91415  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2937  hypothetical protein  49.12 
 
 		 229 aa  179  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3607  alanine racemase domain protein  43.72 
 
 		 237 aa  178  4.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.94886  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  44.44 
 
 		 244 aa  178  4.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1338  alanine racemase domain protein  45.22 
 
 		 239 aa  177  9e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300901  hitchhiker  0.000000312862 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3352  hypothetical protein  43.23 
 
 		 237 aa  177  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1288  hypothetical protein  49.12 
 
 		 232 aa  177  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3025  alanine racemase domain-containing protein  44.78 
 
 		 232 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116618  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0372  alanine racemase domain protein  44.92 
 
 		 237 aa  176  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1539  alanine racemase domain-containing protein  43.05 
 
 		 228 aa  176  2e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.237332  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0668  hypothetical protein  44.49 
 
 		 236 aa  176  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3183  alanine racemase domain-containing protein  45.22 
 
 		 232 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000633261  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3981  hypothetical protein  48.9 
 
 		 232 aa  176  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0543  membrane protein, related to K+ transport  41.81 
 
 		 255 aa  176  3e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002457  hypothetical protein  41.99 
 
 		 233 aa  176  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  46.26 
 
 		 228 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1232  alanine racemase domain-containing protein  42.36 
 
 		 234 aa  176  4e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  normal  0.432188 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0247  hypothetical protein  50.88 
 
 		 239 aa  175  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2860  hypothetical protein  40.77 
 
 		 228 aa  175  5e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0731  hypothetical protein  50.88 
 
 		 239 aa  175  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18938  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0699  alanine racemase domain-containing protein  50.88 
 
 		 232 aa  174  7e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.239195  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1661  alanine racemase domain protein  48.25 
 
 		 244 aa  174  8e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.19823 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1194  hypothetical protein  42.06 
 
 		 238 aa  174  8e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.680899 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1264  hypothetical protein  42.79 
 
 		 238 aa  174  9e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00567806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1116  alanine racemase domain protein  45.27 
 
 		 219 aa  174  9e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0312206  normal  0.913907 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  40.27 
 
 		 233 aa  174  9e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  46.89 
 
 		 213 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3040  alanine racemase domain-containing protein  44.78 
 
 		 232 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000913695  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  43.17 
 
 		 228 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3759  hypothetical protein  46.52 
 
 		 238 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.125293  normal  0.217424 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1332  alanine racemase domain-containing protein  41.92 
 
 		 244 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993906 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2378  alanine racemase domain protein  44.96 
 
 		 245 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1857  alanine racemase domain protein  47.37 
 
 		 247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.821186 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3590  hypothetical protein  45.99 
 
 		 248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0760  alanine racemase domain protein  43.35 
 
 		 241 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  44.93 
 
 		 228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2732  hypothetical protein  44.74 
 
 		 244 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.688712  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2415  alanine racemase domain protein  46.64 
 
 		 237 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1193  hypothetical protein  42.79 
 
 		 238 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03578  hypothetical protein  41.56 
 
 		 236 aa  172  3.9999999999999995e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0832  alanine racemase domain-containing protein  44.74 
 
 		 232 aa  172  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.399806  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>