More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0774 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0774  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
139 aa  277  3e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  73.19 
 
 
139 aa  217  3e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1977  heat shock protein Hsp20  67.39 
 
 
139 aa  200  6e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.334288  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2210  heat shock protein Hsp20  66.67 
 
 
139 aa  198  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0417447  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0250  HSP20 family protein  73.91 
 
 
139 aa  197  3e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.962825  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2159  heat shock protein Hsp20  72.46 
 
 
139 aa  196  9e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  51.15 
 
 
134 aa  136  7.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0622  HSP20 family protein  49.24 
 
 
132 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  47.33 
 
 
134 aa  128  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1892  HSP20 family protein  46.04 
 
 
132 aa  123  9e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.684879  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1706  heat shock protein Hsp20  41.98 
 
 
132 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00808314  hitchhiker  0.000432661 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0756  heat shock protein Hsp20  46.4 
 
 
132 aa  116  9e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.16256 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1695  heat shock protein Hsp20  40.16 
 
 
151 aa  100  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  39.68 
 
 
146 aa  99  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2938  heat shock protein Hsp20  42.52 
 
 
145 aa  98.2  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000491843  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2155  heat shock protein Hsp20  46.55 
 
 
132 aa  98.2  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  41.12 
 
 
146 aa  97.8  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  41.12 
 
 
146 aa  97.8  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  43.75 
 
 
145 aa  97.8  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2301  heat shock protein Hsp20  45.76 
 
 
142 aa  97.1  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46681  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  48.91 
 
 
147 aa  96.3  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  41.26 
 
 
141 aa  94.4  5e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  47.87 
 
 
147 aa  94  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  39.85 
 
 
147 aa  94  6e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  39.84 
 
 
148 aa  93.6  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1149  heat shock protein Hsp20  50 
 
 
140 aa  93.6  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1219  heat shock protein Hsp20  50 
 
 
140 aa  93.6  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
146 aa  93.6  8e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  39.85 
 
 
147 aa  93.2  9e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  43.56 
 
 
136 aa  93.2  1e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  39.13 
 
 
189 aa  93.2  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  40 
 
 
151 aa  92.4  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3125  heat shock protein Hsp20  46.49 
 
 
149 aa  92.4  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  40 
 
 
151 aa  92.4  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0513  heat shock protein Hsp20  38.89 
 
 
147 aa  90.9  6e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  42.39 
 
 
147 aa  90.5  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3113  heat shock protein Hsp20  41.8 
 
 
142 aa  89.7  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.800815  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  44.68 
 
 
147 aa  89.7  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1167  heat shock protein Hsp20  45.32 
 
 
149 aa  89.4  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2899  heat shock protein Hsp20  37.3 
 
 
145 aa  89.7  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0174584 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  39.32 
 
 
147 aa  88.6  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  40.98 
 
 
142 aa  89.4  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3917  heat shock protein Hsp20  41.96 
 
 
142 aa  89  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  46.94 
 
 
144 aa  89  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  40.35 
 
 
151 aa  89  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0391  heat shock protein Hsp20  45.37 
 
 
143 aa  88.6  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000478859  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2459  heat shock protein Hsp20  41.8 
 
 
142 aa  87.8  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.134169  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  51.09 
 
 
143 aa  87.4  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  33.82 
 
 
189 aa  87  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  36.15 
 
 
143 aa  87  8e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0588  heat shock protein, molecular chaperone  41.67 
 
 
141 aa  87  8e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.648467  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  35.48 
 
 
153 aa  86.3  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1743  heat shock protein Hsp20  38.51 
 
 
145 aa  85.9  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.49982  normal  0.0110244 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
189 aa  85.9  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  32.61 
 
 
189 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2086  heat shock protein, Hsp20 family  38.51 
 
 
145 aa  85.9  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  45.26 
 
 
143 aa  85.5  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  43.14 
 
 
148 aa  85.9  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0200  putative small HEAT shock protein  40.91 
 
 
140 aa  85.1  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.32202 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4514  heat shock protein Hsp20  40.15 
 
 
140 aa  84.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.165488  normal  0.480818 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4382  heat shock protein Hsp20  40.15 
 
 
140 aa  84.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  38.46 
 
 
153 aa  84.7  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  44.44 
 
 
144 aa  84.3  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  36.76 
 
 
150 aa  84.3  5e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6093  heat shock protein Hsp20  32.41 
 
 
187 aa  84.3  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6390  heat shock protein Hsp20  32.41 
 
 
187 aa  84.3  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.065602 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  32.61 
 
 
189 aa  84  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
158 aa  84  6e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2683  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
145 aa  84  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338339  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0630  heat shock protein Hsp20  39.2 
 
 
138 aa  83.6  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140987  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 
142 aa  83.6  9e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1199  heat shock protein Hsp20  39.37 
 
 
143 aa  83.6  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.76992  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2312  heat shock protein Hsp20  42.52 
 
 
149 aa  82.8  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  38.17 
 
 
204 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0320  heat shock protein Hsp20  50 
 
 
150 aa  83.2  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  40.87 
 
 
162 aa  82  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  36.54 
 
 
145 aa  82  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  39.42 
 
 
152 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
230 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1537  heat shock protein Hsp20  37.4 
 
 
142 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6892  heat shock protein Hsp20  30.43 
 
 
157 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  38.05 
 
 
149 aa  82.4  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0391  heat shock protein Hsp20  34.04 
 
 
151 aa  82  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  42.22 
 
 
148 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  43.48 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  30.3 
 
 
185 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0296  heat shock protein Hsp20  36.84 
 
 
156 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  38.78 
 
 
145 aa  80.9  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  37.72 
 
 
142 aa  80.9  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1165  heat shock protein Hsp20  46.39 
 
 
145 aa  80.9  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.245253  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  36.64 
 
 
194 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1368  heat shock molecular chaperone  35.14 
 
 
167 aa  80.1  0.000000000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  38.14 
 
 
145 aa  80.1  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  30.77 
 
 
185 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1292  heat shock protein Hsp20  43.48 
 
 
170 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0518729  normal  0.504399 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  38.14 
 
 
145 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0154  heat shock protein Hsp20  30.25 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184978  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  30.77 
 
 
185 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  36.97 
 
 
153 aa  79.7  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1660  heat shock protein Hsp20  42.72 
 
 
145 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.870911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>