75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0248 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0710  pentatricopeptide repeat containing protein  55.48 
 
 		 932 aa  791    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0248  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 793 aa  1616    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.57059  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1875  TPR repeat-containing protein  36.96 
 
 		 813 aa  472  1.0000000000000001e-131  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0297  TPR repeat-containing protein  30.33 
 
 		 922 aa  147  8.000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.276018  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1954  ATPase  29.73 
 
 		 673 aa  145  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.342143  normal  0.310254 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0486  TPR repeat-containing protein  29.74 
 
 		 965 aa  144  9e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0026  hypothetical protein  27.89 
 
 		 692 aa  137  8e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.252057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1789  hypothetical protein  28.92 
 
 		 581 aa  134  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0254074 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2442  ATPase  27.57 
 
 		 756 aa  130  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0657  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 811 aa  119  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.233938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4861  hypothetical protein  27.25 
 
 		 920 aa  92.4  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1120  putative transcriptional regulator  23.68 
 
 		 523 aa  80.1  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1867  MarR family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 369 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 		 1276 aa  72  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4868  MarR family transcriptional regulator  22.57 
 
 		 363 aa  67.4  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.440159  normal  0.306915 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  30.7 
 
 		 1694 aa  64.7  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 		 4489 aa  63.5  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 		 543 aa  62  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  25.5 
 
 		 4079 aa  61.2  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1019  TPR repeat-containing protein  24.69 
 
 		 273 aa  60.5  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  23.66 
 
 		 711 aa  60.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6891  hypothetical protein  23.08 
 
 		 972 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.715977 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  28.57 
 
 		 573 aa  60.1  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  25.93 
 
 		 635 aa  59.7  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  25.27 
 
 		 1979 aa  58.9  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  26.92 
 
 		 417 aa  57.8  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  27 
 
 		 927 aa  57.4  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  25.48 
 
 		 3560 aa  56.6  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  23.17 
 
 		 397 aa  55.5  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3961  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.04 
 
 		 1058 aa  54.3  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.357683  normal  0.258592 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  26.2 
 
 		 1094 aa  53.5  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  22.18 
 
 		 371 aa  53.9  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  24.55 
 
 		 730 aa  54.3  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.45 
 
 		 707 aa  54.3  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.35 
 
 		 292 aa  53.9  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  24.02 
 
 		 740 aa  53.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  23.56 
 
 		 955 aa  52.4  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  25.95 
 
 		 363 aa  52.8  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  26.58 
 
 		 344 aa  52.8  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  27.1 
 
 		 602 aa  52.8  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  24.22 
 
 		 391 aa  52.8  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  21.93 
 
 		 1138 aa  52.4  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  22.27 
 
 		 3035 aa  52  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  24.19 
 
 		 562 aa  50.4  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  25.31 
 
 		 356 aa  49.7  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3483  TPR repeat-containing protein  24.43 
 
 		 1054 aa  50.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  25.97 
 
 		 1056 aa  48.1  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  26.02 
 
 		 1007 aa  48.1  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.17 
 
 		 352 aa  47.8  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.913573  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  22.26 
 
 		 512 aa  47.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 608 aa  46.6  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  27.35 
 
 		 745 aa  47  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  29.56 
 
 		 681 aa  46.2  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  27.22 
 
 		 362 aa  46.2  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0216  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 		 296 aa  46.2  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  25.5 
 
 		 523 aa  45.8  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0354  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 684 aa  45.8  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.431996  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  22.34 
 
 		 465 aa  46.2  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.18 
 
 		 810 aa  45.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2954  TPR repeat-containing protein  23.55 
 
 		 468 aa  45.4  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  24.67 
 
 		 334 aa  45.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  24.29 
 
 		 761 aa  45.1  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  24.44 
 
 		 202 aa  45.4  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  23.58 
 
 		 462 aa  44.7  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1651  TPR domain-containing protein  30.23 
 
 		 995 aa  44.7  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.874566 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  27.56 
 
 		 654 aa  45.1  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0226  TPR repeat-containing protein  24.07 
 
 		 294 aa  44.7  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  26 
 
 		 764 aa  44.3  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  20 
 
 		 747 aa  44.3  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2398  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 		 287 aa  44.3  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  22.33 
 
 		 878 aa  44.3  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  27.1 
 
 		 560 aa  44.3  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  31.36 
 
 		 623 aa  44.3  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  22.78 
 
 		 436 aa  43.9  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>