137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4770 on replicon NC_008761
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008761  Pnap_4770  Tn5044 transposase  100 
 
 		 188 aa  387  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.653954 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5340  transposase  91.16 
 
 		 1009 aa  348  4e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4478  transposase Tn3 family protein  91.16 
 
 		 1009 aa  348  4e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000650614 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1476  transposase Tn3 family protein  91.16 
 
 		 1009 aa  348  4e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000034033 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1851  transposase Tn3 family protein  91.16 
 
 		 1009 aa  348  4e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000277691 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4353  transposase Tn3 family protein  88.95 
 
 		 1010 aa  343  1e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4490  transposase Tn3 family protein  88.95 
 
 		 1010 aa  343  1e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.666147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6457  transposase Tn3  87.85 
 
 		 1008 aa  326  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4638  transposase  64.1 
 
 		 118 aa  158  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.655234 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3470  transposase Tn3 family protein  41.24 
 
 		 1028 aa  150  8.999999999999999e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0192  transposase Tn3 family protein  41.24 
 
 		 1026 aa  150  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1989  transposase Tn3 family protein  41.24 
 
 		 1026 aa  150  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4556  transposase Tn3 family protein  41.24 
 
 		 1028 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.875652 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1962  transposase Tn3 family protein  40.98 
 
 		 929 aa  149  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0116  transposase Tn3 family protein  40.22 
 
 		 1018 aa  147  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3466  transposase Tn3 family protein  44.51 
 
 		 992 aa  143  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01406  Transposase Tn3  43.41 
 
 		 267 aa  144  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0215  transposase  40.45 
 
 		 1015 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.20757 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4112  transposase Tn3 family protein  40.35 
 
 		 1006 aa  135  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3479  Tn5044 transposase  45.21 
 
 		 156 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02954  transposase  44.52 
 
 		 156 aa  131  6.999999999999999e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0191401  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0051  hypothetical protein  30.86 
 
 		 1015 aa  97.8  7e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.107009  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6928  transposase Tn3 family protein  31.55 
 
 		 1027 aa  83.2  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1970  TnpA family transposase  26.02 
 
 		 1020 aa  73.6  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_24  transposase  29.19 
 
 		 1019 aa  69.7  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.207727  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  27.53 
 
 		 983 aa  70.5  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4311  TOBE domain-containing protein  26.51 
 
 		 573 aa  69.3  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5358  transposase Tn3 family protein  26.26 
 
 		 990 aa  68.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17398 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  27.5 
 
 		 772 aa  68.2  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.635368 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1226  transposase Tn3  25 
 
 		 993 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6606  transposase Tn3 family protein  25 
 
 		 993 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0187013 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  25 
 
 		 988 aa  65.5  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  25 
 
 		 988 aa  65.5  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  25.32 
 
 		 961 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  23.21 
 
 		 991 aa  65.5  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0072  transposase  24.69 
 
 		 546 aa  65.5  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.520579  normal  0.363066 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4134  transposase Tn3 family protein  28.89 
 
 		 1028 aa  64.7  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.160281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2367  transposase Tn3  29.46 
 
 		 815 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  29.68 
 
 		 988 aa  63.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  29.68 
 
 		 988 aa  63.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  29.68 
 
 		 988 aa  63.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0239  transposase  32.65 
 
 		 246 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2047  transposase  32.68 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  27.33 
 
 		 990 aa  61.2  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  25.58 
 
 		 988 aa  60.8  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  25.58 
 
 		 988 aa  60.8  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0202  transposase  31.33 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.295684  hitchhiker  6.17068e-17 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  26.67 
 
 		 990 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3347  transposase Tn3  26.67 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0077216  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  26.67 
 
 		 990 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5398  transposase Tn3 family protein  23.17 
 
 		 1029 aa  60.1  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0815937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0196  transposase  31.33 
 
 		 338 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2512  transposase Tn3  23.46 
 
 		 989 aa  59.7  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227381  normal  0.0913005 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  26.85 
 
 		 988 aa  59.3  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  26.85 
 
 		 989 aa  59.3  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  26.67 
 
 		 755 aa  59.3  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  26.85 
 
 		 988 aa  59.3  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  26.85 
 
 		 988 aa  59.3  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0079  transposase  27.56 
 
 		 435 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.776565  normal  0.783345 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  26.85 
 
 		 988 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00623  transposase  23.89 
 
 		 986 aa  59.3  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  26.67 
 
 		 990 aa  58.9  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  26.67 
 
 		 990 aa  58.9  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  26.67 
 
 		 990 aa  58.9  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  26.67 
 
 		 990 aa  58.9  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  22.56 
 
 		 999 aa  58.9  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6852  transposase Tn3 family protein  24.57 
 
 		 994 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  26.85 
 
 		 964 aa  58.5  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  27.52 
 
 		 988 aa  58.5  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  25.42 
 
 		 996 aa  58.2  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  25.42 
 
 		 996 aa  58.2  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  25.42 
 
 		 996 aa  58.2  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  25.42 
 
 		 996 aa  58.2  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  27.78 
 
 		 992 aa  57.8  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  26.97 
 
 		 924 aa  57.8  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  26.97 
 
 		 976 aa  58.2  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  27.03 
 
 		 988 aa  57.8  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5050  TnpA family transposase  26.85 
 
 		 264 aa  57  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0355  transposase  26.85 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4775  transposase Tn3 family protein  24.29 
 
 		 838 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.855357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  25.33 
 
 		 1015 aa  57  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  25.84 
 
 		 983 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  26.17 
 
 		 988 aa  56.6  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0025  transposase Tn3 family protein  24.86 
 
 		 1006 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  26 
 
 		 988 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0079  transposase Tn3 family protein  24.86 
 
 		 1006 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  25.44 
 
 		 988 aa  57  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  25.15 
 
 		 771 aa  57  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3718  transposase Tn3 family protein  27.97 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.396342  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  25.49 
 
 		 994 aa  55.5  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  25.49 
 
 		 550 aa  55.5  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  25.49 
 
 		 994 aa  55.5  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  25.49 
 
 		 862 aa  55.8  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2317  transposase Tn3  26 
 
 		 339 aa  54.7  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000027108  hitchhiker  0.0000324498 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  19.51 
 
 		 991 aa  54.7  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  19.51 
 
 		 991 aa  54.7  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5067  transposase Tn3 family protein  23.94 
 
 		 969 aa  54.7  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0388929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  25.6 
 
 		 994 aa  53.9  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  24.83 
 
 		 988 aa  54.3  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1576  transposase  23.78 
 
 		 203 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0122395  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>