153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4140 on replicon NC_008757
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008757  Pnap_4140  OmpW family protein  100 
 
 		 218 aa  429  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0330312  normal  0.117689 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1185  OmpW family outer membrane porin  98.77 
 
 		 185 aa  311  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3010  putative outer membrane protein W  40.83 
 
 		 208 aa  144  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0155  OmpW family protein  40 
 
 		 255 aa  134  8e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282496 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4877  OmpW family protein  36.59 
 
 		 251 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.913281  normal  0.338294 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2480  OmpW family protein  35.35 
 
 		 211 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.586592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5444  OmpW family protein  33.33 
 
 		 227 aa  115  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.230976  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1562  hypothetical protein  34.41 
 
 		 227 aa  90.1  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1510  hypothetical protein  34.41 
 
 		 227 aa  90.1  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0436  OmpW family protein  29.01 
 
 		 230 aa  89  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.322877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1603  OmpW family protein  32.26 
 
 		 227 aa  85.9  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0434  OmpW family protein  28.19 
 
 		 246 aa  85.1  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587861  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1968  OmpW family protein  31.94 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.135565 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4566  OmpW family protein  30.73 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5029  OmpW  31.03 
 
 		 232 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2534  outer membrane protein W  29.94 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000903  outer membrane protein W precursor  29.72 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0734  OmpW  27.6 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3800  outer membrane protein  26.06 
 
 		 233 aa  71.6  0.000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.550263  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06904  outer membrane protein W  29.58 
 
 		 213 aa  71.6  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4836  OmpW family protein  29.68 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2305  OmpW family protein  29.83 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.535052  normal  0.101902 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1392  outer membrane protein W  27.65 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00591184  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06590  OmpW family outer membrane porin  27.43 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0370  outer membrane protein W  29.94 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06610  OmpW family outer membrane porin  29.38 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1371  outer membrane protein W  27.8 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0573693 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3286  OmpW family protein  30.12 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208435  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0915  OmpW family protein  30.04 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3378  OmpW  30.34 
 
 		 241 aa  65.1  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.68852  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1673  outer membrane protein W  26.39 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0595  OmpW family protein  27.89 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.761797  hitchhiker  0.00324214 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00029  outer membrane protein OmpW  25.34 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0580  OmpW family protein  28.57 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2289  OmpW family protein  28.08 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.473084  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2790  OmpW family protein  26.69 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.888162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1585  OmpW family protein  28.08 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0979  OmpW family protein  28.16 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3221  OmpW family protein  33.71 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3545  OmpW family protein  33.71 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.506265 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0363  OmpW family outer membrane porin  27.31 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814411  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4324  OmpW  29.8 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.238365 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3207  outer membrane protein W  27.11 
 
 		 214 aa  62  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000387398  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3290  putative outer membrane signal peptide protein  29.67 
 
 		 196 aa  62  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.106393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0557  OmpW family protein  29.1 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.841642  normal  0.443014 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3094  OmpW family protein  28.5 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000267766  normal  0.518029 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4994  OmpW family protein  29.28 
 
 		 229 aa  61.6  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0976  OmpW family protein  31.17 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591363 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2787  outer membrane protein W  28.4 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0424619  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0504  OmpW family protein  29.1 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00488825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4473  OmpW  27.47 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2445  OmpW family protein  30.48 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.334993  normal  0.396638 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0946  putative outer membrane protein precursor of unknown function  28.29 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2589  outer membrane protein W  26.38 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000746821  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5426  OmpW  28.49 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73158  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1299  OmpW family protein  28.43 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0529248  normal  0.202577 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0549  OmpW family protein  28.57 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.742148 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0030  OmpW  28.49 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4394  OmpW  27.11 
 
 		 230 aa  58.2  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.140783 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3824  OmpW family protein  26.47 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2049  outer membrane protein W  26.25 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1940  outer membrane protein W  26.25 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.218273  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2322  outer membrane protein W  26.25 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0679  outer membrane protein OmpW  28.86 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0116  OmpW family protein  28.75 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0772399 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2554  outer membrane protein W  25.3 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3873  OmpW family protein  30.2 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.627912 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0539  OmpW family protein  28.04 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.870065 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1469  outer membrane protein W  27.62 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000900043  hitchhiker  0.0000643724 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2967  outer membrane signal peptide protein  28.96 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2507  outer membrane protein  30.77 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0804612  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1169  OmpW family protein  30.77 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.122792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2601  outer membrane protein W  25.35 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000011484  decreased coverage  0.0000000556975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2668  outer membrane protein W  25.35 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000483878  normal  0.0120446 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1334  outer membrane protein W  26.38 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000150593  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1086  OmpW family protein  29.8 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.832301 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3593  OmpW family protein  26.91 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192087  hitchhiker  0.00000065316 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3245  OmpW family protein  27.32 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5480  OmpW  26.24 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.479641 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1265  outer membrane protein precursor  28.22 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000128049  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2898  OmpW family protein  27.23 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1035  outer membrane protein OprG precursor  26.74 
 
 		 232 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2674  outer membrane protein W  28.3 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000169515 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01230  outer membrane protein W  25.15 
 
 		 212 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2392  OmpW family protein  25.15 
 
 		 212 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160177  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3350  putative outer membrane W signal peptide protein  27.87 
 
 		 241 aa  53.1  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1876  outer membrane protein W  25.15 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000262717 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2579  OmpW  29.83 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.793769  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2371  outer membrane protein W  25.15 
 
 		 212 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.535822  hitchhiker  0.00000160145 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4219  OmpW  28.03 
 
 		 229 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.922392 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0238  OmpW  30.43 
 
 		 209 aa  53.5  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01240  hypothetical protein  25.15 
 
 		 212 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1677  OmpW  33.74 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.673806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11270  outer membrane protein OprG precursor  26.74 
 
 		 232 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5285  OmpW family protein  26.52 
 
 		 245 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2000  outer membrane protein W  28.21 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1365  outer membrane protein W  25.15 
 
 		 212 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0200008  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0989  OmpW family protein  25.21 
 
 		 241 aa  52.8  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2180  outer membrane protein W  25.75 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.41802  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2299  outer membrane protein W  28.85 
 
 		 210 aa  51.6  0.000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>