More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3029 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3029  HpcH/HpaI aldolase  100 
 
 		 329 aa  670    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.37236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3597  HpcH/HpaI aldolase  87.08 
 
 		 356 aa  586  1e-166  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1434  HpcH/HpaI aldolase  73.91 
 
 		 332 aa  469  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2208  HpcH/HpaI aldolase  72.09 
 
 		 341 aa  461  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2431  HpcH/HpaI aldolase  67.18 
 
 		 339 aa  435  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2279  HpcH/HpaI aldolase  71.69 
 
 		 336 aa  431  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2789  HpcH/HpaI aldolase  71.69 
 
 		 336 aa  432  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.175467  normal  0.257367 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1804  putative citrate lyase beta subunit  64.08 
 
 		 354 aa  409  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0637103  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2173  putative lyase  55.42 
 
 		 337 aa  347  1e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.24016 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2709  putative lyase  52.68 
 
 		 350 aa  336  2.9999999999999997e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.15345 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2899  lyase  49.09 
 
 		 338 aa  295  8e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6859  HpcH/HpaI aldolase  49.39 
 
 		 338 aa  294  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750259  normal  0.224007 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4357  HpcH/HpaI aldolase  49.39 
 
 		 340 aa  291  7e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0657  lyase, putative  51.95 
 
 		 339 aa  290  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1618  putative lyase  51.2 
 
 		 339 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2475  putative lyase  51.2 
 
 		 339 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1826  putative lyase  51.2 
 
 		 339 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2337  putative lyase  51.2 
 
 		 339 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0496  putative lyase  51.2 
 
 		 339 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2154  HpcH/HpaI aldolase  48.48 
 
 		 326 aa  288  7e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.377613  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1830  HpcH/HpaI aldolase  47.26 
 
 		 326 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.650441 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1752  putative lyase  50.76 
 
 		 331 aa  285  7e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2868  malyl-CoA lyase or citrate lyase, beta subunit  47.43 
 
 		 327 aa  285  8e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2553  HpcH/HpaI aldolase  49.1 
 
 		 332 aa  285  8e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.108107  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3597  HpcH/HpaI aldolase  48.93 
 
 		 335 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4436  HpcH/HpaI aldolase  48.93 
 
 		 378 aa  279  4e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3931  HpcH/HpaI aldolase  48.93 
 
 		 378 aa  279  4e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2490  HpcH/HpaI aldolase  46.97 
 
 		 326 aa  277  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.33076 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1999  lyase protein  49.06 
 
 		 320 aa  275  6e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.697821  normal  0.433586 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2155  citrate lyase beta subunit-like  48.95 
 
 		 335 aa  275  6e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3824  HpcH/HpaI aldolase  48.96 
 
 		 334 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.508893 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3308  HpcH/HpaI aldolase  48.66 
 
 		 334 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.747689 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2328  putative citrate lyase beta subunit  46.67 
 
 		 326 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4652  HpcH/HpaI aldolase  49.39 
 
 		 335 aa  267  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0797  putative lyase  51.15 
 
 		 307 aa  265  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4429  Citrate lyase subunit beta-like protein  44.71 
 
 		 373 aa  265  8.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00516467  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4148  putative citrate lyase  43.33 
 
 		 331 aa  261  8.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4731  HpcH/HpaI aldolase  42.07 
 
 		 334 aa  252  5.000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  30.8 
 
 		 282 aa  98.6  1e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0799  citrate (pro-3S)-lyase  27.99 
 
 		 341 aa  97.1  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1771  beta subunit of citrate lyase  30.6 
 
 		 318 aa  96.3  6e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.508507  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0417  Citryl-CoA lyase  30.6 
 
 		 318 aa  96.3  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1719  Citrate (pro-3S)-lyase  30.42 
 
 		 325 aa  95.1  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.412951 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0560  putative HpcH/HpaI aldolase  31.02 
 
 		 277 aa  94.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00111477  normal  0.30107 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3663  Citryl-CoA lyase  30.42 
 
 		 323 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2481  citrate (pro-3S)-lyase  30.6 
 
 		 379 aa  91.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.565353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6559  citrate (pro-3S)-lyase  31.23 
 
 		 323 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527752  normal  0.02273 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1253  Citryl-CoA lyase  32.68 
 
 		 287 aa  92  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3189  citrate (pro-3S)-lyase  31.27 
 
 		 301 aa  91.7  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0128752  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1754  Citrate (pro-3S)-lyase  30.9 
 
 		 324 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1802  citrate (pro-3S)-lyase  30.1 
 
 		 324 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.23047 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2138  Citrate (pro-3S)-lyase  30.1 
 
 		 324 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1739  citrate lyase, beta subunit, putative  32.06 
 
 		 320 aa  90.5  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000771015  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5924  citrate (pro-3S)-lyase  30.31 
 
 		 325 aa  90.1  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3165  Citryl-CoA lyase  28.46 
 
 		 320 aa  88.2  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7119  HpcH/HpaI aldolase  30.18 
 
 		 324 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574186  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3050  citrate lyase subunit beta  28.83 
 
 		 318 aa  87.4  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4393  HpcH/HpaI aldolase  29.43 
 
 		 363 aa  85.5  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0669  putative HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase  29.07 
 
 		 274 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4213  HpcH/HpaI aldolase  27.67 
 
 		 351 aa  82.4  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6315  HpcH/HpaI aldolase  27.52 
 
 		 349 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185554  hitchhiker  0.008113 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2830  Citryl-CoA lyase  30.8 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3254  Citryl-CoA lyase  28.81 
 
 		 327 aa  80.9  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0663527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  29.77 
 
 		 292 aa  80.5  0.00000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5950  HpcH/HpaI aldolase  30.19 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  29.77 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2805  HpcH/HpaI aldolase  29.17 
 
 		 355 aa  79.7  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3870  HpcH/HpaI aldolase  25.63 
 
 		 346 aa  79  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0471  citrate lyase  27.89 
 
 		 318 aa  78.6  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.750948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4390  HpcH/HpaI aldolase  25.89 
 
 		 349 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.345408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7178  HpcH/HpaI aldolase  26.74 
 
 		 350 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102062  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6255  HpcH/HpaI aldolase  30.37 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0618  Citrate (pro-3S)-lyase  32.52 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0840536 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3098  HpcH/HpaI aldolase  27.48 
 
 		 371 aa  75.9  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136599  normal  0.227792 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0168  citrate lyase, beta subunit, putative  31.92 
 
 		 274 aa  75.5  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0332252  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4285  HpcH/HpaI aldolase  25.57 
 
 		 349 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0181473  normal  0.111861 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3917  HpcH/HpaI aldolase  25.57 
 
 		 349 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.243397 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0731  HpcH/HpaI aldolase  26.83 
 
 		 349 aa  75.5  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0149  putative citrate lyase, beta subunit  31.92 
 
 		 274 aa  75.5  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.678865  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2324  Citrate (pro-3S)-lyase  31.4 
 
 		 347 aa  74.7  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1078  citrate lyase  30.65 
 
 		 316 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132128  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1580  Citryl-CoA lyase  31.34 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.264708  hitchhiker  0.00335996 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2581  putative citrate lyase beta subunit  30.14 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  27.01 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3520  Citryl-CoA lyase  34.76 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.897264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4082  citrate lyase  32.34 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6600  HpcH/HpaI aldolase  29.67 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.0929834 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0217  citrate lyase  26.57 
 
 		 325 aa  72.8  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342299  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1361  HpcH/HpaI aldolase  29.08 
 
 		 295 aa  72.4  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0742022  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6108  HpcH/HpaI aldolase  28.57 
 
 		 268 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000904095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6909  citrate (pro-3S)-lyase  28.62 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0213  HpcH/HpaI aldolase  27.56 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1650  HpcH/HpaI aldolase  27.31 
 
 		 349 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.806088  normal  0.193855 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3898  Citrate (pro-3S)-lyase  31.52 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.107361  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  32.81 
 
 		 285 aa  70.5  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2705  citrate lyase  25.44 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0580  HpcH/HpaI aldolase  29.12 
 
 		 297 aa  69.7  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  29.96 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1154  Citrate (pro-3S)-lyase  32.76 
 
 		 288 aa  69.3  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0563  Citryl-CoA lyase  29.95 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.293195 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>