228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2674 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2674  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 443 aa  868    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.680206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3389  monooxygenase FAD-binding  44.7 
 
 		 392 aa  275  8e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3806  FAD dependent oxidoreductase  25.38 
 
 		 375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749975  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3185  monooxygenase FAD-binding protein  28.32 
 
 		 375 aa  107  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.388588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2035  FAD dependent oxidoreductase  27.95 
 
 		 379 aa  102  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10918  putative oxidoreductase  22.58 
 
 		 374 aa  101  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.183929  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5035  FAD dependent oxidoreductase  26.4 
 
 		 374 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.378834 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3796  oxidoreductase  23.72 
 
 		 377 aa  99.8  9e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.204918 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1644  FAD dependent oxidoreductase  24.62 
 
 		 378 aa  96.7  8e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00782092 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  30.37 
 
 		 424 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  27.23 
 
 		 457 aa  84.7  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  28.81 
 
 		 430 aa  81.3  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  28.11 
 
 		 403 aa  79.3  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  23.92 
 
 		 384 aa  77.4  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  26.15 
 
 		 398 aa  76.6  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  27 
 
 		 445 aa  76.3  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  27 
 
 		 431 aa  75.9  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  35.33 
 
 		 434 aa  75.5  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  27.01 
 
 		 425 aa  75.1  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18731  NAD binding site  28.68 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.413657 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  34.29 
 
 		 424 aa  74.7  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  27.86 
 
 		 398 aa  73.6  0.000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  28.8 
 
 		 430 aa  73.6  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  28.08 
 
 		 418 aa  73.2  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  35.76 
 
 		 419 aa  73.2  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  27.79 
 
 		 423 aa  73.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  26.28 
 
 		 439 aa  72  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  26.28 
 
 		 439 aa  72  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1512  FAD dependent oxidoreductase  27.91 
 
 		 365 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.193117  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  28.48 
 
 		 444 aa  67.8  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3131  geranylgeranyl reductase  26.22 
 
 		 444 aa  67.8  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  31.51 
 
 		 444 aa  67.4  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2826  geranylgeranyl reductase  32.96 
 
 		 443 aa  67.4  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0858816 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  27.97 
 
 		 414 aa  67  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  26.19 
 
 		 413 aa  67  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  28.78 
 
 		 445 aa  67  0.0000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  33.33 
 
 		 455 aa  66.2  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  33.81 
 
 		 461 aa  66.2  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  26.13 
 
 		 444 aa  65.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  23.97 
 
 		 376 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  30.23 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  35.43 
 
 		 435 aa  65.1  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  34.76 
 
 		 426 aa  64.7  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  29.65 
 
 		 393 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  26.19 
 
 		 378 aa  63.9  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0390  monooxygenase FAD-binding  29.34 
 
 		 425 aa  63.9  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  33.7 
 
 		 423 aa  63.2  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  27.84 
 
 		 398 aa  63.2  0.000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  27.48 
 
 		 375 aa  63.2  0.000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  34.07 
 
 		 441 aa  62.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  27.81 
 
 		 434 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  32 
 
 		 455 aa  62  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2756  tryptophan halogenase  36.36 
 
 		 618 aa  62.4  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  38.28 
 
 		 431 aa  62  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  34.97 
 
 		 470 aa  62.4  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  30.9 
 
 		 423 aa  61.6  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  26.63 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  37.6 
 
 		 506 aa  61.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  27.76 
 
 		 384 aa  61.2  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2189  geranylgeranyl reductase  29.88 
 
 		 383 aa  61.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1294  geranylgeranyl reductase  26.22 
 
 		 420 aa  61.2  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.730528  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2702  geranylgeranyl reductase  42.86 
 
 		 401 aa  60.8  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  25.19 
 
 		 413 aa  60.8  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  26.84 
 
 		 443 aa  60.5  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2822  flavoprotein/dehydrogenase  29.12 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05461  NAD binding site  30.77 
 
 		 377 aa  60.1  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  25.47 
 
 		 449 aa  59.7  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  32.08 
 
 		 480 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  68.29 
 
 		 368 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1820  Ubiquinone biosynthesis hydroxylase, UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family  35.46 
 
 		 419 aa  58.9  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00177812  hitchhiker  0.00000000175067 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3389  FAD-binding protein  25.15 
 
 		 424 aa  58.5  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1340  hypothetical protein  25.88 
 
 		 381 aa  58.5  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07370  geranylgeranyl reductase family protein  37.64 
 
 		 431 aa  58.2  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0284516 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0708  monooxygenase FAD-binding  33.57 
 
 		 416 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  33.61 
 
 		 411 aa  57  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  23.84 
 
 		 389 aa  57  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  24.69 
 
 		 385 aa  56.6  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  31.49 
 
 		 409 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1161  geranylgeranyl reductase  35.14 
 
 		 429 aa  56.6  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  47.06 
 
 		 491 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1739  geranylgeranyl reductase  33.06 
 
 		 358 aa  56.2  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.539865  normal  0.0147858 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  25.73 
 
 		 409 aa  55.8  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11769  hypothetical protein  26.46 
 
 		 460 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.196079  hitchhiker  0.00000209473 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1852  NAD binding site  22.26 
 
 		 376 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5621  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  33.33 
 
 		 409 aa  54.7  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1355  geranylgeranyl reductase  47.37 
 
 		 358 aa  54.3  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0520333 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4606  tryptophan halogenase  30.12 
 
 		 420 aa  54.3  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1863  tryptophan halogenase  27.27 
 
 		 415 aa  53.9  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6678  tryptophan halogenase  33.33 
 
 		 506 aa  53.9  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1119  geranylgeranyl reductase  45.61 
 
 		 367 aa  53.5  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2003  tryptophan halogenase  22.79 
 
 		 415 aa  52.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.923769 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5104  hypothetical protein  30.77 
 
 		 415 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00330  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  26.89 
 
 		 405 aa  52.8  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4387  tryptophan halogenase  30.83 
 
 		 409 aa  53.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000478087  normal  0.336171 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  24.87 
 
 		 495 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1544  monooxygenase, FAD-binding protein  29.09 
 
 		 478 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585572  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  25.6 
 
 		 370 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1567  monooxygenase, FAD-binding  29.09 
 
 		 478 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05841  NAD binding site  29.7 
 
 		 377 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3556  FAD dependent oxidoreductase  30.59 
 
 		 432 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>