279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0570 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_0570  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  100 
 
 
334 aa  660    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2848  gluconolactonase  37.1 
 
 
281 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2498  gluconolactonase  37.46 
 
 
287 aa  172  5e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0611  gluconolactonase  32.59 
 
 
312 aa  137  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.149375 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0573  gluconolactonase  33.78 
 
 
338 aa  135  7.000000000000001e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3203  Gluconolactonase  32.29 
 
 
342 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000499471  normal  0.0664267 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4278  Gluconolactonase  33.12 
 
 
313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.469219 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0622  gluconolactonase  33.68 
 
 
338 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.347955  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3486  Gluconolactonase  31.1 
 
 
303 aa  132  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.656299 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2519  Gluconolactonase  31.45 
 
 
545 aa  130  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0256346 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3774  Gluconolactonase  31.49 
 
 
303 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282281  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3295  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.72 
 
 
579 aa  130  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.760414  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5316  gluconolactonase  30.13 
 
 
303 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5570  Gluconolactonase  31.69 
 
 
334 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3928  Gluconolactonase  31.59 
 
 
351 aa  128  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.617042  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05371  putative gluconolactonase precursor (D-glucono-DELTA-lactone lactonohydrolase) protein  32.27 
 
 
353 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0257  gluconolactonase  31.52 
 
 
350 aa  129  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1999  gluconolactonase  31.08 
 
 
352 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.799768  normal  0.270906 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2803  gluconolactonase  32.14 
 
 
372 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6025  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.57 
 
 
302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1111  gluconolactonase  32.21 
 
 
324 aa  125  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0894988 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2162  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.72 
 
 
581 aa  125  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.021246  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4750  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.25 
 
 
306 aa  124  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5723  gluconolactonase precursor  29.22 
 
 
296 aa  124  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4442  gluconolactonase  30.79 
 
 
316 aa  123  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9336  Gluconolactonase  30.56 
 
 
299 aa  122  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0076  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.47 
 
 
307 aa  122  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0633  gluconolactonase  31.83 
 
 
307 aa  122  8e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.17979 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2470  senescence marker protein-30 family protein  31 
 
 
363 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.183439  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2235  twin-arginine translocation pathway signal  30.77 
 
 
366 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.613312 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4181  gluconolactonase  32.35 
 
 
340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.878915  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0658  gluconolactonase  31.83 
 
 
307 aa  120  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4321  gluconolactonase  28.76 
 
 
304 aa  119  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4631  Gluconolactonase  31.41 
 
 
302 aa  119  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5734  Gluconolactonase  28.81 
 
 
304 aa  119  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402345  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5415  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.95 
 
 
300 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303734  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3561  gluconolactonase  29.12 
 
 
340 aa  118  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.276936 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3342  Gluconolactonase  28.39 
 
 
310 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0588  Gluconolactonase  30 
 
 
323 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2596  gluconolactonase  31.51 
 
 
304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0705  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.56 
 
 
368 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3913  gluconolactonase  28.28 
 
 
306 aa  116  6e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2426  Gluconolactonase  30.52 
 
 
318 aa  116  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151955  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3932  gluconolactonase  28.96 
 
 
286 aa  115  6.9999999999999995e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.1586  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5161  gluconolactonase  30.74 
 
 
302 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288477  normal  0.503028 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4647  Gluconolactonase  27.81 
 
 
304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1345  gluconolactonase  26.67 
 
 
338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0764  gluconolactonase  28.7 
 
 
338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0355462  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2591  gluconolactonase  31.29 
 
 
315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0597  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.29 
 
 
407 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6221  gluconolactonase  29.33 
 
 
314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162368  normal  0.0196248 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6492  gluconolactonase  28.96 
 
 
362 aa  113  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0036  putative gluconolactonase  30.61 
 
 
313 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1190  putative gluconolactonase  31.08 
 
 
316 aa  113  6e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0058  gluconolactonase  30.61 
 
 
313 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.916803  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1542  gluconolactonase precursor  30.61 
 
 
313 aa  112  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.572471  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  29.08 
 
 
533 aa  112  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0044  gluconolactonase  30.61 
 
 
313 aa  112  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2122  gluconolactonase  31.8 
 
 
332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.282778 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2596  gluconolactonase  29.62 
 
 
357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260524  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3985  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  33.46 
 
 
318 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4098  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  33.46 
 
 
318 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.52814  normal  0.192978 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5439  gluconolactonase  30.85 
 
 
316 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1076  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1531  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.17 
 
 
310 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0805032  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0714  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.48 
 
 
307 aa  108  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.958974 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6418  Gluconolactonase  29.93 
 
 
308 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.632386  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0231  Gluconolactonase  29.35 
 
 
325 aa  107  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.381045 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4507  Gluconolactonase  29.29 
 
 
308 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1059  Gluconolactonase  27.68 
 
 
304 aa  107  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.755366  normal  0.0949002 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2832  gluconolactonase  29.67 
 
 
322 aa  107  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0623  Gluconolactonase  32.7 
 
 
328 aa  106  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.515505  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3389  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.07 
 
 
303 aa  106  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.242226 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0625  gluconolactonase  32.19 
 
 
340 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.41477 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0612  gluconolactonase  32.1 
 
 
328 aa  104  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.110443 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2396  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.01 
 
 
275 aa  103  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000818527  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0609  gluconolactonase  30.67 
 
 
312 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0512442 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2728  gluconolactonase  28.91 
 
 
339 aa  103  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.698337 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4874  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.58 
 
 
313 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4272  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.33 
 
 
307 aa  100  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0244404  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6029  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.94 
 
 
309 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305339  normal  0.119752 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2641  gluconolactonase  27.73 
 
 
398 aa  99.4  8e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3888  Gluconolactonase  28 
 
 
281 aa  99  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5466  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  33.21 
 
 
313 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2283  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.94 
 
 
317 aa  97.8  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492267 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5396  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.21 
 
 
313 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.003099 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3691  Gluconolactonase  28 
 
 
281 aa  98.2  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.988188  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2454  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.52 
 
 
305 aa  96.7  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0662478 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4704  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.21 
 
 
309 aa  94.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03689  gluconolactonase  28.57 
 
 
247 aa  92  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3465  senescence marker protein-30 (SMP-30)  31.21 
 
 
309 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2929  gluconolactonase  29.04 
 
 
371 aa  89.4  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.775467 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4613  gluconolactonase  30.6 
 
 
307 aa  89  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183684  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4154  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.77 
 
 
298 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.83646  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4042  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.77 
 
 
298 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1491  Gluconolactonase  27.78 
 
 
327 aa  88.2  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2253  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.63 
 
 
307 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2779  gluconolactonase  27.93 
 
 
343 aa  88.2  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3069  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.76 
 
 
406 aa  87.8  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.976711  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1903  gluconolactonase precursor  30.14 
 
 
309 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4512  gluconolactonase  32 
 
 
305 aa  87.8  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00932463  normal  0.660783 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>