More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3387 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3387  type II secretion system protein E  100 
 
 		 403 aa  810    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.729797  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3174  type II secretion system protein E (GspE)  40.48 
 
 		 468 aa  241  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.277379  normal  0.0236631 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1731  type II secretion system protein E  37.74 
 
 		 561 aa  240  4e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0239334 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  37.72 
 
 		 561 aa  239  5e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0142  general secretory pathway protein E  45.21 
 
 		 502 aa  239  6.999999999999999e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  38.18 
 
 		 553 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4824  putative type II secretion system protein  39.14 
 
 		 469 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112939  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3579  glycoside hydrolase family protein  43.46 
 
 		 503 aa  233  5e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.666057 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  36.43 
 
 		 553 aa  233  5e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55440  putative type II secretion system protein  38.87 
 
 		 469 aa  233  5e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000766086  normal  0.021503 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  38.05 
 
 		 520 aa  233  6e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  38.22 
 
 		 553 aa  233  6e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00602  general secretory pathway protein E  40.31 
 
 		 501 aa  232  8.000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2377  general secretory pathway protein E  41.29 
 
 		 489 aa  231  1e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  40.99 
 
 		 500 aa  231  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1028  type II secretion system protein E  43.94 
 
 		 568 aa  231  2e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328232 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  37.79 
 
 		 520 aa  231  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3618  general secretory pathway protein E  42.57 
 
 		 523 aa  230  3e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  45.65 
 
 		 567 aa  229  5e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  38.68 
 
 		 515 aa  229  6e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0316  type II secretion system protein E  43.69 
 
 		 497 aa  229  6e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.218046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2089  general secretory pathway protein E  37.82 
 
 		 559 aa  229  6e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3528  type II secretion system protein E  38.58 
 
 		 586 aa  229  8e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.305202  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1273  type II protein secretion ATPase LspE  39.69 
 
 		 494 aa  229  9e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  41.83 
 
 		 514 aa  228  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4733  general secretory pathway protein E  42.57 
 
 		 523 aa  228  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0457665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  42.91 
 
 		 573 aa  228  1e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.608065 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0387  general secretory pathway protein E  37.5 
 
 		 493 aa  228  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3520  general secretory pathway protein E  37.5 
 
 		 493 aa  228  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.189411  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1274  type II protein secretion ATPase LspE  39.69 
 
 		 494 aa  227  2e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  43.06 
 
 		 520 aa  228  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0145  general secretory pathway protein E  36.93 
 
 		 523 aa  227  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0387  general secretory pathway protein E  37.5 
 
 		 493 aa  228  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0106  general secretory pathway protein E  43.34 
 
 		 514 aa  227  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0688  general secretory pathway protein E  43.53 
 
 		 578 aa  227  3e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0831226 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4500  putative general secretion pathway protein E  39.41 
 
 		 522 aa  227  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  35.96 
 
 		 555 aa  227  3e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2000  type IV pilus assembly protein PilB  37.37 
 
 		 562 aa  226  4e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.758865  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0226  general secretory pathway protein E  42.07 
 
 		 518 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2652  type II secretion system protein E  44.76 
 
 		 505 aa  226  5.0000000000000005e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03177  general secretory pathway component, cryptic  37.24 
 
 		 493 aa  226  7e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.227231  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03128  hypothetical protein  37.24 
 
 		 493 aa  226  7e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.182977  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0382  general secretory pathway protein E  43.23 
 
 		 507 aa  226  7e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.432738 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1415  general secretory pathway protein E  44.67 
 
 		 490 aa  225  8e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3763  hypothetical protein  38.3 
 
 		 490 aa  226  8e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3566  general secretion pathway protein E  42.32 
 
 		 521 aa  226  8e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294519  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0004  general secretory pathway protein E  44.21 
 
 		 501 aa  225  9e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0631782 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1526  type II secretion system protein E  38.64 
 
 		 567 aa  225  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.30964 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0150  general secretory pathway protein E  42.32 
 
 		 521 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3576  hypothetical protein  37.5 
 
 		 490 aa  225  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.356057  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  40.58 
 
 		 520 aa  225  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0665  hypothetical protein  38.48 
 
 		 473 aa  225  1e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4205  general secretory pathway protein E  42.32 
 
 		 521 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.381078  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0154  general secretory pathway protein E  42.32 
 
 		 521 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  34.33 
 
 		 558 aa  224  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0157  type II secretion system protein E (GspE)  42.32 
 
 		 521 aa  224  1e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0154  general secretory pathway protein E  42.32 
 
 		 521 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.11492 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0170  general secretion pathway protein E  42.67 
 
 		 520 aa  224  1e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0167  general secretion pathway protein E  41.91 
 
 		 521 aa  224  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  37.17 
 
 		 554 aa  224  2e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0152  type II secretion system protein E (GspE)  42.32 
 
 		 521 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0152  type II secretion system protein E (GspE)  42.32 
 
 		 521 aa  224  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.203719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2530  general secretory pathway protein E  40.11 
 
 		 477 aa  224  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4189  type II secretion system protein E  36.71 
 
 		 557 aa  224  3e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  37.43 
 
 		 503 aa  223  3e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  42.81 
 
 		 599 aa  224  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0364  putative secretion pathway ATPase  41.12 
 
 		 592 aa  224  3e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4357  general secretory pathway protein E  41.55 
 
 		 524 aa  223  4e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.555593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3984  type II secretion system protein E  42.47 
 
 		 611 aa  223  4.9999999999999996e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.768816 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  34.03 
 
 		 564 aa  223  4.9999999999999996e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  35.64 
 
 		 571 aa  223  4.9999999999999996e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  42.47 
 
 		 599 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1823  type II secretion system protein E  37.66 
 
 		 571 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2923  general secretion pathway protein E  41.33 
 
 		 499 aa  223  6e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0080  general secretory pathway protein E  39.25 
 
 		 499 aa  223  6e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03832  type II secretory pathway ATPase  43.11 
 
 		 604 aa  223  6e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0009  Type II secretion system gspE  39.25 
 
 		 499 aa  223  7e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0061  general secretory pathway protein E  39.25 
 
 		 499 aa  223  7e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212522  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1621  type II secretion system protein E  36.96 
 
 		 586 aa  222  9e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.143192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  37 
 
 		 577 aa  222  9e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3937  general secretory pathway protein E  39.14 
 
 		 495 aa  222  9e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0061  general secretory pathway protein E  38.71 
 
 		 499 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5250  type II secretion system protein E  41.14 
 
 		 557 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  34.44 
 
 		 570 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1156  type II secretion system protein E  36.59 
 
 		 591 aa  222  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1408  type II secretion system protein E  42.4 
 
 		 577 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.22381  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  42.47 
 
 		 599 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0051  general secretory pathway protein E  38.71 
 
 		 499 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582006  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  35.24 
 
 		 603 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0889  type II secretion system protein  35.64 
 
 		 595 aa  221  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0122  type II secretion system protein E  43.48 
 
 		 514 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.766789  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  36.18 
 
 		 521 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0062  general secretory pathway protein E  38.98 
 
 		 498 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3230  type II secretion system protein E (GspE)  37.86 
 
 		 491 aa  220  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0114833  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0008  general secretion pathway protein E  37.84 
 
 		 497 aa  220  3e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2399  general secretory pathway protein E  38.25 
 
 		 515 aa  220  3e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000178866 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3517  general secretion pathway protein E  37.84 
 
 		 497 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385541  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0221  general secretory pathway protein E  37.84 
 
 		 497 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1889  general secretion pathway protein E  37.84 
 
 		 497 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.902732  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5097  type II secretion system protein E  39.95 
 
 		 557 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>