55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2184 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2184  Planctomycete cytochrome C  100 
 
 		 646 aa  1320    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1890  protein of unknown function DUF1549  39.81 
 
 		 922 aa  74.3  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3693  hypothetical protein  37.14 
 
 		 132 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3229  protein of unknown function DUF1549  41.18 
 
 		 1171 aa  72  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0336  transmembrane region and signal peptide prediction  37.89 
 
 		 129 aa  71.6  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000151366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1986  hypothetical protein  28.14 
 
 		 299 aa  68.9  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000747383 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1978  protein of unknown function DUF1549  41.67 
 
 		 772 aa  68.6  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.558738  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1739  protein of unknown function DUF1549  39.78 
 
 		 805 aa  67.8  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0465  hypothetical protein  37.38 
 
 		 136 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5931  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  36.84 
 
 		 507 aa  67.4  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1040  protein of unknown function DUF1549  31.69 
 
 		 768 aa  66.6  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0289706  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0299  Planctomycete cytochrome C  37.25 
 
 		 147 aa  66.2  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0817  hypothetical protein  37.93 
 
 		 465 aa  65.1  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2715  protein of unknown function DUF1549  29.94 
 
 		 911 aa  64.7  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.328097  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1796  protein of unknown function DUF1549  39.81 
 
 		 1013 aa  64.3  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1151  protein of unknown function DUF1549  34.34 
 
 		 1737 aa  64.7  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1451  WD-40 repeat protein  31.11 
 
 		 756 aa  63.9  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3699  hypothetical protein  35.51 
 
 		 503 aa  63.9  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1595  protein of unknown function DUF1549  35.92 
 
 		 765 aa  63.9  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599315  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1120  protein of unknown function DUF1549  33.33 
 
 		 841 aa  62.4  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0957  protein of unknown function DUF1549  29.51 
 
 		 785 aa  63.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.244644 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3921  protein of unknown function DUF1549  35.85 
 
 		 1097 aa  63.2  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2950  protein of unknown function DUF1549  30.56 
 
 		 1046 aa  62  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.798695  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2712  hypothetical protein  31.78 
 
 		 468 aa  62  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0517  protein of unknown function DUF1549  34.21 
 
 		 1063 aa  62  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2401  WD-40 repeat protein  31.52 
 
 		 651 aa  61.6  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.402251  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0638  hypothetical protein  34.51 
 
 		 132 aa  61.2  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.134995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0815  hypothetical protein  36.73 
 
 		 1074 aa  61.6  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0959  protein of unknown function DUF1549  37.25 
 
 		 776 aa  60.8  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.185846 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2203  protein of unknown function DUF1549  35.35 
 
 		 1091 aa  60.8  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0602  hypothetical protein  36.36 
 
 		 124 aa  60.1  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2794  protein of unknown function DUF1549  30.53 
 
 		 1129 aa  59.7  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0191241  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0961  hypothetical protein  32.98 
 
 		 729 aa  58.9  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000466384  normal  0.0803995 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1976  Planctomycete cytochrome C  29.71 
 
 		 724 aa  58.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5453  protein of unknown function DUF1549  29.29 
 
 		 924 aa  58.2  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.996886  normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4084  protein of unknown function DUF1549  31.91 
 
 		 917 aa  57.8  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0328965  normal  0.233316 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5932  protein of unknown function DUF1549  30.22 
 
 		 1182 aa  57.4  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.453716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1334  protein of unknown function DUF1549  29.27 
 
 		 1068 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3702  protein of unknown function DUF1549  30.53 
 
 		 922 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6394  hypothetical protein  32.29 
 
 		 135 aa  54.3  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1593  hypothetical protein  27.66 
 
 		 716 aa  50.8  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0333  protein of unknown function DUF1549  30 
 
 		 1074 aa  50.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087202 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3227  hypothetical protein  31.78 
 
 		 131 aa  50.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00220073  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3541  hypothetical protein  34.29 
 
 		 137 aa  50.1  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2064  fatty acid cis/trans isomerase, putative  36.59 
 
 		 784 aa  49.7  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0775  protein of unknown function DUF1549  28.3 
 
 		 883 aa  48.5  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.68888  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3816  protein of unknown function DUF1549  34.04 
 
 		 984 aa  48.5  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2165  protein of unknown function DUF1549  27.17 
 
 		 963 aa  47.8  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1046  protein of unknown function DUF1549  30.84 
 
 		 1066 aa  47.8  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0087  fatty acid cis/trans isomerase  42 
 
 		 774 aa  46.2  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4094  protein of unknown function DUF1549  33.33 
 
 		 998 aa  45.4  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0141  hypothetical protein  32.22 
 
 		 251 aa  45.1  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1806  fatty acid cis/trans isomerase, putative  41.46 
 
 		 798 aa  45.4  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.356281  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0378  protein of unknown function DUF1549  22.35 
 
 		 1067 aa  44.7  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00109161  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1252  hypothetical protein  37.5 
 
 		 129 aa  44.3  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>