30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1806 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1585  fatty acid cis/trans isomerase, putative  46.17 
 
 		 783 aa  670    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000315  fatty acid cis/trans isomerase  42.41 
 
 		 784 aa  658    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.365709  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3808  fatty acid cistrans isomerase  42.88 
 
 		 797 aa  650    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3990  fatty acid cistrans isomerase  42.88 
 
 		 797 aa  647    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06117  hypothetical protein  43.59 
 
 		 781 aa  643    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3865  fatty acid cistrans isomerase  42.88 
 
 		 797 aa  649    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0485  fatty acid cis/trans isomerase  43.64 
 
 		 766 aa  654    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0799567  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0451  fatty acid cistrans isomerase  42.88 
 
 		 797 aa  646    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0501  fatty acid cistrans isomerase  43.39 
 
 		 797 aa  681    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0500  fatty acid cistrans isomerase  43.39 
 
 		 797 aa  681    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1806  fatty acid cis/trans isomerase, putative  100 
 
 		 798 aa  1623    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.356281  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3530  fatty acid cistrans isomerase  43.64 
 
 		 797 aa  687    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0087  fatty acid cis/trans isomerase  41.85 
 
 		 774 aa  637    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1691  fatty acid cistrans isomerase  43.18 
 
 		 784 aa  632  1e-180  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.370066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3300  fatty acid cistrans isomerase  40.97 
 
 		 798 aa  620  1e-176  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28770  Fatty acid cistrans isomerase  43.79 
 
 		 756 aa  577  1.0000000000000001e-163  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2160  fatty acid cistrans isomerase  42.08 
 
 		 758 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.279202  normal  0.0207501 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40640  cis/trans isomerase  41.79 
 
 		 762 aa  570  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2376  fatty acid cistrans isomerase  41.45 
 
 		 766 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3446  cis/trans isomerase  40.93 
 
 		 762 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.662328  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3106  Fatty acid cistrans isomerase  40.1 
 
 		 764 aa  560  1e-158  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1889  fatty acid cistrans isomerase  41.42 
 
 		 766 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.521979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0362  fatty acid cistrans isomerase  41.4 
 
 		 788 aa  556  1e-157  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2064  fatty acid cis/trans isomerase, putative  40.49 
 
 		 784 aa  556  1e-157  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1983  fatty acid cistrans isomerase  40.92 
 
 		 766 aa  555  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.346862 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3319  fatty acid cistrans isomerase  41.34 
 
 		 795 aa  555  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2733  esterified fatty acid cis/trans isomerase  39.97 
 
 		 770 aa  536  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.135603  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0376  cis/trans isomerase  35.92 
 
 		 827 aa  493  9.999999999999999e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.799569 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1986  hypothetical protein  52.5 
 
 		 299 aa  47.8  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000747383 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2184  Planctomycete cytochrome C  41.46 
 
 		 646 aa  45.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>