29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_40640 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2376  fatty acid cistrans isomerase  64.8 
 
 		 766 aa  1057    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2733  esterified fatty acid cis/trans isomerase  62.86 
 
 		 770 aa  1031    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.135603  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3106  Fatty acid cistrans isomerase  69.25 
 
 		 764 aa  1131    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28770  Fatty acid cistrans isomerase  68.15 
 
 		 756 aa  1064    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1889  fatty acid cistrans isomerase  64.67 
 
 		 766 aa  1054    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.521979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40640  cis/trans isomerase  100 
 
 		 762 aa  1576    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1983  fatty acid cistrans isomerase  64.54 
 
 		 766 aa  1053    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.346862 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3446  cis/trans isomerase  97.11 
 
 		 762 aa  1540    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.662328  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2160  fatty acid cistrans isomerase  70.88 
 
 		 758 aa  1126    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.279202  normal  0.0207501 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3319  fatty acid cistrans isomerase  65.32 
 
 		 795 aa  1065    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0376  cis/trans isomerase  39.18 
 
 		 827 aa  585  1.0000000000000001e-165  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.799569 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1806  fatty acid cis/trans isomerase, putative  40.91 
 
 		 798 aa  556  1e-157  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.356281  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0362  fatty acid cistrans isomerase  39.82 
 
 		 788 aa  521  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000315  fatty acid cis/trans isomerase  37.58 
 
 		 784 aa  515  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.365709  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1585  fatty acid cis/trans isomerase, putative  38.32 
 
 		 783 aa  500  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06117  hypothetical protein  37.18 
 
 		 781 aa  499  1e-140  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0500  fatty acid cistrans isomerase  36.8 
 
 		 797 aa  500  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2064  fatty acid cis/trans isomerase, putative  37.27 
 
 		 784 aa  496  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0501  fatty acid cistrans isomerase  36.8 
 
 		 797 aa  498  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3530  fatty acid cistrans isomerase  36.67 
 
 		 797 aa  497  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0485  fatty acid cis/trans isomerase  38.51 
 
 		 766 aa  491  1e-137  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0799567  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3865  fatty acid cistrans isomerase  37.32 
 
 		 797 aa  490  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3990  fatty acid cistrans isomerase  37.19 
 
 		 797 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3808  fatty acid cistrans isomerase  37.32 
 
 		 797 aa  492  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0451  fatty acid cistrans isomerase  37.06 
 
 		 797 aa  488  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3300  fatty acid cistrans isomerase  37.04 
 
 		 798 aa  484  1e-135  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0087  fatty acid cis/trans isomerase  35.78 
 
 		 774 aa  482  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1691  fatty acid cistrans isomerase  34.92 
 
 		 784 aa  436  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.370066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2408  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.5 
 
 		 325 aa  44.7  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000647943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>