28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000315 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1585  fatty acid cis/trans isomerase, putative  48.03 
 
 		 783 aa  770    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000315  fatty acid cis/trans isomerase  100 
 
 		 784 aa  1639    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.365709  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3808  fatty acid cistrans isomerase  52.44 
 
 		 797 aa  858    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3990  fatty acid cistrans isomerase  52.7 
 
 		 797 aa  860    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06117  hypothetical protein  85.02 
 
 		 781 aa  1417    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3865  fatty acid cistrans isomerase  52.7 
 
 		 797 aa  861    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1691  fatty acid cistrans isomerase  47.09 
 
 		 784 aa  770    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.370066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0485  fatty acid cis/trans isomerase  72.29 
 
 		 766 aa  1197    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0799567  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0451  fatty acid cistrans isomerase  52.57 
 
 		 797 aa  860    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0501  fatty acid cistrans isomerase  52.54 
 
 		 797 aa  870    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3530  fatty acid cistrans isomerase  52.41 
 
 		 797 aa  874    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1806  fatty acid cis/trans isomerase, putative  42.16 
 
 		 798 aa  650    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.356281  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0500  fatty acid cistrans isomerase  52.41 
 
 		 797 aa  876    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3300  fatty acid cistrans isomerase  52.28 
 
 		 798 aa  897    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0087  fatty acid cis/trans isomerase  43.39 
 
 		 774 aa  681    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0362  fatty acid cistrans isomerase  38.28 
 
 		 788 aa  520  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2733  esterified fatty acid cis/trans isomerase  37.11 
 
 		 770 aa  512  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.135603  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40640  cis/trans isomerase  37.58 
 
 		 762 aa  515  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3446  cis/trans isomerase  37.45 
 
 		 762 aa  512  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.662328  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3106  Fatty acid cistrans isomerase  37.12 
 
 		 764 aa  504  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2064  fatty acid cis/trans isomerase, putative  36.77 
 
 		 784 aa  504  1e-141  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2160  fatty acid cistrans isomerase  37.45 
 
 		 758 aa  498  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.279202  normal  0.0207501 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1983  fatty acid cistrans isomerase  36.82 
 
 		 766 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.346862 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1889  fatty acid cistrans isomerase  36.65 
 
 		 766 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.521979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28770  Fatty acid cistrans isomerase  37.52 
 
 		 756 aa  491  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3319  fatty acid cistrans isomerase  36.82 
 
 		 795 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2376  fatty acid cistrans isomerase  36.56 
 
 		 766 aa  485  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0376  cis/trans isomerase  33.25 
 
 		 827 aa  449  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.799569 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>