29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0376 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0376  cis/trans isomerase  100 
 
 		 827 aa  1722    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.799569 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28770  Fatty acid cistrans isomerase  41.15 
 
 		 756 aa  613  9.999999999999999e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2160  fatty acid cistrans isomerase  39.59 
 
 		 758 aa  608  9.999999999999999e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.279202  normal  0.0207501 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3446  cis/trans isomerase  39.67 
 
 		 762 aa  586  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.662328  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40640  cis/trans isomerase  39.56 
 
 		 762 aa  587  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2376  fatty acid cistrans isomerase  39.74 
 
 		 766 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1889  fatty acid cistrans isomerase  39.87 
 
 		 766 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.521979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1983  fatty acid cistrans isomerase  39.74 
 
 		 766 aa  585  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.346862 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3106  Fatty acid cistrans isomerase  39.26 
 
 		 764 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3319  fatty acid cistrans isomerase  39.49 
 
 		 795 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2733  esterified fatty acid cis/trans isomerase  38.86 
 
 		 770 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.135603  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1806  fatty acid cis/trans isomerase, putative  36.05 
 
 		 798 aa  483  1e-135  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.356281  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1585  fatty acid cis/trans isomerase, putative  33.73 
 
 		 783 aa  473  1e-132  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0362  fatty acid cistrans isomerase  35.77 
 
 		 788 aa  464  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0087  fatty acid cis/trans isomerase  35.53 
 
 		 774 aa  464  1e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06117  hypothetical protein  33.77 
 
 		 781 aa  452  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000315  fatty acid cis/trans isomerase  33.25 
 
 		 784 aa  450  1e-125  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.365709  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0501  fatty acid cistrans isomerase  32.87 
 
 		 797 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1691  fatty acid cistrans isomerase  33 
 
 		 784 aa  449  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.370066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3530  fatty acid cistrans isomerase  32.99 
 
 		 797 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0500  fatty acid cistrans isomerase  32.83 
 
 		 797 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0451  fatty acid cistrans isomerase  32.66 
 
 		 797 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3865  fatty acid cistrans isomerase  33.42 
 
 		 797 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3300  fatty acid cistrans isomerase  33.08 
 
 		 798 aa  437  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2064  fatty acid cis/trans isomerase, putative  33.49 
 
 		 784 aa  435  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3990  fatty acid cistrans isomerase  33.04 
 
 		 797 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3808  fatty acid cistrans isomerase  33.16 
 
 		 797 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0485  fatty acid cis/trans isomerase  32.21 
 
 		 766 aa  431  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0799567  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1986  hypothetical protein  41.3 
 
 		 299 aa  45.8  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000747383 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>