30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1691 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1585  fatty acid cis/trans isomerase, putative  47.34 
 
 
783 aa  707    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000315  fatty acid cis/trans isomerase  46.94 
 
 
784 aa  778    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.365709  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3808  fatty acid cistrans isomerase  47.82 
 
 
797 aa  749    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3990  fatty acid cistrans isomerase  47.95 
 
 
797 aa  748    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06117  hypothetical protein  47.58 
 
 
781 aa  773    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3865  fatty acid cistrans isomerase  48.08 
 
 
797 aa  749    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1691  fatty acid cistrans isomerase  100 
 
 
784 aa  1622    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.370066  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0485  fatty acid cis/trans isomerase  47.16 
 
 
766 aa  746    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0799567  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0451  fatty acid cistrans isomerase  47.95 
 
 
797 aa  746    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0501  fatty acid cistrans isomerase  48.3 
 
 
797 aa  761    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3530  fatty acid cistrans isomerase  48.93 
 
 
797 aa  771    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0500  fatty acid cistrans isomerase  48.55 
 
 
797 aa  761    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3300  fatty acid cistrans isomerase  43.91 
 
 
798 aa  693    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0087  fatty acid cis/trans isomerase  44.03 
 
 
774 aa  680    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1806  fatty acid cis/trans isomerase, putative  43.02 
 
 
798 aa  628  1e-178  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.356281  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2160  fatty acid cistrans isomerase  36.78 
 
 
758 aa  481  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.279202  normal  0.0207501 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0362  fatty acid cistrans isomerase  37.5 
 
 
788 aa  472  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3106  Fatty acid cistrans isomerase  35.87 
 
 
764 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2733  esterified fatty acid cis/trans isomerase  35.12 
 
 
770 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.135603  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28770  Fatty acid cistrans isomerase  35.46 
 
 
756 aa  456  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1983  fatty acid cistrans isomerase  35.8 
 
 
766 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.346862 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0376  cis/trans isomerase  33 
 
 
827 aa  449  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.799569 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3319  fatty acid cistrans isomerase  35.93 
 
 
795 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2376  fatty acid cistrans isomerase  35.67 
 
 
766 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1889  fatty acid cistrans isomerase  35.49 
 
 
766 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.521979  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2064  fatty acid cis/trans isomerase, putative  34.28 
 
 
784 aa  441  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40640  cis/trans isomerase  34.92 
 
 
762 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3446  cis/trans isomerase  35.05 
 
 
762 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.662328  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0961  hypothetical protein  26.83 
 
 
729 aa  44.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000466384  normal  0.0803995 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1593  hypothetical protein  27.27 
 
 
716 aa  44.3  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>