28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2160 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2376  fatty acid cistrans isomerase  68.74 
 
 		 766 aa  1069    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28770  Fatty acid cistrans isomerase  70.49 
 
 		 756 aa  1087    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2733  esterified fatty acid cis/trans isomerase  63.19 
 
 		 770 aa  1032    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.135603  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3106  Fatty acid cistrans isomerase  68.65 
 
 		 764 aa  1105    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1889  fatty acid cistrans isomerase  67.46 
 
 		 766 aa  1063    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.521979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1983  fatty acid cistrans isomerase  68.06 
 
 		 766 aa  1057    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.346862 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3446  cis/trans isomerase  70.74 
 
 		 762 aa  1117    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.662328  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40640  cis/trans isomerase  70.88 
 
 		 762 aa  1126    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3319  fatty acid cistrans isomerase  69.01 
 
 		 795 aa  1071    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2160  fatty acid cistrans isomerase  100 
 
 		 758 aa  1563    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.279202  normal  0.0207501 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0376  cis/trans isomerase  39.59 
 
 		 827 aa  606  9.999999999999999e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.799569 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1806  fatty acid cis/trans isomerase, putative  41.82 
 
 		 798 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.356281  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1585  fatty acid cis/trans isomerase, putative  38.86 
 
 		 783 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000315  fatty acid cis/trans isomerase  37.45 
 
 		 784 aa  498  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.365709  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0362  fatty acid cistrans isomerase  38.21 
 
 		 788 aa  495  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0087  fatty acid cis/trans isomerase  36.15 
 
 		 774 aa  491  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3530  fatty acid cistrans isomerase  37.88 
 
 		 797 aa  488  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3808  fatty acid cistrans isomerase  38.23 
 
 		 797 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0485  fatty acid cis/trans isomerase  37.37 
 
 		 766 aa  483  1e-135  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0799567  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0501  fatty acid cistrans isomerase  37.75 
 
 		 797 aa  485  1e-135  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3865  fatty acid cistrans isomerase  38.23 
 
 		 797 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06117  hypothetical protein  36.58 
 
 		 781 aa  482  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3990  fatty acid cistrans isomerase  38.23 
 
 		 797 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0500  fatty acid cistrans isomerase  37.48 
 
 		 797 aa  484  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0451  fatty acid cistrans isomerase  38.1 
 
 		 797 aa  481  1e-134  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2064  fatty acid cis/trans isomerase, putative  36.76 
 
 		 784 aa  480  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1691  fatty acid cistrans isomerase  36.78 
 
 		 784 aa  480  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.370066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3300  fatty acid cistrans isomerase  35.87 
 
 		 798 aa  462  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>