58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2712 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2712  hypothetical protein  100 
 
 		 468 aa  952    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3699  hypothetical protein  39.1 
 
 		 503 aa  306  7e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5931  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  38.81 
 
 		 507 aa  293  6e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0961  hypothetical protein  33.86 
 
 		 729 aa  244  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000466384  normal  0.0803995 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1976  Planctomycete cytochrome C  33.86 
 
 		 724 aa  233  8.000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1593  hypothetical protein  31.36 
 
 		 716 aa  218  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0817  hypothetical protein  31.32 
 
 		 465 aa  206  9e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0957  protein of unknown function DUF1549  33.58 
 
 		 785 aa  163  6e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.244644 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1040  protein of unknown function DUF1549  36.54 
 
 		 768 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0289706  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2203  protein of unknown function DUF1549  39.62 
 
 		 1091 aa  70.9  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1796  protein of unknown function DUF1549  32.53 
 
 		 1013 aa  68.6  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3702  protein of unknown function DUF1549  33.33 
 
 		 922 aa  67.4  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1151  protein of unknown function DUF1549  38.83 
 
 		 1737 aa  66.6  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4084  protein of unknown function DUF1549  36.36 
 
 		 917 aa  66.6  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0328965  normal  0.233316 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2794  protein of unknown function DUF1549  30.32 
 
 		 1129 aa  66.2  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0191241  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0299  Planctomycete cytochrome C  33.33 
 
 		 147 aa  65.5  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3921  protein of unknown function DUF1549  39.09 
 
 		 1097 aa  64.3  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0620  hypothetical protein  30.18 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2950  protein of unknown function DUF1549  33.03 
 
 		 1046 aa  63.2  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.798695  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0959  protein of unknown function DUF1549  34.26 
 
 		 776 aa  63.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.185846 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1986  hypothetical protein  41.38 
 
 		 299 aa  63.2  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000747383 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2184  Planctomycete cytochrome C  31.78 
 
 		 646 aa  62  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0517  protein of unknown function DUF1549  29.29 
 
 		 1063 aa  61.6  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5453  protein of unknown function DUF1549  34.65 
 
 		 924 aa  60.8  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.996886  normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2401  WD-40 repeat protein  36.08 
 
 		 651 aa  60.8  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.402251  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2165  protein of unknown function DUF1549  36 
 
 		 963 aa  60.8  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1978  protein of unknown function DUF1549  30.33 
 
 		 772 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.558738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0602  hypothetical protein  30.68 
 
 		 124 aa  58.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0333  protein of unknown function DUF1549  34.58 
 
 		 1074 aa  58.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087202 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3693  hypothetical protein  30.19 
 
 		 132 aa  57.4  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1595  protein of unknown function DUF1549  35.24 
 
 		 765 aa  57  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5932  protein of unknown function DUF1549  32.08 
 
 		 1182 aa  57  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.453716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1542  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  41.89 
 
 		 344 aa  55.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.400143  hitchhiker  0.0000648259 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1046  protein of unknown function DUF1549  34.26 
 
 		 1066 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1890  protein of unknown function DUF1549  31.96 
 
 		 922 aa  55.5  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0815  hypothetical protein  30.09 
 
 		 1074 aa  54.7  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1334  protein of unknown function DUF1549  37.37 
 
 		 1068 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1120  protein of unknown function DUF1549  34.04 
 
 		 841 aa  55.1  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3816  protein of unknown function DUF1549  34.91 
 
 		 984 aa  53.5  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1451  WD-40 repeat protein  30.48 
 
 		 756 aa  53.5  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3227  hypothetical protein  31.43 
 
 		 131 aa  53.1  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00220073  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3229  protein of unknown function DUF1549  29.3 
 
 		 1171 aa  52.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2715  protein of unknown function DUF1549  34.41 
 
 		 911 aa  52.4  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.328097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0638  hypothetical protein  27.03 
 
 		 132 aa  51.6  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.134995  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1739  protein of unknown function DUF1549  30.3 
 
 		 805 aa  51.6  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3648  Serine/threonine protein kinase-related protein  32.97 
 
 		 1655 aa  50.4  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152194  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0465  hypothetical protein  29.46 
 
 		 136 aa  50.4  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0568  Protein of unknown function DUF1592  30.34 
 
 		 818 aa  50.1  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2175  hypothetical protein  46.55 
 
 		 437 aa  49.7  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0141  hypothetical protein  25.51 
 
 		 251 aa  49.3  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0775  protein of unknown function DUF1549  33.7 
 
 		 883 aa  48.5  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.68888  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0931  Protein of unknown function DUF1592  25.61 
 
 		 868 aa  47.8  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.710988  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4438  hypothetical protein  28.06 
 
 		 141 aa  46.6  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.197621  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0378  protein of unknown function DUF1549  31.37 
 
 		 1067 aa  46.6  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00109161  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_1199  predicted protein  31.25 
 
 		 486 aa  45.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0020  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40 
 
 		 481 aa  44.7  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120001  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0336  transmembrane region and signal peptide prediction  28.7 
 
 		 129 aa  43.9  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000151366  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3843  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  32.56 
 
 		 474 aa  43.9  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>