More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2526 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2526  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 620 aa  1276    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.995023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4821  TonB-dependent receptor  40.88 
 
 		 621 aa  497  1e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2071  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 629 aa  204  4e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00162344  hitchhiker  0.000156466 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3315  TonB-dependent receptor plug  25.54 
 
 		 650 aa  165  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4414  TonB-dependent receptor plug  24.81 
 
 		 639 aa  160  6e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0122  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 624 aa  122  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0250  TonB-dependent receptor plug  24.17 
 
 		 597 aa  117  6.9999999999999995e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 697 aa  116  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2209  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 624 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2667  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 627 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0986558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  24.33 
 
 		 602 aa  115  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  24.88 
 
 		 620 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  24.96 
 
 		 628 aa  108  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  24 
 
 		 617 aa  106  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0521  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 617 aa  103  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2720  iron complex outermembrane recepter protein  23.72 
 
 		 631 aa  102  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83965  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  22.78 
 
 		 619 aa  102  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  24.08 
 
 		 617 aa  102  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3735  TonB-dependent receptor plug  23.74 
 
 		 628 aa  100  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000331916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  22.63 
 
 		 686 aa  99  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1926  TonB-dependent receptor  22.65 
 
 		 627 aa  98.2  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.201933  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.37 
 
 		 631 aa  97.8  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.68 
 
 		 623 aa  97.4  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.41 
 
 		 631 aa  97.4  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2342  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 611 aa  96.7  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.499314  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  23.59 
 
 		 626 aa  96.7  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2400  outer membrane receptor protein  24.7 
 
 		 621 aa  95.9  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.901841 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  23.39 
 
 		 626 aa  96.3  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  24.2 
 
 		 619 aa  94.4  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 638 aa  94.4  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1826  TonB-dependent receptor  24.83 
 
 		 621 aa  94  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568285  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2165  TonB-dependent vitamin B12 receptor  23.71 
 
 		 616 aa  92.8  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1447  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 632 aa  92.8  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3757  TonB-dependent receptor plug  23.73 
 
 		 612 aa  92.4  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  23.04 
 
 		 732 aa  90.9  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5008  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 627 aa  90.5  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.877838 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  22.93 
 
 		 646 aa  90.1  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 		 593 aa  89.4  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0578  TonB-dependent receptor plug  24.85 
 
 		 627 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0571  TonB-dependent receptor plug  25.31 
 
 		 628 aa  87.4  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0273  TonB-dependent receptor  22.11 
 
 		 602 aa  87  9e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0292443  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2637  hypothetical protein  22.6 
 
 		 631 aa  86.7  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0560  TonB-dependent receptor, plug  27.17 
 
 		 623 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  31.84 
 
 		 638 aa  86.3  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4773  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 		 624 aa  85.9  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.386912  normal  0.53176 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01534  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  23.54 
 
 		 647 aa  85.9  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  22.84 
 
 		 642 aa  85.5  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01529  putative orphan protein  22.67 
 
 		 624 aa  85.1  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.422212  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.61 
 
 		 631 aa  85.5  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0525  B12 family TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 641 aa  84.7  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  21.69 
 
 		 613 aa  84.3  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3730  TonB-dependent receptor  24.95 
 
 		 637 aa  84.3  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0159073  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002156  outer membrane vitamin B12 receptor BtuB  22.87 
 
 		 611 aa  84.3  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122091  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  22.9 
 
 		 623 aa  84  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 705 aa  84  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3493  TonB-dependent receptor  23.11 
 
 		 621 aa  84  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227534 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  34.21 
 
 		 618 aa  84  0.000000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1502  TonB-dependent receptor  21.6 
 
 		 613 aa  83.2  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6080  putative TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 690 aa  82  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0969  outer membrane receptor for transport of vitamin B  23.25 
 
 		 645 aa  81.3  0.00000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.01117 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  23.55 
 
 		 1023 aa  80.9  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  22.22 
 
 		 614 aa  80.5  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  23.65 
 
 		 616 aa  80.5  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0790  TonB-dependent receptor  21.67 
 
 		 614 aa  80.5  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.270148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.74 
 
 		 614 aa  79.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  23.16 
 
 		 615 aa  79  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  32.86 
 
 		 634 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  22.02 
 
 		 639 aa  79  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4020  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  21.49 
 
 		 615 aa  78.6  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000194494  normal  0.015002 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3783  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.31 
 
 		 615 aa  77.8  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000781057  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4119  TonB-dependent vitamin B12 receptor  23.43 
 
 		 616 aa  77.8  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2728  hypothetical protein  23.31 
 
 		 628 aa  77.8  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000615794  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2092  TonB-dependent receptor  33.09 
 
 		 670 aa  77.4  0.0000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.64 
 
 		 614 aa  77  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.64 
 
 		 614 aa  77  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.64 
 
 		 614 aa  76.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  23.4 
 
 		 665 aa  76.6  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 682 aa  75.5  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.43 
 
 		 614 aa  75.1  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  27.8 
 
 		 659 aa  74.7  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2970  TonB-dependent receptor protein  29.29 
 
 		 651 aa  74.7  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.140883  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  22.88 
 
 		 634 aa  74.7  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2219  TonB-dependent receptor  22.01 
 
 		 692 aa  73.6  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2789  TonB-dependent receptor  22.6 
 
 		 698 aa  73.6  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.973502 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  22.87 
 
 		 633 aa  72.4  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  22.08 
 
 		 618 aa  72.4  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1099  TonB-dependent receptor  23.53 
 
 		 643 aa  72.8  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2621  TonB-dependent receptor, plug  22 
 
 		 695 aa  72.4  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1552  TonB-dependent receptor HmuR  24.63 
 
 		 646 aa  71.6  0.00000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3807  TonB-dependent receptor plug  25.31 
 
 		 655 aa  71.6  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  23.37 
 
 		 681 aa  71.6  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2744  TonB-dependent receptor  22.73 
 
 		 701 aa  71.6  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  33.33 
 
 		 631 aa  71.2  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  24.58 
 
 		 655 aa  71.2  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3416  TonB-dependent receptor plug  22.61 
 
 		 684 aa  70.5  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.717717  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1301  TonB-dependent receptor  32.59 
 
 		 634 aa  69.7  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1651  TonB-dependent receptor  23.51 
 
 		 648 aa  69.7  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613844 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1001  TonB-dependent receptor  34.48 
 
 		 628 aa  70.1  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.11298  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0663  TonB-dependent receptor  23.42 
 
 		 652 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136044  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 679 aa  69.3  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>