12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2728 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2637  hypothetical protein  65.03 
 
 		 631 aa  884    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2728  hypothetical protein  100 
 
 		 628 aa  1289    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000615794  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01529  putative orphan protein  69.12 
 
 		 624 aa  915    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.422212  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3493  TonB-dependent receptor  44.86 
 
 		 621 aa  506  9.999999999999999e-143  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227534 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2071  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 629 aa  85.9  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00162344  hitchhiker  0.000156466 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2526  TonB-dependent receptor  23.31 
 
 		 620 aa  77.8  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.995023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4414  TonB-dependent receptor plug  21.59 
 
 		 639 aa  65.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3315  TonB-dependent receptor plug  27.89 
 
 		 650 aa  64.7  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4821  TonB-dependent receptor  22.64 
 
 		 621 aa  61.2  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1481  TonB-dependent receptor  22.78 
 
 		 674 aa  50.4  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0173398  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5752  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 746 aa  47.4  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0523831  hitchhiker  0.0000000000276247 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  21.07 
 
 		 701 aa  46.2  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>