More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4910 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4910  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 258 aa  518  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30240  IclR family regulatory protein  74.32 
 
 		 258 aa  378  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3124  IclR family transcriptional regulator  73.15 
 
 		 258 aa  363  1e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.845824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2147  IclR family transcriptional regulator  74.32 
 
 		 258 aa  362  3e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.197255 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2601  IclR family transcriptional regulator  73.15 
 
 		 258 aa  362  3e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505615  normal  0.0687199 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3242  IclR family transcriptional regulator  73.15 
 
 		 258 aa  349  2e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.524532 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0296  IclR family transcriptional regulator  64.73 
 
 		 260 aa  340  2e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02910  IclR family transcriptional regulator  69.38 
 
 		 259 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186754 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6106  IclR family transcriptional regulator  47.88 
 
 		 280 aa  235  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.5704 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2088  transcriptional regulator, IclR family  52 
 
 		 273 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2705  regulatory proteins, IclR  51.71 
 
 		 284 aa  232  4.0000000000000004e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.393671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5724  transcriptional regulator, IclR family  50.99 
 
 		 260 aa  231  6e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2707  regulatory protein IclR  47.6 
 
 		 292 aa  223  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4650  IclR family transcriptional regulator  50.8 
 
 		 273 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.455658 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4108  transcriptional regulator, IclR family  50.21 
 
 		 260 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5781  transcriptional regulator, IclR family  45.63 
 
 		 271 aa  214  8e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2426  IclR family transcriptional regulator  50.64 
 
 		 269 aa  207  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.172825 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5789  transcriptional regulator, IclR family  35.77 
 
 		 268 aa  142  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5796  IclR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 245 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  32.77 
 
 		 280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  31.17 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  31.62 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 284 aa  107  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  34.73 
 
 		 251 aa  106  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2575  transcriptional regulator, IclR family  32.51 
 
 		 262 aa  102  8e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  30.77 
 
 		 259 aa  102  9e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2370  IclR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 268 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2746  transcriptional regulator, IclR family  30.74 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.881679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1499  IclR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 274 aa  98.6  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.985089  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08220  transcriptional regulator, IclR family  30.89 
 
 		 257 aa  96.7  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4694  transcriptional regulator, IclR family  31.71 
 
 		 255 aa  96.3  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.116545  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  32.49 
 
 		 256 aa  95.9  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5574  IclR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 274 aa  95.5  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  29.15 
 
 		 277 aa  95.5  8e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5128  transcriptional regulator, IclR family  32.89 
 
 		 251 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0099  transcriptional regulator, IclR family  27.46 
 
 		 262 aa  94  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 260 aa  94  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  31.87 
 
 		 252 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3711  transcriptional regulator, IclR family  33.91 
 
 		 257 aa  93.2  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.498866 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  28.46 
 
 		 276 aa  93.2  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  29.03 
 
 		 280 aa  93.6  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  29.03 
 
 		 280 aa  93.6  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  29.03 
 
 		 280 aa  93.6  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0416  regulatory proteins, IclR  26.91 
 
 		 246 aa  93.6  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000505949  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  36.55 
 
 		 290 aa  92.8  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  29.46 
 
 		 257 aa  92.8  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3431  IclR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 251 aa  92.8  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2369  regulatory proteins, IclR  29.52 
 
 		 287 aa  92.8  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1166  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 271 aa  92.4  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  27.49 
 
 		 275 aa  92.4  7e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  29.2 
 
 		 277 aa  92  8e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  26.72 
 
 		 274 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  26.72 
 
 		 274 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  26.72 
 
 		 274 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 267 aa  91.3  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  29.37 
 
 		 277 aa  91.3  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  26.72 
 
 		 274 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  26.72 
 
 		 274 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1087  transcriptional regulator, IclR family  30.51 
 
 		 258 aa  90.5  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 275 aa  90.9  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3210  transcriptional regulator, IclR family  30.2 
 
 		 251 aa  90.5  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1930  IclR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 261 aa  90.1  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6969  IclR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 283 aa  89.7  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  27.13 
 
 		 276 aa  89.7  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  27.49 
 
 		 274 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  27.49 
 
 		 274 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  27.49 
 
 		 274 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  27.49 
 
 		 274 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  27.49 
 
 		 274 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  27.49 
 
 		 274 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  27.49 
 
 		 274 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  27.49 
 
 		 274 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  27.19 
 
 		 257 aa  89  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  28.86 
 
 		 260 aa  88.6  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 260 aa  87.8  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1072  IclR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0478344  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3411  transcription regulator protein  28.34 
 
 		 262 aa  88.2  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.531114 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4081  IclR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 291 aa  88.2  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  28.46 
 
 		 257 aa  87.4  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1375  pca regulon regulatory protein  26.42 
 
 		 291 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  28.63 
 
 		 260 aa  87.4  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4014  regulatory proteins, IclR  26.4 
 
 		 280 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.604486  hitchhiker  0.00571873 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1265  IclR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 280 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0265  transcriptional regulator, IclR family  30.49 
 
 		 264 aa  87.4  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5288  regulatory protein, IclR  30.59 
 
 		 278 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.497587 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4348  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  26.42 
 
 		 291 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.974938  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  28.69 
 
 		 260 aa  87  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  30.3 
 
 		 252 aa  86.7  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4310  Pca regulon regulatory protein PcaR  26.4 
 
 		 280 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5473  regulatory protein IclR  26.41 
 
 		 277 aa  86.3  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1604  IclR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 259 aa  86.3  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.379428  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  30.33 
 
 		 277 aa  86.7  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  31.73 
 
 		 263 aa  86.3  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4439  IclR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 291 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103527 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3645  IclR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 265 aa  86.3  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0822  transcriptional regulator, IclR family  31.95 
 
 		 258 aa  86.3  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3174  regulatory protein, IclR  29.2 
 
 		 264 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4884  transcriptional regulator, IclR family  33.63 
 
 		 260 aa  85.9  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.574165  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1381  transcriptional regulator, IclR family  31.45 
 
 		 259 aa  85.9  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0265697  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  32.02 
 
 		 266 aa  85.5  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>