More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4457 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  73.93 
 
 		 585 aa  822    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4291  sensor histidine kinase  73.02 
 
 		 585 aa  832    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3994  sensor histidine kinase  73.71 
 
 		 585 aa  838    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0892776 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4457  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 586 aa  1175    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4321  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  73.93 
 
 		 585 aa  821    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6314  putative two-component sensor  68.47 
 
 		 586 aa  721    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1043  histidine kinase  73.36 
 
 		 585 aa  804    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4409  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  74.27 
 
 		 585 aa  828    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72740  putative two-component sensor  69.01 
 
 		 588 aa  728    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.658354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4562  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.25 
 
 		 591 aa  560  1e-158  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18010  C4-dicarboylate transport sensory histidine protein kinase, two-component; DctB  51.81 
 
 		 592 aa  501  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892386  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0478  histidine kinase  38.34 
 
 		 616 aa  352  2e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.936007 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1259  ATPase domain-containing protein  37.91 
 
 		 626 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.27586 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1420  histidine kinase  37.74 
 
 		 621 aa  336  7e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.990056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1209  histidine kinase  37.3 
 
 		 621 aa  316  8e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0276  sensor histidine kinase  37.27 
 
 		 659 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3454  histidine kinase  35.88 
 
 		 623 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1248  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 		 628 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0477  C4-dicarboxylate transport sensor histidine kinase DctB  37.61 
 
 		 677 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.277779  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0457  C4-dicarboxylate transport sensor histidine kinase DctB  37.61 
 
 		 677 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.7577  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0028  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.83 
 
 		 884 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.465168  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4049  histidine kinase  35.86 
 
 		 630 aa  305  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431231  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3901  histidine kinase  37.26 
 
 		 615 aa  304  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.896437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0010  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.55 
 
 		 884 aa  303  5.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.26 
 
 		 635 aa  303  5.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4539  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 		 637 aa  301  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0810573  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0519  histidine kinase  34.13 
 
 		 666 aa  300  3e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02398  sensor histidine kinase  47.38 
 
 		 881 aa  300  4e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0641  C4-dicarboxylate transport sensor protein  37.61 
 
 		 677 aa  300  5e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0400  C4-dicarboxylate transport sensor protein  37.13 
 
 		 677 aa  299  8e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3259  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 		 622 aa  298  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.157895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4691  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 638 aa  298  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.203801 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4196  histidine kinase  34.58 
 
 		 666 aa  296  5e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.531315 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0008  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  35.98 
 
 		 634 aa  296  6e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.368078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4927  histidine kinase  36.05 
 
 		 627 aa  296  8e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5220  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 		 631 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.747879 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3284  histidine kinase  35.45 
 
 		 625 aa  295  1e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3060  ATPase domain-containing protein  35.46 
 
 		 625 aa  295  2e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457203  normal  0.839364 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3025  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 		 634 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5341  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 		 634 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2922  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.46 
 
 		 883 aa  294  4e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301068 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.46 
 
 		 683 aa  293  5e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2883  histidine kinase  33.76 
 
 		 669 aa  293  6e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0193  histidine kinase  36.64 
 
 		 670 aa  292  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0541233 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0331  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  36.66 
 
 		 665 aa  292  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0229  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.29 
 
 		 668 aa  291  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.930854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2150  sensor histidine kinase  37.97 
 
 		 591 aa  290  4e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.422242 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0307  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 		 627 aa  290  4e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.876198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3170  histidine kinase  35.3 
 
 		 597 aa  289  8e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111612  normal  0.304086 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4175  sensor histidine kinase  35.44 
 
 		 643 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2258  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 		 669 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.2 
 
 		 672 aa  289  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.622547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2872  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 		 669 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13678  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0184  histidine kinase  35.38 
 
 		 604 aa  288  2e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.981711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6214  histidine kinase  34.72 
 
 		 669 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1425  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 603 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.524026  normal  0.827969 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 		 603 aa  287  4e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2927  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.89 
 
 		 672 aa  287  4e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2668  histidine kinase  36.69 
 
 		 638 aa  286  7e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 		 627 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 		 598 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0431  histidine kinase  34.89 
 
 		 668 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2952  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 		 598 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.078149 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 		 622 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.534155 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1515  C4-dicarboxylate transport sensor protein  32.62 
 
 		 597 aa  285  2.0000000000000002e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0225348  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1549  histidine kinase  31.23 
 
 		 598 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.924403  normal  0.563022 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2809  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 		 598 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3935  histidine kinase  33.92 
 
 		 667 aa  283  5.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.707276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1360  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 		 603 aa  282  1e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1413  ATPase domain-containing protein  31.74 
 
 		 603 aa  282  1e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3355  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.41 
 
 		 880 aa  281  2e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0607488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4294  histidine kinase  35.63 
 
 		 626 aa  281  3e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0465122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1731  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 		 621 aa  281  3e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.144225  normal  0.746753 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2789  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 		 677 aa  279  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3461  histidine kinase  35.23 
 
 		 600 aa  278  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1436  histidine kinase  35.47 
 
 		 617 aa  278  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5668  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 		 623 aa  278  3e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2718  histidine kinase  36.6 
 
 		 623 aa  276  8e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1572  C4-dicarboxylate transport sensor protein  33.71 
 
 		 643 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000397989  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2212  putative two-component sensor histidine kinase protein  33 
 
 		 600 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0082  C4-dicarboxylate transport sensor kinase  33.33 
 
 		 643 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0131  histidine kinase  36.71 
 
 		 630 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399979  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0101  sensor histidine kinase  34.08 
 
 		 643 aa  274  3e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000798435  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0229  histidine kinase  34.79 
 
 		 645 aa  274  3e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2979  histidine kinase  36.19 
 
 		 622 aa  272  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0797138 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2406  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 		 652 aa  272  2e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4049  putative two-component sensor  34.75 
 
 		 618 aa  271  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3912  sensor histidine kinase  34.2 
 
 		 635 aa  270  4e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277084 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46980  putative two-component sensor  34.47 
 
 		 633 aa  270  5e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0066179  normal  0.0520947 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0368  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.33 
 
 		 620 aa  269  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1775  histidine kinase  35.51 
 
 		 615 aa  268  2e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.520686  normal  0.0542298 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1457  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 		 618 aa  268  2.9999999999999995e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.798107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1723  histidine kinase  30.34 
 
 		 608 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.10547 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0714  C4-dicarboxylate transport sensor protein ATPase subunit  31.06 
 
 		 594 aa  266  5.999999999999999e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4177  histidine kinase  33.39 
 
 		 620 aa  265  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.661658  normal  0.571454 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4339  histidine kinase  35.7 
 
 		 600 aa  264  3e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2911  ATPase domain-containing protein  29.32 
 
 		 613 aa  265  3e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2012  C4-dicarboxylate transport sensor protein  30.12 
 
 		 611 aa  263  4.999999999999999e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3479  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 		 621 aa  263  6.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0289  histidine kinase  34.14 
 
 		 604 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>