More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1759 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1759  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 151 aa  300  3.0000000000000004e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0120773  normal  0.159255 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0652  AsnC family transcriptional regulator  68.21 
 
 		 151 aa  209  9e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.22955 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1866  AsnC family transcriptional regulator  66.23 
 
 		 151 aa  203  7e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0515  AsnC family transcriptional regulator  65.56 
 
 		 151 aa  202  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.900323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2302  AsnC family transcriptional regulator  60.93 
 
 		 151 aa  174  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1239  AsnC family transcriptional regulator  58.28 
 
 		 151 aa  172  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.677106 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2395  transcriptional regulator  59.06 
 
 		 152 aa  164  4e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 156 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 156 aa  100  9e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  32.89 
 
 		 156 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 156 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  37.67 
 
 		 155 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 156 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  36.99 
 
 		 155 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  30.87 
 
 		 157 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4299  AsnC family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 155 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  30.87 
 
 		 157 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0128903 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2574  AsnC family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 154 aa  94  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518335  normal  0.327443 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1974  AsnC family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 156 aa  94  6e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.739408  normal  0.486405 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  32.21 
 
 		 159 aa  94  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  32.89 
 
 		 156 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5396  transcriptional regulator, AsnC family  34.23 
 
 		 175 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1611  normal  0.0284366 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 158 aa  92.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6537  transcriptional regulator, AsnC family  34.23 
 
 		 156 aa  91.3  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.201415 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4141  AsnC family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 166 aa  90.1  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.845485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0870  AsnC family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 169 aa  90.5  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.592101  normal  0.410533 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4793  AsnC family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 166 aa  90.1  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3375  AsnC family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 166 aa  90.1  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 159 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0841  AsnC family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 167 aa  87.8  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1520  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 161 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5406  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 169 aa  86.7  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 162 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2198  AsnC family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 160 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1442  transcriptional regulator, AsnC family  34.44 
 
 		 151 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2394  transcriptional regulator  34.53 
 
 		 152 aa  85.9  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4647  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 158 aa  85.1  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1696  transcriptional regulator, AsnC family  32.89 
 
 		 173 aa  84.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.346249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2003  transcriptional regulator, AsnC family  32.89 
 
 		 173 aa  84.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.647714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0615  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 166 aa  84.7  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.615736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1963  transcriptional regulator, AsnC family  32.67 
 
 		 160 aa  84.3  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 156 aa  84.3  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1429  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 157 aa  84.3  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0653  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 152 aa  84  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.594431  normal  0.222983 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0985  AsnC family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 157 aa  84  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 172 aa  84  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0783  AsnC family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.514102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1867  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  27.52 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 155 aa  83.2  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2301  AsnC family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5156  AsnC family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.949798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6457  AsnC family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.545436 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5348  transcriptional regulator, AsnC family  29.53 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3359  transcriptional regulator, AsnC family  34.21 
 
 		 168 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2209  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4009  AsnC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 168 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0516  AsnC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.904906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2859  AsnC family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 166 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3309  AsnC family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 166 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0359106 
 
 
-
 
NC_003296  RS05577  transcription regulator protein  30.87 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47707  normal  0.300732 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1045  AsnC family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.596576  normal  0.823935 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5214  AsnC family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 166 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 156 aa  80.5  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3124  AsnC family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 160 aa  80.1  0.000000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5346  hitchhiker  0.0061369 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3149  transcriptional regulator, AsnC family  30.2 
 
 		 169 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0655  AsnC family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3876  AsnC family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.990954 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  32.67 
 
 		 161 aa  79.3  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3679  AsnC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 152 aa  79.3  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0942  AsnC family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 154 aa  80.1  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1802  regulatory proteins, AsnC/Lrp  31.54 
 
 		 168 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.596593  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1758  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00375085  normal  0.163096 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1369  AsnC family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5122  transcriptional regulator, AsnC family  31.54 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5098  transcriptional regulator, AsnC family  30.2 
 
 		 169 aa  78.6  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 174 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1100  leucine-responsive regulatory protein, putative  30.87 
 
 		 169 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121035  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1501  AsnC family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449471  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1990  transcriptional regulator, AsnC family  31.33 
 
 		 161 aa  77.8  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141708  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2461  leucine-responsive transcriptional regulator  30.77 
 
 		 161 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000018296  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3514  AsnC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0500665  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1659  transcriptional regulator, AsnC family  31.33 
 
 		 161 aa  77.8  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3597  AsnC family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 173 aa  77.4  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.680866 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0033  transcriptional regulator, AsnC family  31.54 
 
 		 161 aa  77.4  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000210116 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0257  AsnC family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 166 aa  77  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1240  AsnC family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 151 aa  77.4  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.659935 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0882  transcriptional regulator, AsnC family  30.87 
 
 		 152 aa  77  0.00000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5825  transcriptional regulator, AsnC family  34.9 
 
 		 156 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.269071  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1869  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 156 aa  77  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0065  AsnC family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 155 aa  77  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0481565  normal  0.0654338 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2442  AsnC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 168 aa  77  0.00000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.127715  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2413  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 159 aa  77  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17098 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 168 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3337  AsnC family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2859  AsnC family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368271 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>