278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1028 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1028  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
183 aa  377  1e-104  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0845  phosphoglycerate mutase  52.24 
 
 
204 aa  206  1e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.249912 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2301  fructose-2,6-biphosphatase  37.71 
 
 
199 aa  121  6e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2658  phosphoglycerate mutase  37.97 
 
 
216 aa  117  9e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0521  fructose-2,6-biphosphatase  39.74 
 
 
183 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.37319  normal  0.0108392 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0100  phosphoglycerate mutase  33.95 
 
 
191 aa  98.2  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3497  putative phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.45 
 
 
196 aa  91.7  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.668358  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1000  alpha-ribazole phosphatase  31.33 
 
 
196 aa  86.7  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0677  phosphoglycerate mutase  32.97 
 
 
203 aa  85.5  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0384229  normal  0.186973 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0151  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.8 
 
 
185 aa  85.1  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2208  alpha-ribazole phosphatase  31.33 
 
 
196 aa  85.1  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0271379  normal  0.94187 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2568  Phosphoglycerate mutase  28.72 
 
 
183 aa  82.4  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2661  alpha-ribazole phosphatase  29.87 
 
 
192 aa  79  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.321223  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0640  phosphoglycerate mutase  30.86 
 
 
184 aa  78.6  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0203907 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1411  phosphoglycerate mutase  32.68 
 
 
197 aa  78.2  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.722686  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0739  phosphoglycerate mutase  30.11 
 
 
182 aa  77.4  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2395  hypothetical protein  30.52 
 
 
192 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0609145 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0656  Phosphoglycerate mutase  34.65 
 
 
203 aa  76.6  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161157  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0927  phosphoglycerate mutase  31.76 
 
 
194 aa  76.3  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0214676  normal  0.879508 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2203  alpha-ribazole phosphatase  29.87 
 
 
192 aa  75.9  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0925085 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4486  Phosphoglycerate mutase  31.87 
 
 
174 aa  73.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0491254 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0090  phosphoglycerate mutase  29.56 
 
 
177 aa  73.6  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2783  phosphoglycerate mutase  30.26 
 
 
195 aa  73.2  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.448968  normal  0.574141 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0660  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  28.1 
 
 
196 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5687  phosphoglycerate mutase  29.01 
 
 
200 aa  72.4  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00492509  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3764  Phosphoglycerate mutase  34.11 
 
 
196 aa  72  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1343  Phosphoglycerate mutase  30.68 
 
 
202 aa  69.3  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390919  normal  0.275943 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0632  phosphoglycerate mutase  28.66 
 
 
177 aa  68.6  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.209628  normal  0.482177 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  29.17 
 
 
211 aa  68.2  0.00000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0690  phosphoglycerate mutase family protein  31.41 
 
 
199 aa  67  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1033  alpha-ribazole phosphatase  31.41 
 
 
199 aa  67  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.341718  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1039  alpha-ribazole phosphatase  31.41 
 
 
199 aa  67  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.634348  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1634  alpha-ribazole phosphatase  31.41 
 
 
199 aa  67  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.135976  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2964  phosphoglycerate mutase family protein  31.41 
 
 
199 aa  67  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2322  phosphoglycerate mutase family protein  31.41 
 
 
199 aa  67  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0938513  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1193  phosphoglycerate mutase family protein  31.41 
 
 
616 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.670037  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  27.06 
 
 
224 aa  62  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  23.26 
 
 
196 aa  61.6  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  30 
 
 
222 aa  61.2  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  30 
 
 
222 aa  61.2  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2499  phosphoglycerate mutase  32.03 
 
 
194 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458709  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2026  phosphoglycerate mutase family protein  28.93 
 
 
177 aa  60.1  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0128823 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3811  alpha-ribazole phosphatase  33.63 
 
 
198 aa  59.7  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3895  alpha-ribazole phosphatase  33.63 
 
 
198 aa  59.3  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0234787 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  29.55 
 
 
210 aa  58.9  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4039  phosphoglycerate mutase  31.9 
 
 
188 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0873  phosphoglycerate mutase  30.46 
 
 
247 aa  58.5  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1680  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  33.33 
 
 
188 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2367  alpha-ribazole phosphatase  30.72 
 
 
194 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1226  Phosphoglycerate mutase  27.98 
 
 
195 aa  58.2  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.129631  normal  0.708444 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0839  phosphoglycerate mutase family protein, putative  29.46 
 
 
196 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.543457  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2609  phosphoglycerate mutase  27.93 
 
 
181 aa  58.2  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0843  alpha-ribazole phosphatase  31.45 
 
 
195 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4087  phosphoglycerate mutase  26.06 
 
 
215 aa  57.8  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  32.71 
 
 
198 aa  57.4  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  25.6 
 
 
210 aa  57  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0327  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  27.95 
 
 
189 aa  57  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02129  hypothetical protein  29.35 
 
 
204 aa  56.6  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3673  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.98 
 
 
190 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0299984  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0728  phosphoglycerate mutase  28.93 
 
 
195 aa  56.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2456  alpha-ribazole phosphatase  30.63 
 
 
194 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.788863  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  29.87 
 
 
201 aa  55.8  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1840  phosphoglycerate mutase  30.32 
 
 
194 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0552863  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2451  phosphoglycerate mutase  30.32 
 
 
194 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20579  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4661  phosphoglycerate mutase  28.83 
 
 
185 aa  56.2  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1279  alpha-ribazole phosphatase  31.43 
 
 
188 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.684394 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  24.67 
 
 
203 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  28.85 
 
 
205 aa  55.5  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  24.67 
 
 
203 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2288  phosphoglycerate mutase  32.35 
 
 
155 aa  55.5  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  24.67 
 
 
203 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  24.67 
 
 
203 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  24.67 
 
 
203 aa  55.1  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  24.67 
 
 
203 aa  55.1  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  27.63 
 
 
212 aa  55.5  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  24.67 
 
 
203 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  28.48 
 
 
452 aa  55.1  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  23.38 
 
 
212 aa  55.1  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  23.38 
 
 
212 aa  55.1  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  28.57 
 
 
213 aa  54.7  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5377  Phosphoglycerate mutase  22.98 
 
 
177 aa  54.3  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2605  phosphoglycerate mutase family protein  32.43 
 
 
180 aa  53.9  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  28.12 
 
 
203 aa  53.9  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3007  alpha-ribazole phosphatase  26.21 
 
 
203 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000150204  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  29.68 
 
 
213 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  32.46 
 
 
214 aa  53.9  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0454  phosphoglycerate mutase  26.49 
 
 
193 aa  53.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.079929  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  24.2 
 
 
240 aa  53.9  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  32.46 
 
 
214 aa  53.9  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_002950  PG0704  phosphoglycerate mutase family protein  23.9 
 
 
179 aa  53.5  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000429574 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5852  Phosphoglycerate mutase  27.47 
 
 
197 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  30.19 
 
 
208 aa  52.8  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1026  Phosphoglycerate mutase  25.83 
 
 
182 aa  52.8  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  30 
 
 
208 aa  52  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  30.56 
 
 
201 aa  52  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  30.63 
 
 
215 aa  52.4  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05980  cytoplasm protein, putative  30.2 
 
 
605 aa  52  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.023684  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  32.69 
 
 
213 aa  52  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  30.37 
 
 
391 aa  52  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2711  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  27.75 
 
 
202 aa  51.6  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.319958  normal  0.544372 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>