196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2892 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2892  hypothetical protein  100 
 
 		 499 aa  1001    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1564  hypothetical protein  35.62 
 
 		 504 aa  236  8e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.21515 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2817  Rhs element Vgr protein  30 
 
 		 593 aa  177  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1663  Rhs element Vgr protein  29.63 
 
 		 589 aa  157  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485896  normal  0.191701 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1906  Rhs element Vgr protein  27.64 
 
 		 606 aa  125  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194585  hitchhiker  0.0014616 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2267  Rhs element Vgr protein  29.66 
 
 		 610 aa  117  6e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267374  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0926  Rhs element Vgr protein  26.64 
 
 		 587 aa  115  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.91076  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1626  Rhs element Vgr protein  24.27 
 
 		 592 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0131276 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3822  Rhs element Vgr protein  26.02 
 
 		 578 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.112104  normal  0.0443202 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2462  hypothetical protein  23.06 
 
 		 595 aa  97.1  8e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1732  Rhs element Vgr protein  22.7 
 
 		 641 aa  95.9  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520263 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26590  hypothetical protein  26.42 
 
 		 599 aa  91.7  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0848935  normal  0.672502 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5384  Rhs element Vgr protein  27.66 
 
 		 602 aa  87.8  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1682  Rhs element Vgr protein  24.07 
 
 		 589 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0369  Rhs element Vgr protein  23.64 
 
 		 596 aa  85.1  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0669  Rhs element Vgr protein  21.9 
 
 		 576 aa  84.7  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0676  Rhs element Vgr protein  23.15 
 
 		 596 aa  84.7  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2550  Rhs element Vgr protein  22.08 
 
 		 589 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3927  Rhs element Vgr protein  21.46 
 
 		 604 aa  80.5  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00332693  hitchhiker  0.00450013 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3664  hypothetical protein  26.44 
 
 		 360 aa  80.5  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000879822 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6416  Rhs element Vgr protein  23.99 
 
 		 617 aa  79.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3003  Rhs element Vgr protein  21.48 
 
 		 598 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0982  hypothetical protein  27.05 
 
 		 362 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1051  Rhs element Vgr protein  25.1 
 
 		 594 aa  77  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0660  hypothetical protein  23.66 
 
 		 605 aa  76.6  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.279373 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4864  Rhs element Vgr protein  23.61 
 
 		 599 aa  74.3  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0846936  normal  0.155196 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3155  Rhs element Vgr protein  20.27 
 
 		 581 aa  74.7  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1042  phosphoserine phosphatase SerB  23.1 
 
 		 565 aa  73.9  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3609  Rhs element Vgr protein  23.02 
 
 		 574 aa  71.6  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2945  Rhs element Vgr protein  26.07 
 
 		 589 aa  70.9  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703955  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3043  Rhs element Vgr protein  27.03 
 
 		 229 aa  69.7  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160638 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0983  hypothetical protein  36.22 
 
 		 218 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208742  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3260  Rhs element Vgr protein  23.63 
 
 		 602 aa  68.6  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386521  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5250  Rhs element Vgr protein  22.35 
 
 		 596 aa  67.8  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012293 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3684  Rhs element Vgr protein  28.22 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.149401  hitchhiker  0.000521794 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1953  Rhs element Vgr protein  34.46 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3042  hypothetical protein  25.09 
 
 		 361 aa  63.9  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000069589 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3931  Rhs element Vgr protein  27.18 
 
 		 616 aa  62.8  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.410968  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  24.68 
 
 		 703 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0662  putative phage late control gene D protein  27 
 
 		 417 aa  59.7  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2555  hypothetical protein  31.85 
 
 		 273 aa  58.5  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000216389 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4109  Rhs element Vgr protein  22.54 
 
 		 576 aa  58.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0273732 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5894  Rhs element Vgr protein  22.54 
 
 		 615 aa  58.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2188  type VI secretion system Vgr family protein  27.56 
 
 		 656 aa  57.8  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.33539  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1538  two component LuxR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 621 aa  57.4  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0896  Rhs element Vgr protein  21.88 
 
 		 545 aa  57.4  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.79786 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1040  Rhs element Vgr protein  21.88 
 
 		 545 aa  57.4  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.605907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1509  Rhs element Vgr protein  26.97 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0339  putative VgrG protein  28.87 
 
 		 732 aa  57  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0852  putative phage late control gene D protein  25.75 
 
 		 417 aa  56.6  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4983  Rhs element Vgr protein  30.07 
 
 		 614 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0401  type VI secretion system Vgr family protein  28.87 
 
 		 740 aa  56.6  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1875  hypothetical protein  30.38 
 
 		 212 aa  56.2  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.133633  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0328  Rhs element Vgr protein  28.87 
 
 		 740 aa  56.6  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4390  Rhs element Vgr protein  22.73 
 
 		 652 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.86257  normal  0.698434 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4015  Rhs element Vgr protein  28.5 
 
 		 602 aa  55.1  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.211679  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3454  type VI secretion system Vgr family protein  26.92 
 
 		 655 aa  54.3  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2618  Rhs element Vgr protein  25.84 
 
 		 618 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  25.65 
 
 		 613 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4257  type VI secretion system Vgr family protein  27.46 
 
 		 610 aa  53.5  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2202  type VI secretion system Vgr family protein  27.71 
 
 		 702 aa  53.9  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0264417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0764  type VI secretion system Vgr family protein  31.86 
 
 		 741 aa  53.9  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0696  putative VgrG protein  31.86 
 
 		 741 aa  53.9  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  26.47 
 
 		 618 aa  53.5  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29390  hypothetical protein  28.16 
 
 		 689 aa  53.5  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1638  type VI secretion system Vgr family protein  27.71 
 
 		 702 aa  53.5  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.674786  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3558  type VI secretion system Vgr family protein  28.12 
 
 		 782 aa  53.5  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.125148  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3429  Rhs element Vgr protein  28.12 
 
 		 782 aa  53.5  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0251  type VI secretion system Vgr family protein  27.11 
 
 		 713 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.830075 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3238  type VI secretion system Vgr family protein  33.65 
 
 		 678 aa  52.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2959  hypothetical protein  28.12 
 
 		 644 aa  53.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027443 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1796  Rhs element Vgr protein  24.66 
 
 		 619 aa  52.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0243  type VI secretion system Vgr family protein  27.11 
 
 		 713 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0245  type VI secretion system Vgr family protein  27.11 
 
 		 713 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1080  hypothetical protein  20.94 
 
 		 599 aa  52  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.752206 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1607  type VI secretion system Vgr family protein  32.71 
 
 		 616 aa  52.4  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2696  type VI secretion system Vgr family protein  32.71 
 
 		 615 aa  52  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.187576  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4080  type VI secretion system Vgr family protein  29.08 
 
 		 771 aa  52  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000279673 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  26.74 
 
 		 646 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  28.38 
 
 		 741 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  28.42 
 
 		 689 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1162  type VI secretion system Vgr family protein  28.17 
 
 		 617 aa  51.6  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.754803  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0648  type VI secretion system Vgr family protein  28.17 
 
 		 609 aa  52  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3589  Rhs element Vgr protein  26.55 
 
 		 612 aa  51.6  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.512863 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0345  type VI secretion system Vgr family protein  32.71 
 
 		 619 aa  51.6  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1234  Vgr family type VI secretion system  29.2 
 
 		 704 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.270466 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  29.32 
 
 		 838 aa  51.6  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2064  type VI secretion system Vgr family protein  26.51 
 
 		 702 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.201838  normal  0.0713545 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1502  type VI secretion system Vgr family protein  28.08 
 
 		 617 aa  51.6  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  27.95 
 
 		 643 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3077  type VI secretion system Vgr family protein  30.53 
 
 		 633 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  29.32 
 
 		 841 aa  51.2  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0418  type VI secretion system Vgr family protein  28.17 
 
 		 617 aa  51.6  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0769  Rhs element Vgr protein  27.12 
 
 		 248 aa  51.2  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1114  type VI secretion system Vgr family protein  26.39 
 
 		 713 aa  51.6  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3254  vgrG protein  31.91 
 
 		 710 aa  51.2  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  29.32 
 
 		 841 aa  51.2  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1537  hypothetical protein  28.44 
 
 		 322 aa  50.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1508  phage protein D  22.38 
 
 		 348 aa  51.2  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0616  type VI secretion system Vgr family protein  30.53 
 
 		 633 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0499415  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>