More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0445 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3126  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  79.62 
 
 		 638 aa  1043    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.940484  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3264  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  60.5 
 
 		 638 aa  793    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000706874  normal  0.0228464 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1177  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  78.18 
 
 		 637 aa  1012    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0271932  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1615  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  63.92 
 
 		 647 aa  855    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3256  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  76.8 
 
 		 638 aa  979    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000224901  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2603  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.39 
 
 		 637 aa  897    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1122  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  70.49 
 
 		 646 aa  915    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2452  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  70.6 
 
 		 646 aa  930    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.924781  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1053  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  66.88 
 
 		 648 aa  874    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0676  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  63.21 
 
 		 666 aa  884    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.762108  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0445  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  100 
 
 		 637 aa  1323    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000586543  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0670  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.75 
 
 		 640 aa  910    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2081  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.94 
 
 		 646 aa  832    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0585  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  59.46 
 
 		 638 aa  785    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.755326  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0211  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  64.23 
 
 		 659 aa  859    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.24526 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1934  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  64.13 
 
 		 646 aa  818    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2087  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  59.62 
 
 		 639 aa  757    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0241  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  62.5 
 
 		 679 aa  872    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.588419  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2396  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  79.43 
 
 		 637 aa  1026    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000124649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2213  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  75.55 
 
 		 638 aa  969    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00041911  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1709  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  68.24 
 
 		 643 aa  902    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0636844  normal  0.274652 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3922  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  71.07 
 
 		 648 aa  933    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0641  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  60.91 
 
 		 635 aa  786    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.889552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2818  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.54 
 
 		 636 aa  903    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2637  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  70.17 
 
 		 636 aa  907    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2933  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  79.47 
 
 		 638 aa  1039    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0385  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.81 
 
 		 649 aa  895    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.342601  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3466  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  68.82 
 
 		 645 aa  875    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5010  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  67.44 
 
 		 645 aa  890    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5227  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  67.56 
 
 		 646 aa  859    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.416084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5880  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  70.72 
 
 		 642 aa  918    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0917761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23330  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  66.15 
 
 		 735 aa  871    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6535  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  64.7 
 
 		 657 aa  862    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.064478  normal  0.326104 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2442  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  66.36 
 
 		 646 aa  875    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3019  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  79.62 
 
 		 638 aa  1043    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.07389  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1277  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  68.03 
 
 		 654 aa  860    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157042  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2473  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  72.06 
 
 		 637 aa  957    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0913  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  78.96 
 
 		 637 aa  1020    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27671e-31 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04695  succinate dehydrogenase  63.27 
 
 		 667 aa  886    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3080  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  71.97 
 
 		 656 aa  925    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1917  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  55.4 
 
 		 664 aa  686    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.030086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2399  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  71.5 
 
 		 656 aa  920    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1733  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  71.11 
 
 		 637 aa  921    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3970  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.45 
 
 		 662 aa  868    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.755749  normal  0.869131 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2452  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  70.75 
 
 		 644 aa  936    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3325  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  61.7 
 
 		 636 aa  819    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8457  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.5 
 
 		 642 aa  894    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1556  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.86 
 
 		 637 aa  914    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.75468  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2482  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  75.59 
 
 		 638 aa  961    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0101  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.99 
 
 		 658 aa  873    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3552  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  66.46 
 
 		 672 aa  872    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1706  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  68.55 
 
 		 643 aa  904    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254463 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1577  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  73.27 
 
 		 657 aa  938    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0114016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0985  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  68.49 
 
 		 652 aa  909    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.831931  normal  0.817147 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2852  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  66.1 
 
 		 646 aa  857    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3333  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  78.81 
 
 		 637 aa  1019    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000650978  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5261  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  62.17 
 
 		 639 aa  790    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2723  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.86 
 
 		 636 aa  906    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01691  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  57.73 
 
 		 638 aa  723    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.555604 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2571  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.13 
 
 		 593 aa  355  2e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3216  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.07 
 
 		 597 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4625  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.23 
 
 		 597 aa  343  5e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4413  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.07 
 
 		 597 aa  343  7e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.630404  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4629  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.07 
 
 		 597 aa  343  7e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4754  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.07 
 
 		 597 aa  343  7e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4252  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.07 
 
 		 597 aa  342  8e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4644  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.07 
 
 		 597 aa  341  2e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4264  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.07 
 
 		 597 aa  341  2e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.41034  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4645  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.07 
 
 		 597 aa  341  2e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0401261  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0610  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.9 
 
 		 597 aa  340  4e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4345  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.9 
 
 		 597 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0844  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.72 
 
 		 585 aa  334  3e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2606  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.18 
 
 		 585 aa  333  5e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000856903  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0731  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.69 
 
 		 588 aa  332  1e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.306166  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1229  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.69 
 
 		 588 aa  332  1e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1207  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.69 
 
 		 588 aa  332  1e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1862  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.12 
 
 		 586 aa  331  3e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1869  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.12 
 
 		 585 aa  325  2e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000746215  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0744  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.61 
 
 		 578 aa  311  2e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000832162  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0881  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.33 
 
 		 625 aa  307  3e-82  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1995  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  30.72 
 
 		 567 aa  214  4.9999999999999996e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1687  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  28.9 
 
 		 575 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0263858 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0635  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  30.96 
 
 		 566 aa  211  5e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0393941  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2788  fumarate reductase flavoprotein subunit  28.87 
 
 		 617 aa  208  2e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1856  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  30.88 
 
 		 575 aa  209  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1882  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  30.88 
 
 		 575 aa  209  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.764609  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1206  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  29.67 
 
 		 596 aa  209  2e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0677  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  29.23 
 
 		 566 aa  208  3e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0486405  hitchhiker  0.0000605931 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0284  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  29.87 
 
 		 567 aa  207  4e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.947176 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3602  succinate dehydrogenase subunit A  27.58 
 
 		 598 aa  205  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1869  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  30.76 
 
 		 598 aa  204  4e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.462567  normal  0.466053 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  29.44 
 
 		 568 aa  202  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1569  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  29.83 
 
 		 575 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  hitchhiker  0.000112727 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0354  fumarate reductase flavoprotein subunit  29.83 
 
 		 591 aa  201  3e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0170  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  30.34 
 
 		 566 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  28.25 
 
 		 578 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0177  succinate dehydrogenase subunit A  29.81 
 
 		 567 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0248  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  28.97 
 
 		 567 aa  199  1.0000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0415  fumarate reductase flavoprotein subunit  29.92 
 
 		 662 aa  198  3e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00858374  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002237  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  28.43 
 
 		 599 aa  196  9e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>