285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1401 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1401  lipoate-protein ligase B  100 
 
 		 228 aa  460  1e-129  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111273 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1183  lipoate-protein ligase B  66.48 
 
 		 212 aa  236  2e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.191181  normal  0.0501613 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6764  lipoate-protein ligase B  46.11 
 
 		 212 aa  156  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0097  lipoate-protein ligase B  39.32 
 
 		 207 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2037  lipoate-protein ligase B  40.59 
 
 		 228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1675  lipoate-protein ligase B  42.65 
 
 		 228 aa  145  5e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2075  lipoate-protein ligase B  40.44 
 
 		 237 aa  145  6e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2547  lipoate-protein ligase B  43.5 
 
 		 221 aa  142  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.621544  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0832  lipoate-protein ligase B  42.31 
 
 		 235 aa  139  3.9999999999999997e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1922  lipoate-protein ligase B  37.95 
 
 		 232 aa  138  6e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1701  lipoate-protein ligase B  36.32 
 
 		 231 aa  136  2e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1269  lipoate-protein ligase B  40.82 
 
 		 214 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12245  lipoate-protein ligase B  40.66 
 
 		 230 aa  134  8e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.155606  normal  0.410029 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4305  lipoate-protein ligase B  36.11 
 
 		 251 aa  134  9e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  39.59 
 
 		 211 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2078  lipoate-protein ligase B  39.81 
 
 		 218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38676  predicted protein  41.41 
 
 		 203 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.900214  hitchhiker  0.00616982 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1859  lipoate-protein ligase B  39.05 
 
 		 218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3326  lipoate-protein ligase B  40 
 
 		 238 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2933  lipoate-protein ligase B  37.13 
 
 		 238 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3315  lipoate-protein ligase B  40 
 
 		 238 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3377  lipoate-protein ligase B  40 
 
 		 238 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05530  lipoate-protein ligase B  34.53 
 
 		 233 aa  132  5e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1741  lipoate-protein ligase B  39.81 
 
 		 238 aa  132  5e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0367071 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1031  lipoate-protein ligase B  38.27 
 
 		 209 aa  132  5e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.242736  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0700  lipoate-protein ligase B  43.5 
 
 		 228 aa  132  6e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.248004  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2259  lipoate-protein ligase B  36.99 
 
 		 259 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  41.04 
 
 		 230 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3031  lipoate-protein ligase B  39.51 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  38.76 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0454  lipoate-protein ligase B  37.68 
 
 		 224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0466  lipoyltransferase  34.36 
 
 		 244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3581  lipoate-protein ligase B  35.35 
 
 		 238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.460285  normal  0.0785482 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10460  lipoate-protein ligase B  39.57 
 
 		 246 aa  129  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00811076  normal  0.015008 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1130  lipoate-protein ligase B  38.76 
 
 		 221 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0209414 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0269  lipoate-protein ligase B  37.82 
 
 		 218 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.896037 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0707  lipoate-protein ligase B  42.56 
 
 		 204 aa  128  6e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0100  lipoate-protein ligase B  36.95 
 
 		 209 aa  128  6e-29  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2713  lipoate-protein ligase B  37.86 
 
 		 218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.298304  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  40.23 
 
 		 365 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3712  lipoate-protein ligase B  36.54 
 
 		 240 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  39.66 
 
 		 365 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  39.66 
 
 		 365 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2704  lipoate-protein ligase B  42.46 
 
 		 203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  39.89 
 
 		 383 aa  126  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0763  lipoate-protein ligase B  39.67 
 
 		 232 aa  126  3e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4188  lipoyltransferase  38.46 
 
 		 213 aa  126  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0627971 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0719  lipoate-protein ligase B  43.72 
 
 		 204 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.24811e-18 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3076  lipoate-protein ligase B  39.72 
 
 		 251 aa  125  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0986456  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1043  lipoate-protein ligase B  39.51 
 
 		 240 aa  125  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.69675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1344  lipoate-protein ligase B  36.36 
 
 		 247 aa  125  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.156336  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1770  lipoate-protein ligase B  35.89 
 
 		 232 aa  125  5e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.063532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2641  Lipoyl(octanoyl) transferase  41.53 
 
 		 225 aa  125  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0514097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3443  lipoate-protein ligase B  35.68 
 
 		 236 aa  124  9e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.822951  normal  0.715309 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5876  lipoate-protein ligase B  39.77 
 
 		 245 aa  124  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2081  lipoate-protein ligase B  38.81 
 
 		 237 aa  124  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.252656  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1756  lipoate-protein ligase B  37.79 
 
 		 227 aa  123  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3883  lipoyltransferase  40.21 
 
 		 202 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2353  lipoyltransferase  38.69 
 
 		 233 aa  124  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0719  lipoyl synthase  36.97 
 
 		 535 aa  123  2e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.219683  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4359  lipoate-protein ligase B  38.67 
 
 		 218 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1921  lipoate-protein ligase B  34.5 
 
 		 247 aa  123  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00431373  hitchhiker  0.000603896 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1967  lipoate-protein ligase B  37.2 
 
 		 233 aa  122  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3184  lipoyltransferase  39.32 
 
 		 221 aa  123  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.052426  normal  0.0826899 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1515  lipoate-protein ligase B  34.62 
 
 		 234 aa  122  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4888  lipoate-protein ligase B  36.02 
 
 		 213 aa  122  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368944  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0109  lipoate-protein ligase B  42.22 
 
 		 207 aa  121  8e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20872  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15410  lipoate-protein ligase B  37.37 
 
 		 214 aa  121  9e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2300  lipoate-protein ligase B  39.39 
 
 		 235 aa  121  9e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04288  lipoate-protein ligase B  36.6 
 
 		 224 aa  121  9e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2876  lipoyltransferase  37.31 
 
 		 239 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0609  lipoate-protein ligase B  34.76 
 
 		 228 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3714  lipoate-protein ligase B  35.98 
 
 		 219 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000923711  hitchhiker  0.00434688 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2434  lipoate-protein ligase B  38.1 
 
 		 227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.824182  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2034  lipoate-protein ligase B  35.5 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.21776  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1469  lipoyltransferase  37.95 
 
 		 199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1514  lipoyltransferase  37.95 
 
 		 199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1400  lipoate-protein ligase B  37.44 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3560  lipoate-protein ligase B  38.83 
 
 		 213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  37.31 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0229  lipoate-protein ligase B  36.27 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.970877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0179  lipoate-protein ligase B  38.97 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.799971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0528  lipoate-protein ligase B  39.06 
 
 		 212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.525035 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0927  lipoate-protein ligase B  37.09 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.257939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3491  lipoate-protein ligase B  35.45 
 
 		 219 aa  119  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000205489 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3029  lipoate-protein ligase B  34.02 
 
 		 216 aa  119  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.572663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4082  lipoate-protein ligase B  39.59 
 
 		 262 aa  118  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4819  lipoate-protein ligase B  37.57 
 
 		 218 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2107  lipoate-protein ligase B  38.92 
 
 		 227 aa  118  7.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0992  lipoyltransferase  40.78 
 
 		 236 aa  118  9e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0378956  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2630  lipoate-protein ligase B  36.36 
 
 		 224 aa  118  9e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3366  lipoate-protein ligase B  38.61 
 
 		 213 aa  118  9e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.372416  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13360  lipoate-protein ligase B  35.55 
 
 		 233 aa  117  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16370  lipoate-protein ligase B  37.77 
 
 		 234 aa  117  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0223931  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1480  lipoate-protein ligase B  40.35 
 
 		 252 aa  117  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.357182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1015  lipoate-protein ligase B  38.46 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2842  lipoate-protein ligase B  34.9 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117951  hitchhiker  0.000142913 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2594  lipoate-protein ligase B  34.2 
 
 		 216 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00491142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3326  lipoate-protein ligase B  38.92 
 
 		 213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1775  lipoate-protein ligase B  39.25 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.177218 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>